肺癌相关新候选原癌基因OLC1的功能及应用研究

肺癌相关新候选原癌基因OLC1的功能及应用研究

论文摘要

目的:(1)运用生物信息学手段获取OLC1基因相关信息;(2)运用有限稀释法筛选得到稳定过表达OLC1的H1299(大细胞肺癌)细胞株。为深入研究OLC1在诱导细胞发生癌变中的作用,我们对H1299-OLC1细胞株实施生长速度的测定实验,平板集落形成实验,不同时段细胞周期检测等系列实验,即进行将OLC1作为候选原癌基因的功能研究;(3)以H1299—OLC1为细胞模型,OLC1作为候选药物靶标,筛选1180种药物小分子化合物,初步建立小分子化合物的药物筛选平台。(4)以OLC1为药物靶标,研究4种抗癌药物和新疆阿魏菇提取物对肺癌细胞的影响。方法: (1)通过生物信息学方法,利用在线数据库和分析软件分析、预测OLC1基因的染色体定位、编码氨基酸序列、结构域、同源序列等信息;(2)OLC1稳定株的筛选、鉴定及功能研究:应用有限稀释法筛选H1299-OLC1稳定株;Western Blotting检测OLC1蛋白的表达;新候选原癌基因OLC1的功能研究:MTS细胞增殖实验检测H1299-OLC1细胞、空载体细胞H1299-pcDB、亲本细胞H1299的生长情况;平板集落形成实验测定H1299—OLC1与对照H1299-pcDB的细胞独立生长情况及形成集落数目;采用流式细胞术观察处于对数生长期H1299-OLC1、H1299-pcDB细胞贴壁培养后24小时、48小时、72小时细胞周期变化情况。(3)以OLC1为靶标的1180种候选药物小分子化合物的筛选:采用钙黄绿素为荧光探针,应用荧光比色法,荧光记数仪GENios Pro reader(Tecan)检测。绿色荧光强度值在535nm处检测,激发波长484nm。通过倒置荧光显微镜观察细胞的形态变化;(4)OLC1为靶标的药敏试验:MTS细胞增殖实验检测4种抗癌药物和新疆阿魏菇粗提物对H1299-OLC1细胞增殖的影响。结果:(1)通过生物信息学分析,确定OLC1基因定位于16q22.3,CDS区编码364个氨基酸,无跨膜区,无明显信号肽序列。亚细胞定位为,细胞核:56.5%,细胞质:30.4%,线粒体:13.0%。有两个保守结构域分别为DUF292区(位于33-139氨基酸)和脯氨酸富集区(位于220-278氨基酸)。在许多类型的肿瘤细胞和肿瘤组织中都有分布;(2)稳定表达OLC1的H1299单克隆细胞株均表现出转化细胞的特性:MTS细胞增殖实验显示,H1299-OLC1细胞株生长速度明显快于对照空载体细胞H1299-pcDB(P<0.05);平板集落形成克隆数明显多于空载体稳定株(P<0.05);细胞周期检测显示H1299-OLC1细胞周期变化中G1期细胞所占比例显著高于空载体细胞,而且在24小时到72小时时,增幅大大高于空载体细胞株(P<0.05);(3)建立以钙黄绿素为荧光探针的小分子化合物筛选平台,初筛获取6种候选药物;(4)H1299-OLC1稳定株有较强的抗药性(;5)新疆阿魏菇提取物能有效抑制H1299-OLC1稳定株的增殖。结论:(1)生物信息学分析发现OLC1在多种组织和肿瘤细胞中分布,具有特殊保守域结构及功能位点,提示其可能具有重要功能;(2)利用有限稀释法进行单克隆稳定株的筛选,得到稳定过表达OLC1的H1299单克隆细胞株模型;(3)体外系列试验证明OLC1能使H1299细胞进一步发生恶性转化,提示OLC1具有原癌基因的属性。(4)建立以钙黄绿素为荧光探针,荧光记数仪与显微镜荧光和明场检测相结合的,候选药物小分子化合物针对特定基因作为药物靶标筛选平台;(5)初步筛选发现6种候选药物小分子化合物;(6)OLC1过表达稳定株的耐药性高于对照空载体稳定株;(7)低浓度的新疆地产阿魏菇醇提物(2.5%)能显著抑制H1299-OLC1的增殖,但对H1299-pcDB空载体稳定株却没有明显抑制作用。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 英文缩略词表
  • 前言
  • 1 研究背景
  • 2 肺癌的生物学特性
  • 3 肺癌相关基因研究进展
  • 4 我国肺癌相关基因研究的新进展
  • 5 本课题研究目标
  • 第一部分 人肺癌相关新的候选原癌基因OLC1 的生物信息学分析
  • 1 内容与方法
  • 1.1 生物信息学分析数据库和软件网址
  • 1.2 OLC1 相关生物信息学分析
  • 2 结果与分析
  • 3 讨论
  • 4 小结
  • 第二部分 OLC1 稳定株的筛选、鉴定与功能研究
  • 1 内容与方法
  • 1.1 主要仪器设备与耗材
  • 1.2 主要试剂
  • 1.3 方法
  • 2 结果
  • 3 讨论
  • 4 小结
  • 第三部分 以OLC1为药物靶标的1180种小分子化合物的筛选
  • 1 内容和方法
  • 1.1 材料
  • 1.2 方法
  • 2 结果
  • 3 讨论
  • 4 小结
  • 第四部分 MTS 法以 OLC1 为靶标的药敏试验研究
  • 1 内容与方法
  • 1.1 材料
  • 1.2 方法
  • 2 结果
  • 3 讨论
  • 4 小结
  • 结论
  • 致谢
  • 本研究受下列基金资助
  • 参考文献
  • 综述一 新疆天然可食植物资源的生物活性成分研究及开发利用展望
  • 综述二 肺癌关联基因研究进展
  • 附录 天然食物的功效研究简报
  • 攻读博士学位期间发表的学术论文
  • 个人简历
  • 导师评阅表
  • 相关论文文献

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