导读:本文包含了基因剪接论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:消癌平,肝癌,转录组测序,差异剪接基因
基因剪接论文文献综述
魏柏,杨盛力,占静,陈景叁[1]（2019）在《消癌平对肝癌细胞HepG2差异表达基因及可变剪接的影响》一文中研究指出目的通过RNA-seq分析消癌平作用前后肝癌细胞HepG2的差异表达基因(differentially expressed genes, DEG)及可变剪接(alternative splicing, AS)。方法本研究以HepG2细胞作为对照组,以质量浓度为40 mg/L消癌平作用24 h后的肝癌细胞为实验组,利用Illumina HiSeq平台对实验组和对照组进行分析,使用PossionDis方法进行DEG检测,使用rMATS软件检测不同样品间的AS和差异剪接基因(differentially spliced genes, DSG),并利用基因本体(gene ontology, GO)对其功能进行分类及富集分析。结果与对照组比较,消癌平作用后共得到DEG 608个,其中上调基因147个,下调基因461个。对照组发生AS 21 387个,消癌平使HepG2 AS减少到19 265个,且两组均以外显子(SE)跳跃最多而内含子(RI)保留最少为主。对差异表达的AS行GO富集分析,提示其中生物过程相关的22个,细胞成分相关13个,分子功能相关的有8个。结论消癌平诱导HepG2产生的大量DEG及AS在抑制肝癌生长增殖过程中发挥作用。(本文来源于《胃肠病学和肝病学杂志》期刊2019年11期）
章学东,王欢欢,葛莹,宋丹丹,张雷[2]（2019）在《鸡G蛋白α亚基基因可变剪接体的克隆和组织表达》一文中研究指出为深入研究鸡G蛋白α亚基(G-protein alpha subunit, GNAS)基因的转录剪接情况,采用5'和3'cDNA末端快速扩增(rapid-amplification cDNA ends, RACE)技术,对鸡GNAS基因进行克隆测序;并采用定量聚合酶链式反应(polymerase chain reaction, PCR)技术,检测鸡皮肤、胸肌、心、脑、肝、肺和腹脂等7种组织中GNAS基因剪接体的表达量。结果表明:鸡GNAS基因存在1 554和1 796 bp 2种转录剪接体,均含12个外显子,二者仅第1外显子的长度和位置不同,其余第2-12外显子相同。克隆子1(1 554 bp)编码417个氨基酸,克隆子2(1 796 bp)编码379个氨基酸。在NCBI数据库中进行蛋白比对发现,克隆子2的氨基酸序列与已知的人和小鼠的GNAS基因Gαs亚基同源相似度达93%,而克隆子1的氨基酸序列与XLαs亚基的同源性较高(相似度87%)。表达量检测表明,2种转录剪接体在7种组织中均有不同程度的表达,其中:在脑组织中的表达量最高,与其他组织间差异极显着(P<0.01),在皮肤组织中的表达量(P<0.01或P<0.05)次之;而在肺、胸肌、肝、心、腹脂等组织中的表达量较低。(本文来源于《浙江大学学报(农业与生命科学版)》期刊2019年05期）
王海丞,章燕[3]（2019）在《根尖周囊肿囊壁成纤维样细胞中纤维粘连蛋白基因可变剪接片对诱导破骨细胞形成》一文中研究指出目的:分析在根尖周囊肿囊壁内,纤维粘连蛋白(Fibronectin,FN)的基因可变剪接在破骨细胞形成过程中扮演的角色。材料和方法:采用IST-9和CD34抗体,对根尖周囊肿组织中FN异构体EDA+FN和新生血管腔做免疫组织化学染色,分析染色强度、血管密度与囊肿放射透光区的相关关系。进一步分离培养新鲜手术标本中囊壁成纤维细胞,取条件培养基诱导(本文来源于《2019第九次全国口腔生物医学学术年会论文汇编》期刊2019-10-11）
