85株具有抗菌或细胞毒活性海洋细菌的分类鉴定

85株具有抗菌或细胞毒活性海洋细菌的分类鉴定

论文摘要

本研究通过对85株具有抗菌或抗肿瘤活性细菌的耐盐度的分析,85株细菌均能在≥3%盐浓度培养基中生长,具有一定的盐耐受性,且全都分离自红树林环境,说明它们可定为海洋细菌。对85株海洋细菌采用革兰氏染色和显微观察做表型分类:采用Biolog系统进行碳源利用分析,并结合常规生理生化特征分析;采用16S rDNA序列测定及系统发育分析等,确定其系统分类地位,部分菌株得到种水平的鉴定结果。16株菌鉴定到种。有29株菌鉴定到属水平。有3株菌未鉴定到属。已鉴定的45株海洋细菌归属于9个科,13个属(Bacillus、Micrococcus、Microbacterium、Isoptericola、Arthrobacter、Vibrio、Klebsiella、Pseudomonas、Enterobacterium、Pantoea、Lysobacter、Acinetobacter、Halomonas)。大致分为3个大类群,γ-变形细菌群和革兰氏阳性高G+C mol%菌群和革兰氏阳性低G+C mol%细菌群。Isoptericola、Klebsiella、Pantoea、Lysobacter这4个属未见有分离自海洋环境的产活报道。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 1 前言
  • 1.1 细菌分类鉴定发展
  • 1.1.1 细菌资源
  • 1.1.2 细菌系统发育发展
  • 1.1.2.1 生命三域分类系统
  • 1.1.2.2 细菌分类系统
  • 1.1.3 细菌分类鉴定方法发展
  • 1.1.3.1 常规鉴定法
  • 1.1.3.2 化学分类法
  • 1.1.3.3 数值分类法
  • 1.1.3.4 分子遗传学鉴定法
  • 1.1.3.4.1 质粒图谱分析法
  • 1.1.3.4.2 限制性核酸内切酶分析法
  • 1.1.3.4.3 脉冲场凝胶电泳
  • 1.1.3.4.4 细菌DNA(G+C)mo l%含量测定
  • 1.1.3.4.5 核酸序列分析法
  • 1.1.3.4.6 DNA-D NA分子杂交
  • 1.2 海洋细菌及其产生生物活性物质研究进展
  • 1.2.1 海洋细菌的分类
  • 1.2.2 海洋细菌产生抗菌活性物质
  • 1.2.3 海洋细菌产生抗肿瘤活性物质
  • 1.2.4 展望
  • 1.3 本课题研究目的及意义
  • 2 材料与方法
  • 2.1 实验材料、试剂与仪器设备
  • 2.1.1 培养基
  • 2.1.2 85株具有抗菌和细胞毒活性菌株的来源及活性
  • 2.1.3 本实验所使用主要试剂
  • 2.1.4 仪器与设备
  • 2.2 方法
  • 2.2.1 85株活性细菌的耐盐度实验
  • 2.2.2 85株细菌的形态特征观察
  • 2.2.2.1 85株细菌的固体特征观察
  • 2.2.2.2 85株活性细菌的个体形态特征观察
  • 2.2.3 用BIOLOG微生物鉴定系统对85株细菌的鉴定及对碳源的利用
  • 2.2.3.1 实验原理
  • 2.2.3.2 实验方法
  • 2.2.3.2.1 实验路线选择
  • 2.2.3.2.2 实验步骤
  • 2.2.4 部分细菌的其余生理生化特征测定
  • 2.2.4.1 氧化酶测定
  • 2.2.4.2 过氧化氢酶测定
  • 2.2.4.3 运动性
  • 2.2.4.4 葡萄糖利用实验
  • 2.2.4.5 甲基红实验
  • 2.2.4.6 乙酰甲基甲醇实验
  • 2.2.4.7 淀粉水解实验
  • 2.2.4.8 纤维素水解实验
  • 2.2.4.9 硝酸盐还原实验
  • 2.2.4.10 吲哚实验
  • 2.2.4.11 明胶液化实验
  • 2.2.4.12 厌氧性测定
  • 2.2.5 48株细菌的16S rDNA序列同源性分析
  • 2.2.5.1 细菌总DNA的提取
  • 2.2.5.2 16S rDNA的PCR扩增
  • 2.2.5.3 序列测序
  • 2.2.5.4 序列分析
  • 2.2.6 48株细菌的活性复筛
  • 2.2.6.1 菌种的发酵
  • 2.2.6.2 抗肿瘤细胞毒活性( M T T 法) 检测
  • 2.2.6.3 抗金黄色葡萄球菌与抗白色念珠菌活性检测
  • 3 结果与讨论
  • 3.1 85株细菌的耐盐度实验
  • 3.2 85株细菌的形态特征观察
  • 3.2.1 85株细菌的固体特征观察
  • 3.2.2 85株活性细菌的个体形态特征观察
  • 3.2.3 用BIOLOG微生物鉴定系统对85株细菌的鉴定及对碳源的利用
  • 3.2.3.1 用BIOLOG微生物鉴定系统对85株细菌的鉴定
  • 3.2.3.2 用BIOLOG 微生物鉴定系统测定48 株细菌对碳源的利用
  • 3.2.4 部分菌株其余生理生化特征
  • 3.2.5 48株细菌的16S rDNA序列同源性分析
  • 3.2.5.1 48株细菌的16S rDNA序列比对
  • 3.2.6 48株海洋细菌鉴定结果小结
  • 3.2.7 48株细菌的活性复筛
  • 4 讨论
  • 4.1 产活性物质的海洋细菌种类
  • 4.2 海洋细菌“种”的鉴定
  • 5 结论
  • 参考文献
  • 附录
  • 致谢
  • 相关论文文献

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