京海黄鸡Ghrelin基因多态性与生长及屠宰性状的关联分析

京海黄鸡Ghrelin基因多态性与生长及屠宰性状的关联分析

论文摘要

Ghrelin是一种新的促生长激素分泌素受体的配体。在哺乳动物和禽类中它首先在胃和下丘脑内表达,可能具有促进生长激素分泌和食物摄取的功能。本研究以Ghrelin基因的多态性为研究内容,同时对Ghrelin基因的多态位点与京海黄鸡体重及5个体尺性状(体斜长、胸骨长、胸宽、胫长、胫围)和8个屠宰性状(胴体重、半净膛重、全净膛重、胸肌重、腿肌重、心重、肝重、脾重)等相关性进行分析,结果如下:(1)本试验根据鸡Ghrelin基因序列(GenBank登陆号:AY303688)设计的7对引物中P1、P3和P5 3对引物检测到多态。引物P1检测到6种基因型(AA,BB,CC,AB,BC,AC);引物P3检测到3种基因型(DD,EE,DE);而引物P5只检测到2种基因型(FF,FG),基因型GG缺失。(2)测序结果发现引物P1检测到BB基因型在DNA序列73bp处有“TC”2bp缺失,而CC基因型在DNA序列79bp处有“CTAACCTG”8bp缺失;引物P3检测到的多态位点是在DNA序列的546bp处发生了T→A的突变;引物P5检测到在DNA序列第1274bp处发生了T→C的突变。(3)对于引物P1检测到的A,B,C基因频率分别为0.362,0.482,0.156;对于引物P3检测到的D,E等位基因频率分别为:0.808,0.192,这2个基因多态位点都处于Hardy-Weinberg平衡状态;引物P5检测到的F,G等位基因频率分别为0.965,0.035。(4)引物P1基因型与京海黄鸡生长及屠宰性状的最小二乘分析显示该位点与京海黄鸡的胫长、心重、1日龄重、1周龄重和胸宽有显著或极显著的影响(P<0.05 or P<0.01);综合分析可以看出,2bp及8bp的缺失与部分性状之间的相关性在京海黄鸡母鸡中得以验证,可以尝试将该位点用于母鸡辅助选择。(5)引物P3基因型与京海黄鸡生长及屠宰性状的最小二乘分析显示该位点与肝脏重、腿肌率有显著或极显著的影响(P<0.05 or P<0.01)。比较显示:不论公母鸡对于肝脏重基因型DD型显著高于DE型(P<0.05);对于腿肌率均为DE型显著高于DD型(P<0.05)。由此可以看出该位点对于京海黄鸡公母鸡的脏器和肉鸡的腿肌的选择具有很重要的意义。(6)引物P5基因型与京海黄鸡生长及屠宰性状的最小二乘分析结果表明:该位点与生产性能的相关性更强些。无论在京海黄鸡公鸡还是母鸡上,各周龄体重均是FG型高于FF型;且在一些周龄差异显著(P<0.05)。对于屠宰性状从总体上也是FG型优于FF型。从体尺性状看,公鸡的胫长FG型显著大于FF型(P<0.05)。综合可知在这个突变位点上,杂合子个体优于纯合子个体。

论文目录

  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 1 文献综述
  • 1.1 Ghrelin 基因的研究进展
  • 1.1.1 Ghrelin 的发现
  • 1.1.2 Ghrelin 的结构及分布
  • 1.1.3 Ghrelin的受体及分布
  • 1.2 Ghrelin 的功能
  • 1.2.1 刺激垂体前叶释放生长激素
  • 1.2.2 增加食欲及调节能量代谢平衡
  • 1.2.3 促进胃酸分泌、增强胃功能
  • 1.2.4 其他
  • 1.3 本研究的目的和意义
  • 2 材料与方法
  • 2.1 试验材料
  • 2.1.1 试验鸡来源及采样方法
  • 2.1.2 药品和酶及其它试剂
  • 2.1.3 主要仪器设备
  • 2.1.4 分析工具及软件
  • 2.1.5 部分溶液试剂的配置
  • 2.2 试验方法
  • 2.2.1 鸡血液基因组DNA的提取方法
  • 2.2.2 DNA浓度和纯度的检测
  • 2.2.3 引物的设计
  • 2.2.4 最佳PCR条件的建立
  • 2.2.5 PCR-SSCP及PCR-RFLP分析方法
  • 2.2.6 统计分析方法
  • 3 结果与分析
  • 3.1 鸡血DNA 提取结果
  • 3.2 引物P1、P3、P5 的PCR 扩增结果检测
  • 3.3 引物P3 扩增产物的PCR-SSCP 检测结果
  • 3.4 引物P5 扩增产物的PCR-RFLP 检测结果
  • 3.5 测序结果与同源性分析
  • 3.6 Ghrelin基因多态性位点的基因频率和基因型频率及适合性检验
  • 3.6.1 Ghrelin 基因多态位点(引物P1)的基因频率和基因型频率及适合性检验
  • 3.6.2 Ghrelin 基因多态位点(引物P3)的基因频率和基因型频率及适合性检验
  • 3.6.3 Ghrelin 基因多态位点(引物P3)的基因频率和基因型频率及适合性检验
  • 3.7 京海黄鸡Ghrelin 基因不同位点杂合度,纯合度,有效等位基因数和多态信息含量
  • 3.8 Ghrelin基因多态性位点与生长及屠宰性状的关系
  • 3.8.1 Ghrelin 基因多态性位点(引物P1)与生长及屠宰性状的关系
  • 3.8.2 Ghrelin 基因多态性位点(引物P3)与生长及屠宰性状的关系
  • 3.8.3 Ghrelin 基因多态性位点(引物P5)与生长及屠宰性状的关系
  • 4 讨论
  • 4.1 试验方法
  • 4.2 测序结果的分析
  • 4.3 Ghrelin基因的遗传学分析
  • 4.4 Ghrelin 基因多态位点与生长及屠宰性状的关系的分析
  • 4.4.1 引物P1 扩增片段不同基因型与京海黄鸡生长及屠宰性状的关系
  • 4.4.2 引物P3 扩增片段不同基因型与京海黄鸡生长及屠宰性状的关系
  • 4.4.3 引物 P5 扩增片段不同基因型与京海黄鸡生长及屠宰性状的关系
  • 5 结论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 硕士期间参与发表学术论文目录
  • 相关论文文献

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