熊焰,汪奇柏[4]（2019）在《丝氨酸和富含精氨酸剪接因子1基因通过调控翻译过程影响神经胶质瘤U87细胞的增殖》一文中研究指出目的:探讨丝氨酸和富含精氨酸剪接因子1(SRSF1)基因对神经胶质瘤U87细胞增殖和细胞周期的影响及其作用机制。方法:采用基因沉默技术抑制SRSF1基因表达,获得2种不同靶点的SRSF1稳定沉默细胞系(shSRSF1-1组和shSRSF1-2组)。用CCK-8法检测SRSF1沉默对神经胶质瘤U87细胞的增殖活性,流式细胞技术检测SRSF1沉默对U87细胞周期的影响,qPCR和WB实验检测SRSF1沉默对细胞分裂相关基因(CEP70和SMC4)m RNA和蛋白表达水平的影响,用WB实验检测SRSF1沉默对翻译起始蛋白4E-BP1磷酸化的影响。结果:shSRSF1-1组和shSRSF1-2组U87细胞中SRSF1蛋白表达均明显低于对照组(P<0.01),shSRSF1-1组和shSRSF1-2组U87细胞增殖能力被显着抑制(P<0.01),并且处在G2期的细胞数量明显高于对照组(P<0.01)。与对照组比较,shSRSF1-1组和shSRSF1-2组细胞中细胞分裂相关基因CEP70和SMC4 mRNA水平无明显差异(P>0.05),但是蛋白表达水平明显降低(P<0.01)。shSRSF1-1组和shSRSF1-2组U87细胞中翻译起始蛋白4E-BP1磷酸化程度要明显低于对照组(P<0.01)。结论:沉默SRSF1基因通过降低翻译起始蛋白4E-BP1磷酸化水平抑制细胞分裂相关基因CEP70和SMC4的翻译过程,最终使细胞阻滞在G2期,进而减弱神经胶质瘤U87细胞的增殖能力。(本文来源于《中国肿瘤生物治疗杂志》期刊2019年09期）
李晓亚,单保恩,赵连梅[5]（2019）在《基因可变剪接在癌症发生和治疗中的研究进展》一文中研究指出可变剪接指从单个基因产生多种mRNA同种型,是转录后调控的重要方式之一。可变剪接不仅影响人体正常生长发育过程,而且在包括癌症在内的多种疾病发生发展中扮演重要角色。癌组织的剪接变化通常是全局的而不是基因特异性的,异常的剪接模式控制癌症的主要特征。遗传、表观遗传、剪接因子网络差异表达及选择性转录起始或终止等多种途径巩固了特定促癌或抑癌同种型的优势表达,进而影响癌症进程。此外,近年来研究,证明呈组织或阶段特异性表达的剪接同种型有作为癌症生物标志物及治疗靶标的潜能。本文通过全局剪接变化影响肿瘤进展、可变剪接影响癌症进展的途径及可变剪接提示癌症监控和治疗新策略3个方面进行综述。(本文来源于《中国肿瘤生物治疗杂志》期刊2019年09期）
邢永强,何泽学,刘国庆,蔡禄[6]（2019）在《拟南芥不同组织基因表达及可变剪接差异分析》一文中研究指出可变剪接是转录后重要的基因表达调控方式,也是转录组和蛋白质组多样性的重要来源.近年来随着拟南芥、水稻、玉米等植物转录组测序的完成,研究人员发现植物pre-m RNA可变剪接的发生与组织分化、发育等生物学过程密切相关.本工作基于GEO数据库的RNA-seq数据,使用高通量测序数据分析常用的Trimmomatic、Salmon、DESeq2、SUPPA2等工具,识别了拟南芥的种子、根、叶、花、花梗、节间、长角果共7种组织的表达基因和可变剪接事件,以及7种组织间的差异表达基因和差异可变剪接事件,并以叶和花为例展示了相应的生物学功能分析.该工作系统地研究了拟南芥基因表达和可变剪接发生的组织特异性,有助于进一步阐明植物基因组的基因表达调控机制.(本文来源于《生物化学与生物物理进展》期刊2019年11期）
