分子标记鉴别侧耳属10种食用菌种质资源的研究

论文摘要

侧耳属是一类广为分布的且具有食(药)用价值的木腐生真菌,种类较多,分类较为混乱。近年来,随着科学技术的发展,许多分子生物学的技术已渗入蕈菌的分类和系统发育的研究中。在研究中,我们应用RAPD、ISSR、和SRAP标记对侧耳属内的10个种,共计548个栽培种进行种质资源研究。从三种标记的电泳图谱中选取明亮、重复性好的多态性条带,将其转化成稳定的SCAR标记,以鉴定同一种内不同栽培种间的“同名异物、同物异名”菌种,为我国侧耳属品种登记制度和知识产权保护提供信息。11个阿魏蘑菌株通过5个SCAR标记可分为7类;58个白灵菇菌株通过6个SCAR标记可分为10大类;16个鲍鱼菇菌株通过4个SCAR标记可分为5类;9个凤尾菇菌株通过5个SCAR标记,可分为5大类;16个高温平菇菌株通过4个SCAR标记可分为5大类;31个小平菇菌株通过8个SCAR标记可分成16类;72个杏鲍菇菌株通过3个SCAR标记可分成7类;16个金顶侧耳菌株通过6个SCAR标记可分为7类;36个秀珍菇菌株通过6个SCAR标记可分为15类;通过285个平菇菌株的SRAP、RAPD和ISSR综合分析,并联系所建立的SCAR标记发现:285个菌株中,利用现已完成的20个SCAR标记,得到扩增结果完全一致的31组菌株。

论文目录

• 中文摘要
• Abstract
• 第一章 文献综述
• 第一节 侧耳属概述
• 1 侧耳属的生物学地位及其分类
• 2 侧耳属的经济价值、营养价值和保健功能
• 第二节 侧耳属的分类研究进展
• 1 传统的分类研究
• 2 现代的分类研究
• 第三节 分子标记技术在食用菌研究中的应用
• 1 几种常用的分子标记
• 2 分子标记技术在食用菌研究中的应用
• 第四节 本研究的目的、意义和策略
• 第二章 秀珍菇种质资源分子标记分析及其SCAR标记的建立
• 第一节 材料与方法
• 1 供试菌株
• 2 培养基和试剂
• 3 菌丝培养
• 4 试剂仪器
• 5 CTAB法提取DNA
• 6 RAPD、ISSR、SRAP引物
• 7 PCR扩增反应体系和程序
• 8 DNA检测
• 9 目的片段的回收
• 10 感受态细胞的制备
• 11 与载体的连接
• 12 转化
• 13 阳性克隆的检测（菌落PCR）
• 14 测序分析
• 15 SCAR引物的设计
• 16 SCAR标记的验证
• 17 数据分析
• 第二节 结果和分析
• 1 DNA质量
• 2 秀珍菇种质资源分子标记分析
• 3 SCAR标记的建立
• 4 讨论
• 第三章 凤尾菇种质资源分子标记分析及其SCAR标记的建立
• 第一节 材料与方法
• 1 供试菌株
• 2 培养基和试剂（同第二章）
• 3 菌丝培养（同第二章）
• 4 试剂仪器（同第二章）
• 5 CTAB法提取DNA（同第二章）
• 6 RAPD、ISSR、SRAP引物
• 7 PCR扩增反应体系和程序
• 8 DNA检测（同第二章）
• 9 目的片段的回收（同第二章）
• 10 感受态细胞的制备（同第二章）
• 11 与载体的连接（同第二章）
• 12 转化（同第二章）
• 13 阳性克隆的检测（同第二章）
• 14 测序分析（同第二章）
• 15 SCAR引物的设计（同第二章）
• 16 SCAR标记的验证（同第二章）
• 17 数据分析（同第二章）
• 第二节 结果和分析
• 1 凤尾菇种质资源分子标记分析
• 2 SCAR标记的建立
• 3 讨论
• 第四章 高温平菇种质资源的分子标记分析及其SCAR标记的建立
• 第一节 材料与方法
• 1 供试菌株
• 2 培养基和试剂（同第二章）
• 3 菌丝培养（同第二章）
• 4 试剂仪器（同第二章）
• 5 CTAB法提取DNA
• 6 RAPD、ISSR、SRAP引物
