新型拓扑描述符ED_m和ED_m’及QSPR/QSAR研究

新型拓扑描述符ED_m和ED_m’及QSPR/QSAR研究

论文摘要

基于能够合理、有效表征分子结构信息的拓扑指数来进行化合物分子定量结构-性质相关(quantitative structure- property relationships, QSPR),定量结构-活性相关(quantitative structure- activity relationships, QSAR)以及定量结构-谱学性质相关(quantitative structure- spectra relationships, QSSR)研究已经成为一个相当活跃的研究领域,其应用受到了广大化学、生物学、药学等领域科研工作者越来越多的重视。(1)基于离子性指数矩阵、改进的距离矩阵和支化度矩阵建立的新型拓扑指数EDm合理且有效的描述了分子结构信息,并实现了对化合物分子结构的唯一性表征。我们通过新建模型:P=aED1+bED2+cED3+d ( a,b,c,d是常数;P代表化合物分子的性质),研究了EDm指数与部分烷烃、烯烃和炔烃的标准生成焓(△fHm?)、标准熵(Sm?)、摩尔体积(Vm)和摩尔折光度(Rm)等性质之间的关系。模型相关系数介于0.991.00。与其他文献报道的拓扑描述符相比,EDm指数具有多项优势,如具有零简并度和更优秀的回归结果等。我们还通过留一法(LOO)和随机抽样法(RSP)对模型进行检验,模型显示出良好稳健性和预测能力。(2)在由离子性指数矩阵、改进的距离矩阵和支化度矩阵建立的EDm指数的基础上,通过在分子隐氢图中引入健角,用两原子间的几何图形距离代替两顶点之间的键长和提出了新型拓扑描述符EDm?。实现了拓扑指数对烯烃顺反异构体结构的有效区分和唯一性表征。通过QSPR模型:P=aED1?+bED2? +cED3?+d ( a,b,c,d是常数;P代表化合物分子的性质),研究了部分烯烃顺反异构体的沸点(b.p.)、标准生成焓(△fHm?)、摩尔体积(Vm)和摩尔折光度(Rm),模型相关系数介于0.9841.000。检验结果显示模型具有良好稳健性和预测能力。(3)研究发现,R1R2C=O、(RO)2CO、RCO2H、α-卤代乙醛、反式-RONO和R2NNO等系列含X=O键(X=C,N)化合物的红外光谱吸收伸缩振动频率(υ),可以通过由X原子和O原子的离子性指数建立的多元回归模型:P=aINI(O)+b INI(C)+c (a,b,c是常数;P代表化合物分子的性质;INI(O)和INI(X)分别为X原子和O原子的离子性指数)来定量描述。相关系数介于0.9601.000。同时,我们还用此模型对羰基化合物的紫外光谱吸收能(ΔE)进行QSSR研究。结果表明预测值与实验值十分一致。LOO法检验结果进一步证明了模型良好的稳定性和优良的预测能力。

论文目录

  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 第1章 绪论
  • 1.1 定量构效关系研究概述及意义
  • 1.2 定量构效关系研究方法及进展
  • 1.2.1 Hansch 法
  • 1.2.2 Free-Wilson 方法
  • 1.2.3 拓扑指数法
  • 1.3 本文主要工作
  • 第2章 预测数学模型的建立
  • 2.1 多元线性回归方法
  • 2.1.1 模型的建立
  • 2.1.2 模型的评价
  • 2.1.3 模型的检测
  • 2.2 偏最小二乘法
  • 2.3 人工神经网络法
  • m和EDm?的构建'>第3章 拓扑指数EDm和EDm?的构建
  • m 指数的构建'>3.1 EDm指数的构建
  • 3.1.1 构建原理和方法
  • 3.1.2 支化度矩阵
  • 3.1.3 改进的距离矩阵
  • 3.1.4 离子性指数矩阵
  • m 值'>3.1.5 部分分子的EDm
  • m指数的构建'>3.2 EDm指数的构建
  • 3.2.1 构建原理和方法
  • 3.2.2 支化度矩阵
  • 3.2.3 改进的距离矩阵
  • 3.2.4 离子性指数矩阵
  • m'值'>3.2.5 部分烯烃分子的EDm'值
  • m指数在脂肪烃QSPR/QSAR研究中的应用'>第4章 EDm指数在脂肪烃QSPR/QSAR研究中的应用
  • 4.1 模型的建立
  • m 指数与烷烃性质的关系'>4.2 EDm指数与烷烃性质的关系
  • m指数与烯烃和炔烃性质的关系'>4.3 EDm指数与烯烃和炔烃性质的关系
  • m 指数与脂肪烃 lgKow 和 lgS 的关系'>4.4 EDm 指数与脂肪烃 lgKow 和 lgS 的关系
  • m 指数的结构选择性'>4.5 EDm指数的结构选择性
  • 4.6 模型的检验
  • 4.6.1 留一法检验
  • 4.6.2 随机抽样法检验
  • m 对模型的贡献'>4.7 各个不同EDm对模型的贡献
  • m 指数与某些经典拓扑指数结果比较'>4.8 EDm指数与某些经典拓扑指数结果比较
  • 4.9 结论
  • m'指数在烯烃顺反异构体QSPR研究中的应用'>第5章 EDm'指数在烯烃顺反异构体QSPR研究中的应用
  • 5.1 模型的建立
  • m'指数与烯烃顺反异构体性质的关系'>5.2 EDm'指数与烯烃顺反异构体性质的关系
  • 5.3 模型的检验
  • 5.3.1 留一法检验
  • 5.3.2 随机抽样法检验
  • 5.4 各个不同EDm?对模型的贡献
  • 5.5 结论
  • 第6章 离子性指数在化合物QSSR研究中的应用
  • 6.1 模型的建立
  • 6.2 离子性指数与红外光谱伸缩振动频率的关系
  • 6.2.1 离子性指数与红外光谱伸缩振动频率v 的关系
  • 6.2.2 离子性指数与红外光谱伸缩振动频率改变值 Δv 的关系
  • 6.3 离子性指数与紫外光谱吸收能量ΔE的关系
  • 6.4 结论
  • 参考文献
  • 附录:硕士期间科研工作
  • 致谢
  • 相关论文文献

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