邹志明,邹海霞,张焕,李绍波,王鑫[7]（2019）在《水稻OsHDT703基因的可变剪接体分析》一文中研究指出为了克隆水稻HD2蛋白基因OsHDT703,并分析其存在的可变剪接体。利用生物信息学分析,结合RT-PCR、TA克隆和测序等方法,鉴定1个水稻中全新的HD2蛋白成员(OsHDT703)。结构域分析发现,在其N端含有HD2家族的NPL保守结构域。选取来源于7个物种的16个HD2蛋白,构建蛋白进化树,结果发现,OsHDT703蛋白与OsHDT702蛋白处于同一分支; OsHDT701则处于另一分支,说明水稻中HD2家族蛋白可能存在功能分化。根据预测的不同剪接体设计4对特异性引物,以粳稻中花11叶片和幼穗c DNA为模板,利用RT-PCR扩增,结合TA克隆,通过测序比对,成功鉴定到4种不同可变剪接体序列。由于3号(OsHDT703. 3)和4号(OsHDT703. 4)剪接体的CDS序列完全相同,所以证明OsHDT703至少存在4种不同可变剪接体。综上所述,鉴定到水稻中1个全新的HD2蛋白,命名为OsHDT703,并且鉴定出至少4种存在可变剪接体,为后续深入研究该基因生物学功能奠定基础。(本文来源于《华北农学报》期刊2019年04期）
黄玲,赖佳,韦树谷,代顺冬,李琼英[8]（2019）在《石刁柏两性花与雄花的抗氧化酶活性及其相关基因可变剪接的差异分析》一文中研究指出石刁柏(Asparagus officinalis),别名芦笋,其两性株是培育石刁柏全雄品种的重要资源材料。为探明引起石刁柏两性花与雄花之间性别差异的原因,首先测定了两性花与雄花性别分化前期、中期、后期叁个时期花蕾的过氧化物酶(POD)、过氧化氢酶(CAT)和超氧化物歧化酶(SOD)的活性,同时采用转录组测序(RNA-seq)技术,分析了两性花与雄花叁个不同发育时期花蕾中抗氧化酶基因的可变剪接及表达量的差异。结果发现,抗氧化酶活性与两性花、雄花的发育关系密切。在性别分化前期,两性花蕾中POD和SOD的活性均低于雄花蕾,CAT活性略高于雄花蕾,但在性别分化的中、后期,两性花蕾中POD和SOD的活性均高于雄花蕾,其中POD活性分别高出雄花蕾1.1和2.4倍, CAT活性略低于雄花蕾。通过RNA-seq及基因功能分类(GO)分析,表明其中有35个抗氧化活性相关基因只在两性花蕾中发生可变剪接,并且在石刁柏花器官性别分化前、中期,这35个抗氧化活性相关基因中分别有62.9%和65.7%的基因表达量高于雄花蕾。以上两方面的变化可能同时引起了石刁柏两性花蕾中抗氧化酶活性的升高。由此说明,抗氧化酶活性及相关基因的可变剪接与石刁柏两性花、雄花的发育紧密相关。(本文来源于《植物生理学报》期刊2019年08期）
连群,许珊珊,李伶俐,张丰丰[9]（2019）在《TRIM37基因新剪接位点突变致Mulibrey侏儒症1例报告》一文中研究指出目的探讨Mulibrey侏儒症的临床及基因突变特点。方法回顾分析1例经基因检测确诊Mulibrey侏儒症患儿的临床资料、基因检测及家系验证结果。结果男性患儿,12岁5个月,有身材矮小、皮肤牛奶咖啡斑、叁角形脸、牙齿不齐、肝肿大,合并缩窄性心包炎。二代测序检测分析发现患儿17号染色体TRIM37基因存在一个未报道的剪接区纯合变异位点IVS13-1G>C,分别来自于父母;患儿同胞弟弟未检出该变异;参考ACMG遗传变异分类标准与指南,判定为致病性变异。结论发现1例TRIM37基因剪接位点突变导致的Mulibrey侏儒症,但尚需RNA或蛋白质功能分析确认。(本文来源于《临床儿科杂志》期刊2019年08期）
