人PNRC基因转录调控的研究

人PNRC基因转录调控的研究

论文摘要

富含脯氨酸的核受体辅活化因子(proline-rich nuclear receptor coactivator, PNRC)是最近克隆和鉴定的一种新的核受体辅活化因子,是以类固醇源性生长因子(steridogentic factor 1, SF1)作诱饵,利用酵母双杂交系统从人乳腺cDNA表达文库中筛选得到的。PNRC通过其位于C端的SH3(src homology 3)结合模体发挥核受体辅活化因子作用,能以配体依赖的方式与多种核受体相互作用,还能与孤儿受体SF1和ERRα1以配体非依赖的方式相互作用。PNRC除了作为核受体的辅活化因子外,还通过SH3结合模体调节生长因子/Ras信号通路,竞争性抑制Ras蛋白的激活。PNRC在多种肿瘤组织及细胞中的表达明显低于正常组织和细胞,这提示PNRC的转录抑制与多种肿瘤的发生、发展相关。目前关于PNRC的转录调控机制尚不十分清楚,为了研究PNRC基因的转录调控机制及其转录抑制与多种肿瘤的发生、发展的相关性,我们进行了如下的研究:1.人PNRC基因转录起始位点的确定及启动子的活性分析采用5′端cDNA末端快速扩增法(rapid amplification of cDNA ends, RACE)确定了PNRC转录起始位点的碱基为G,该转录起始位点较报道的PNRC mRNA (NM 006813) 5′端第一个碱基提前了27 bp。通过生物信息学预测软件(http://www.fruitfly.org/ cgi-bin/seqtools/promoter.pl.)对人PNRC基因的5′侧翼区约2100bp的序列进行分析,预测5′侧翼区内具有启动子功能的区域。应用TransFac professional 8.1(http://jupiter.coh.org/ cgi-bin/transfac/bin/start.cgi)软件对该区域进行分析,获得可能的转录因子结合位点。通过构建包含PNRC基因5′上游序列的荧光素酶报告质粒,利用脂质体瞬时转染,检测荧光素酶活性,对PNRC启动子区进行分析,结果显示,启动子活性最小区域位于-123 +27,预测结果表明,在这一区域可能存在着NFY和RFX1转录因子结合位点。2.细胞内、细胞外鉴定NFY和RFX1与PNRC基因启动子活性区域的结合染色质免疫沉淀(chromatin immunoprecipitation assay, ChIP)及电泳迁移率变动实验(electrophoresis mobility shift and supershift assay, EMSA)证明:NFY和RFX1可在细胞内、细胞外与PNRC启动子区域相结合。3.NFY和RFX1对PNRC基因启动子活性的调控NFY和RFX1真核表达质粒与PNRC启动子重组报告基因质粒或与突变报告基因质粒(含转录因子结合位点突变)的共转染实验表明:NFY和RFX1通过与PNRC启动子-123 +27区域结合,抑制PNRC启动子的活性,RT-PCR和Western blot证明:过表达NFY和RFX1可下调HepG2细胞中PNRC的表达。4.乳腺癌细胞中人PNRC基因启动子CpG岛甲基化状态的研究运用“MethPrimer”软件对PNRC启动子区进行分析,预测CpG岛,通过硫化测序PCR (Bisulfite sequencing PCR, BSP),检测PNRC启动子区CpG岛的甲基化状况,结果显示:乳腺癌细胞中PNRC基因启动子区存在CpG岛的甲基化。5.PNRC基因启动子CpG岛去甲基化对PNRC转录的调节将含PNRC启动子序列的报告质粒转染乳腺癌细胞,细胞再经甲基转移酶抑制剂5-氮杂-2’-脱氧胞苷(5-aza-2’-deoxycytidine, 5-Aza-CdR)处理后,检测PNRC基因启动子的活性;RT-PCR、Northern杂交、Western Blot检测乳腺癌细胞经5-Aza-CdR处理后PNRC的表达情况。结果证明:PNRC基因启动子CpG岛去甲基化可增强PNRC启动子活性并上调PNRC的表达。本研究对人PNRC基因5′侧翼区序列进行了一系列缺失分析,确定了启动子的最小活性区域-123 +27,并鉴定了与之相结合的转录因子NFY和RFX1对PNRC启动子的调节作用。此外,我们还从表观遗传学调控方面研究了PNRC基因启动子CpG岛的甲基化状态,发现乳腺癌细胞MCF-7中PNRC基因启动子区存在CpG岛的甲基化,对PNRC基因启动子CpG岛的去甲基化可增强PNRC启动子活性并上调PNRC的表达,进一步证明了PNRC在乳腺癌细胞中的转录抑制与PNRC启动子CpG岛的甲基化相关。本研究结果为阐明PNRC基因自身转录调控机制以及PNRC的转录抑制与肿瘤的相关性奠定了基础。

论文目录

  • 英文缩写一览表
  • 英文摘要
  • 中文摘要
  • 论文正文 人PNRC 基因转录调控的研究
  • 前言
  • 第一部分 人PNRC 基因转录起始位点的确定及启动子的活性分析
  • 材料
  • 方法
  • 结果
  • 讨论
  • 第二部分 细胞内、细胞外鉴定NFY 和RFX1 与人PNRC 基因启动子的结合
  • 材料
  • 方法
  • 结果
  • 讨论
  • 第三部分 NFY 和RFX1 对人PNRC 基因启动子活性的调控
  • 材料
  • 方法
  • 结果
  • 讨论
  • 第四部分 乳腺癌细胞中人PNRC 基因启动子CpG 岛甲基化状态的研究
  • 材料
  • 方法
  • 结果
  • 讨论
  • 第五部分 人PNRC 基因启动子CpG 岛去甲基化对PNRC 转录的调节
  • 材料
  • 方法
  • 结果
  • 讨论
  • 全文总结
  • 致谢
  • 参考文献
  • 文献综述一 核受体辅活化因子的研究进展
  • 参考文献
  • 文献综述二 表观遗传调控与肿瘤
  • 参考文献
  • 附录:常用试剂的配制
  • 攻读博士学位期间发表的论文
  • 英文论著
  • 相关论文文献

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