本文主要研究内容
作者申书恒（2019）在《红豆草EST-SSR分子标记开发与遗传多样性分析》一文中研究指出：栽培型红豆草(Onobrychis viciifolia)是一种多年生豆科牧草(2n=4x=28),为严格异花传粉植物,常被用作干草和青贮饲料。红豆草富含蛋白质和单宁等次生代谢产物。但是,于该物种缺乏详细的基因组和转录组信息,使得红豆草的遗传育种研究相对滞后。鉴于此,在本论文利用Illumina Hiseq2500测序平台对红豆草的14个不同组织分别提取RNA,然后等摩尔数混合,进行转录组测序。本研究目的是挖掘红豆草的基因资源,并开发一批多态性高的EST-SSR分子标记,为揭示豆草的遗传多样性提供分子工具。此外,对同一位点红豆草个体的EST-SSR扩增条带进行测序,进一步验证了红豆草的同源四倍特性。主要研究结果如下:1.利用Illumina测序技术,根据红豆草14个不同的组织构建一个混合cDNA文库,过滤后获得数据24,630,711 bp,NCBI数据库登录号为SRX3763386。经组装获得了77,764个unigene,利用技术发现了6,752个EST-SSR。设计了2,469对引物对,用5个野生红豆草种群对随机选取的200对引物进行筛选,最终得到61对高多态性的EST-SSR引物。2.利用上述61对EST-SSR引物对来自5个不同地理位置的40个野生红豆草单株进行遗传多样性分析。结果显示,40个红豆草单株,61个多态性位点共计459个等位基因,位点的等位基因数量从3-12个,平均为7.52个。Ho、He、PIC分别为0.05-1.00(平均值=0.67)、0.55-0.91(平均值=0.77)、0.51-0.88(平均值=0.74)。这61个多态性位点或EST-SSR标记在鉴定的种质中具有高度的普遍性。因此,它们对于研究红豆草的地理分布是有用的。此外,还对不同红豆草个体EST-SSR的PCR扩增子进行了测序,结果表明测序的等位基因与原标记位点同源。3.由于EST-SSR的扩增结果为特异性扩增,而在同一个单株中同时出现了最多四种不同的重复类型,本研究的EST-SSR等位基因测序结果,进一步验证了该物种的同源四倍体的特性。
Abstract
zai pei xing gong dou cao (Onobrychis viciifolia)shi yi chong duo nian sheng dou ke mu cao (2n=4x=28),wei yan ge yi hua chuan fen zhi wu ,chang bei yong zuo gan cao he qing zhu si liao 。gong dou cao fu han dan bai zhi he chan ning deng ci sheng dai xie chan wu 。dan shi ,yu gai wu chong que fa xiang xi de ji yin zu he zhuai lu zu xin xi ,shi de gong dou cao de wei chuan yo chong yan jiu xiang dui zhi hou 。jian yu ci ,zai ben lun wen li yong Illumina Hiseq2500ce xu ping tai dui gong dou cao de 14ge bu tong zu zhi fen bie di qu RNA,ran hou deng ma er shu hun ge ,jin hang zhuai lu zu ce xu 。ben yan jiu mu de shi wa jue gong dou cao de ji yin zi yuan ,bing kai fa yi pi duo tai xing gao de EST-SSRfen zi biao ji ,wei jie shi dou cao de wei chuan duo yang xing di gong fen zi gong ju 。ci wai ,dui tong yi wei dian gong dou cao ge ti de EST-SSRkuo zeng tiao dai jin hang ce xu ,jin yi bu yan zheng le gong dou cao de tong yuan si bei te xing 。zhu yao yan jiu jie guo ru xia :1.li yong Illuminace xu ji shu ,gen ju gong dou cao 14ge bu tong de zu zhi gou jian yi ge hun ge cDNAwen ku ,guo lv hou huo de shu ju 24,630,711 bp,NCBIshu ju ku deng lu hao wei SRX3763386。jing zu zhuang huo de le 77,764ge unigene,li yong ji shu fa xian le 6,752ge EST-SSR。she ji le 2,469dui yin wu dui ,yong 5ge ye sheng gong dou cao chong qun dui sui ji shua qu de 200dui yin wu jin hang shai shua ,zui zhong de dao 61dui gao duo tai xing de EST-SSRyin wu 。2.li yong shang shu 61dui EST-SSRyin wu dui lai zi 5ge bu tong de li wei zhi de 40ge ye sheng gong dou cao chan zhu jin hang wei chuan duo yang xing fen xi 。jie guo xian shi ,40ge gong dou cao chan zhu ,61ge duo tai xing wei dian gong ji 459ge deng wei ji yin ,wei dian de deng wei ji yin shu liang cong 3-12ge ,ping jun wei 7.52ge 。Ho、He、PICfen bie wei 0.05-1.00(ping jun zhi =0.67)、0.55-0.91(ping jun zhi =0.77)、0.51-0.88(ping jun zhi =0.74)。zhe 61ge duo tai xing wei dian huo EST-SSRbiao ji zai jian ding de chong zhi zhong ju you gao du de pu bian xing 。yin ci ,ta men dui yu yan jiu gong dou cao de de li fen bu shi you yong de 。ci wai ,hai dui bu tong gong dou cao ge ti EST-SSRde PCRkuo zeng zi jin hang le ce xu ,jie guo biao ming ce xu de deng wei ji yin yu yuan biao ji wei dian tong yuan 。3.you yu EST-SSRde kuo zeng jie guo wei te yi xing kuo zeng ,er zai tong yi ge chan zhu zhong tong shi chu xian le zui duo si chong bu tong de chong fu lei xing ,ben yan jiu de EST-SSRdeng wei ji yin ce xu jie guo ,jin yi bu yan zheng le gai wu chong de tong yuan si bei ti de te xing 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自兰州大学的申书恒，发表于刊物兰州大学2019-07-29论文，是一篇关于红豆草论文,微卫星标记论文,遗传多样性论文,同源四倍体论文,兰州大学2019-07-29论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自兰州大学2019-07-29论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
标签：红豆草论文; 微卫星标记论文; 遗传多样性论文; 同源四倍体论文; 兰州大学2019-07-29论文;