黄玲,李琼英,韦树谷,赖佳,代顺冬[10]（2019）在《芦笋两性花与雄花中发生可变剪接基因的差异分析》一文中研究指出可变剪接在植物生长发育过程中起着非常重要的作用,它能使同一个mRNA前体生成多种不同的异构体和产生蛋白质多样性。利用RNA-seq测序技术分析芦笋两性花蕾与雄花蕾性别分化前期、中期、后期的可变剪接,从中发掘与两性花及雄花形成密切相关的特有可变剪接。研究结果显示,在所有试验材料中基因可变剪接均以3′端可变剪切位点(3S)和外显子跳跃(ES)类型为主。GO分析表明,两性花与雄花在3个时期均发生可变剪接的基因主要富集于代谢过程、生物合成以及物质结合相关GO条目中。通过GO和KEGG分析发现,两性花特有的可变剪接基因主要富集到代谢途径、核糖体蛋白等含氮化合物的生物合成代谢、过氧化物酶体、氧化磷酸化途径等,其中含氮化合物的生物合成代谢过程和过氧化物酶等抗氧化活性可能与两性花雌蕊的发育相关。雄花蕾特有的可变剪接基因主要富集到代谢途径、次生代谢产物的生物合成和脂肪酸生物合成等脂质代谢过程,其中脂肪酸生物合成等脂质代谢过程可能与雄花中雌蕊发育有关。(本文来源于《园艺学报》期刊2019年08期）
基因剪接论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
为深入研究鸡G蛋白α亚基(G-protein alpha subunit, GNAS)基因的转录剪接情况,采用5'和3'cDNA末端快速扩增(rapid-amplification cDNA ends, RACE)技术,对鸡GNAS基因进行克隆测序;并采用定量聚合酶链式反应(polymerase chain reaction, PCR)技术,检测鸡皮肤、胸肌、心、脑、肝、肺和腹脂等7种组织中GNAS基因剪接体的表达量。结果表明:鸡GNAS基因存在1 554和1 796 bp 2种转录剪接体,均含12个外显子,二者仅第1外显子的长度和位置不同,其余第2-12外显子相同。克隆子1(1 554 bp)编码417个氨基酸,克隆子2(1 796 bp)编码379个氨基酸。在NCBI数据库中进行蛋白比对发现,克隆子2的氨基酸序列与已知的人和小鼠的GNAS基因Gαs亚基同源相似度达93%,而克隆子1的氨基酸序列与XLαs亚基的同源性较高(相似度87%)。表达量检测表明,2种转录剪接体在7种组织中均有不同程度的表达,其中:在脑组织中的表达量最高,与其他组织间差异极显着(P<0.01),在皮肤组织中的表达量(P<0.01或P<0.05)次之;而在肺、胸肌、肝、心、腹脂等组织中的表达量较低。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
基因剪接论文参考文献
[1].魏柏,杨盛力,占静,陈景叁.消癌平对肝癌细胞HepG2差异表达基因及可变剪接的影响[J].胃肠病学和肝病学杂志.2019
[2].章学东,王欢欢,葛莹,宋丹丹,张雷.鸡G蛋白α亚基基因可变剪接体的克隆和组织表达[J].浙江大学学报(农业与生命科学版).2019
[3].王海丞,章燕.根尖周囊肿囊壁成纤维样细胞中纤维粘连蛋白基因可变剪接片对诱导破骨细胞形成[C].2019第九次全国口腔生物医学学术年会论文汇编.2019
[4].熊焰,汪奇柏.丝氨酸和富含精氨酸剪接因子1基因通过调控翻译过程影响神经胶质瘤U87细胞的增殖[J].中国肿瘤生物治疗杂志.2019
[5].李晓亚,单保恩,赵连梅.基因可变剪接在癌症发生和治疗中的研究进展[J].中国肿瘤生物治疗杂志.2019
[6].邢永强,何泽学,刘国庆,蔡禄.拟南芥不同组织基因表达及可变剪接差异分析[J].生物化学与生物物理进展.2019
[7].邹志明,邹海霞,张焕,李绍波,王鑫.水稻OsHDT703基因的可变剪接体分析[J].华北农学报.2019
[8].黄玲,赖佳,韦树谷,代顺冬,李琼英.石刁柏两性花与雄花的抗氧化酶活性及其相关基因可变剪接的差异分析[J].植物生理学报.2019
[9].连群,许珊珊,李伶俐,张丰丰.TRIM37基因新剪接位点突变致Mulibrey侏儒症1例报告[J].临床儿科杂志.2019
[10].黄玲,李琼英,韦树谷,赖佳,代顺冬.芦笋两性花与雄花中发生可变剪接基因的差异分析[J].园艺学报.2019