黄艳岚:Small RNA深度测序鉴定甘薯种质的甘薯曲叶病毒论文

黄艳岚:Small RNA深度测序鉴定甘薯种质的甘薯曲叶病毒论文

本文主要研究内容

作者黄艳岚,张道微,董芳,张超凡,邹学校(2019)在《Small RNA深度测序鉴定甘薯种质的甘薯曲叶病毒》一文中研究指出:本研究利用Small RNA深度测序对长沙、永州、邵阳等地采集的甘薯种质资源病毒症状样品进行鉴定,发现样品中含有与甘薯曲叶病毒同源的系列。设计引物进行PCR扩增,鉴定出24个SPLCV-AC1基因片段序列,经NCBI-Blast比对,与10个不同株系SPLCV同源性达96%以上。为进一步获得SPLCV全长序列,设计背靠背引物,经PCR扩增、鉴定,获得3个SPLCV全长序列。系列进化分析显示,这3个SPLCV分离物聚为同一分支,其中SPLCV (76)序列大小2 774 bp,与甘薯乔治亚曲叶病毒中国分离物、甘薯金脉病毒具有较高同源性;SPLCV (47)序列大小2 777 bp,与甘薯河南曲叶病毒分离物具有较高同源性;SPLCV (68)序列大小2 832 bp,与甘薯广西曲叶病毒分离物具有96%的同源性。以上同源系列与Small RNA测序显示结果相一致。本研究结果为甘薯病毒病防控提供理论依据。

Abstract

ben yan jiu li yong Small RNAshen du ce xu dui chang sha 、yong zhou 、shao yang deng de cai ji de gan shu chong zhi zi yuan bing du zheng zhuang yang pin jin hang jian ding ,fa xian yang pin zhong han you yu gan shu qu xie bing du tong yuan de ji lie 。she ji yin wu jin hang PCRkuo zeng ,jian ding chu 24ge SPLCV-AC1ji yin pian duan xu lie ,jing NCBI-Blastbi dui ,yu 10ge bu tong zhu ji SPLCVtong yuan xing da 96%yi shang 。wei jin yi bu huo de SPLCVquan chang xu lie ,she ji bei kao bei yin wu ,jing PCRkuo zeng 、jian ding ,huo de 3ge SPLCVquan chang xu lie 。ji lie jin hua fen xi xian shi ,zhe 3ge SPLCVfen li wu ju wei tong yi fen zhi ,ji zhong SPLCV (76)xu lie da xiao 2 774 bp,yu gan shu qiao zhi ya qu xie bing du zhong guo fen li wu 、gan shu jin mai bing du ju you jiao gao tong yuan xing ;SPLCV (47)xu lie da xiao 2 777 bp,yu gan shu he na qu xie bing du fen li wu ju you jiao gao tong yuan xing ;SPLCV (68)xu lie da xiao 2 832 bp,yu gan shu an xi qu xie bing du fen li wu ju you 96%de tong yuan xing 。yi shang tong yuan ji lie yu Small RNAce xu xian shi jie guo xiang yi zhi 。ben yan jiu jie guo wei gan shu bing du bing fang kong di gong li lun yi ju 。

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自分子植物育种的黄艳岚,张道微,董芳,张超凡,邹学校,发表于刊物分子植物育种2019年11期论文,是一篇关于深度测序论文,甘薯曲叶病毒论文,双生病毒论文,病毒鉴定论文,分子植物育种2019年11期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自分子植物育种2019年11期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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