吕叶辉:冷冻器官和甲醛固定石蜡包埋组织中RNA的定量表达论文

吕叶辉:冷冻器官和甲醛固定石蜡包埋组织中RNA的定量表达论文

本文主要研究内容

作者吕叶辉,黎世莹,李志宏,陶瑞旸,邵煜,胡茜,杨智昉,陈忆九(2019)在《冻存器官和甲醛固定石蜡包埋组织中RNA的定量表达》一文中研究指出:目的定量分析并对比冻存器官和甲醛固定石蜡包埋(formaldehyde-fixed and paraffin-embedded,FFPE)组织中核糖核酸(ribonucleic acid,RNA)的表达情况。方法选取不同死亡时间人体脑、心肌和肝组织的冻存及FFPE样本,提取并检测RNA质量浓度,运用实时荧光定量反转录聚合酶链反应(reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)技术分析各RNA指标的扩增效率及相对表达量。结果与冻存样本相比,FFPE样本中所提取RNA的质量浓度和完整性相对较低。各RNA指标扩增效率与RNA种类及扩增产物长度有关,其中扩增产物较长的甘油醛-3-磷酸脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)及β-肌动蛋白(β-actin,ACTB)扩增效率不理想,而5S核糖体RNA(5Sribosomal RNA,5S rRNA)扩增效率理想且在各组织中表达稳定,故选为内参指标。较长死亡时间的冻存样本及FFPE样本中扩增产物较长的GAPDH及ACTB表达量下降,而组织特异性微小RNA(microRNA,miRNA)以及扩增产物较短的GAPDH和ACTB在同一组织冻存和FFPE样本中表达具有一致性。结论通过标准化RT-qPCR实验,选取合适的RNA指标及设计合适产物长度的引物,能够准确定量FFPE样本中RNA的表达水平。

Abstract

mu de ding liang fen xi bing dui bi dong cun qi guan he jia quan gu ding dan la bao mai (formaldehyde-fixed and paraffin-embedded,FFPE)zu zhi zhong he tang he suan (ribonucleic acid,RNA)de biao da qing kuang 。fang fa shua qu bu tong si wang shi jian ren ti nao 、xin ji he gan zu zhi de dong cun ji FFPEyang ben ,di qu bing jian ce RNAzhi liang nong du ,yun yong shi shi ying guang ding liang fan zhuai lu ju ge mei lian fan ying (reverse transcription-quantitative polymerase chain reaction,RT-qPCR)ji shu fen xi ge RNAzhi biao de kuo zeng xiao lv ji xiang dui biao da liang 。jie guo yu dong cun yang ben xiang bi ,FFPEyang ben zhong suo di qu RNAde zhi liang nong du he wan zheng xing xiang dui jiao di 。ge RNAzhi biao kuo zeng xiao lv yu RNAchong lei ji kuo zeng chan wu chang du you guan ,ji zhong kuo zeng chan wu jiao chang de gan you quan -3-lin suan tuo qing mei (glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)ji β-ji dong dan bai (β-actin,ACTB)kuo zeng xiao lv bu li xiang ,er 5She tang ti RNA(5Sribosomal RNA,5S rRNA)kuo zeng xiao lv li xiang ju zai ge zu zhi zhong biao da wen ding ,gu shua wei nei can zhi biao 。jiao chang si wang shi jian de dong cun yang ben ji FFPEyang ben zhong kuo zeng chan wu jiao chang de GAPDHji ACTBbiao da liang xia jiang ,er zu zhi te yi xing wei xiao RNA(microRNA,miRNA)yi ji kuo zeng chan wu jiao duan de GAPDHhe ACTBzai tong yi zu zhi dong cun he FFPEyang ben zhong biao da ju you yi zhi xing 。jie lun tong guo biao zhun hua RT-qPCRshi yan ,shua qu ge kuo de RNAzhi biao ji she ji ge kuo chan wu chang du de yin wu ,neng gou zhun que ding liang FFPEyang ben zhong RNAde biao da shui ping 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自法医学杂志的吕叶辉,黎世莹,李志宏,陶瑞旸,邵煜,胡茜,杨智昉,陈忆九,发表于刊物法医学杂志2019年04期论文,是一篇关于法医病理学论文,核糖核酸论文,石蜡包埋论文,冷冻保存论文,反转录聚合酶链反应论文,核糖核酸完整性指数论文,法医学杂志2019年04期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自法医学杂志2019年04期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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