• 7 PCR扩增反应体系和程序
• 8 D NA检测
• 9 目的片段的回收（同第二章）
• 10 感受态细胞的制备（同第二章）
• 11 与载体的连接（同第二章）
• 12 转化（同第二章）
• 13 阳性克隆的检测（同第二章）
• 14 测序分析（同第二章）
• 15 SCAR引物的设计（同第二章）
• 16 SCAR标记的验证（同第二章）
• 17 数据分析（同第二章）
• 第二节 结果分析和讨论
• 1 RAPD、ISSR、SRAP多态性
• 2 RAPD、ISSR、SRAP综合分析
• 3 SCAR标记的建立
• 4 讨论
• 第五章 鲍鱼菇种质资源分子标记分析及其SCAR标记的建立
• 第一节 材料与方法
• 1 供试菌株
• 2 培养基和试剂（同第二章）
• 3 菌丝培养（同第二章）
• 4 试剂仪器（同第二章）
• 5 CTAB法提取DNA
• 6 RAPD、ISSR、SRAP引物
• 7 PCR扩增反应体系和程序
• 8 DNA检测
• 9 目的片段的回收（同第二章）
• 10 感受态细胞的制备（同第二章）
• 11 与载体的连接（同第二章）
• 12 转化（同第二章）
• 13 阳性克隆的检测（同第二章）
• 14 测序分析（同第二章）
• 15 SCAR引物的设计（同第二章）
• 16 SCAR标记的验证（同第二章）
• 17 数据分析（同第二章）
• 第二节 结果和分析
• 1 鲍鱼菇种质资源分子标记分析
• 2 SCAR标记的建立
• 3 讨论
• 第六章 阿魏蘑种质资源分子标记分析及其SCAR标记的建立
• 第一节 材料与方法
• 1 供试菌株
• 2 培养基和试剂（同第二章）
• 3 菌丝培养（同第二章）
• 4 试剂仪器（同第二章）
• 5 CTAB法提取DNA（同第二章）
• 6 RAPD、ISSR、SRAP引物
• 7 PCR扩增反应体系和程序
• 8.DNA检测（同第二章）
• 9.目的片段的回收（同第二章）
• 10.感受态细胞的制备（同第二章）
• 11.与载体的连接（同第二章）
• 12.转化（同第二章）
• 13.阳性克隆的检测（同第二章）
• 14.测序分析（同第二章）
• 15.SCAR引物的设计（同第二章）
• 16.SCAR标记的验证（同第二章）
• 17.数据分析（同第二章）
• 第二节 结果和分析
• 1 阿魏菇种质资源分子标记分析
• 2 SCAR标记的建立
• 3 讨论
• 第七章 小平菇种质资源分子标记分析及其SCAR标记的建立
• 第一节 材料与方法
• 1 供试菌株
• 2 培养基和试剂（同第二章）
• 3 菌丝培养（同第二章）
• 4 试剂仪器（同第二章）
• 5 CTAB法提取DNA（同第二章）
• 6 RAPD、ISSR、SRAF引物
• 7 PCR扩增反应体系和程序
• 8 DNA检测（同第二章）
• 9 目的片段的回收（同第二章）
• 10 感受态细胞的制备（同第二章）
• 11 与载体的连接（同第二章）
• 12 转化（同第二章）
• 13 阳性克隆的检测（同第二章）
• 14 测序分析（同第二章）
• 15 SCAR引物的设计（同第二章）
• 16 SCAR标记的验证（同第二章）
• 17 数据分析（同第二章）
• 第二节 结果和分析
• 1 小平菇种质资源分子标记分析
• 2 SCAR标记的建立
• 3 讨论
• 第八章 杏鲍菇种质资源分子标记分析及其SCAR标记的建立
• 第一节 材料与方法
• 1 供试菌株
• 2 培养基和试剂（同第二章）
• 3 菌丝培养（同第二章）
• 4 试剂仪器（同第二章）
• 5 CTAB法提取DNA（同第二章）
• 6 RAPD、ISSR、SRAP引物
• 7 PCR扩增反应体系和程序
• 8 DNA检测（同第二章）
• 9 目的片段的回收（同第二章）
• 10 感受态细胞的制备（同第二章）
• 11 与载体的连接（同第二章）
• 12 转化（同第二章）
• 13 阳性克隆的检测（同第二章）
• 14 测序分析（同第二章）
• 15 SCAR引物的设计（同第二章）
• 16 SCAR标记的验证（同第二章）
• 17 数据分析（同第二章）
• 第二节 结果和分析
• 1 杏鲍菇种质资源的RAPD分析
• 2 杏鲍菇种质资源的ISSR分析
• 3 杏鲍菇种质资源的SRAP分析
• 4 RAPD,ISSR,SRAP的综合分析
• 5 杏鲍菇种质资源SCAR标记的建立
• 6 讨论
• 第九章 榆黄蘑种质资源分子标记分析及其SCAR标记的建立
• 第一节 材料与方法
• 1 供试菌株
• 2 培养基和试剂（同第二章）
• 3 菌丝培养（同第二章）
• 4 试剂仪器（同第二章）
• 5 CTAB法提取DNA（同第二章）
• 6 RAPD、ISSR、SRAP引物
• 7 PCR扩增反应体系和程序
• 8 DNA检测
• 9 目的片段的回收（同第二章）
• 10 感受态细胞的制备（同第二章）
• 11 与载体的连接（同第二章）
• 12 转化（同第二章）
• 13 阳性克隆的检测（同第二章）
• 14 测序分析（同第二章）
• 15 SCAR引物的设计（同第二章）
• 16 SCAR标记的验证（同第二章）
• 17 数据分析（同第二章）
• 第二节 结果和分析
• 1 ISSR-PCR扩增结果与分析
• 2 RAPD-PCR扩增结果与分析
• 3 SRAP-PCR扩增结果与分析
• 4 ISSR、RAPD、SRAP的综合分析
• 5 榆黄蘑种质资源SCAR标记的建立
• 6 讨论
• 第十章 白灵菇种质资源分子标记分析及其SCAR标记的建立
• 第一节 材料与方法
• 1 供试菌株
• 2 培养基和试剂（同第二章）
• 3 菌丝培养（同第二章）
• 4 试剂仪器（同第二章）
• 5 CTAB法提取DNA（同第二章）
• 6 RAPD、ISSR、SRAP引物
• 7 PCR扩增反应体系和程序
• 8 DNA检测（同第二章）
• 9 目的片段的回收（同第二章）
• 10 感受态细胞的制备（同第二章）
• 11 与载体的连接（同第二章）
• 12 转化（同第二章）
• 13 阳性克隆的检测（同第二章）
• 14 测序分析（同第二章）
• 15 SCAR引物的设计（同第二章）
• 16 SCAR标记的验证（同第二章）
• 17 数据分析（同第二章）
• 第二节 结果和分析
• 1 ISSR多态性
• 2 RAPD多态性
• 3 SRAP多态性
• 4 RAPD、ISSR、SRAP综合分析
• 5 SCAR标记的建立
• 6 讨论
• 第十一章 平菇种质资源分子标记分析及其SCAR标记的建立
• 第一节 材料与方法
• 1 供试菌株
• 2 培养基和试剂（同第二章）
• 3 菌丝培养（同第二章）
• 4 试剂仪器（同第二章）
• 5 CTAB法提取DNA（同第二章）
• 6 RAPD、ISSR、SRAP引物
• 7 PCR扩增反应体系和程序
• 8 DNA检测（同第二章）
• 9 目的片段的回收（同第二章）
• 10 感受态细胞的制备（同第二章）
• 11 与载体的连接（同第二章）
• 12 转化（同第二章）
• 13 阳性克隆的检测（同第二章）
• 14 测序分析（同第二章）
• 15 SCAR引物的设计（同第二章）
• 16 SCAR标记的验证（同第二章）
• 17 数据分析（同第二章）
• 第二节 结果和分析
• 1 RAPD、ISSR、SRAP多态性
• 2 SCAR标记的建立
• 3 讨论
• 第十二章 侧耳属种质资源近缘种种间SCAR初探
• 1 材料与方法
• 2 结果和分析
• 3 讨论
• 第十三章 总结与展望
• 1 总结与分析
• 2 展望
• 参考文献
• 附图
• 致谢