论文题目: 南江黄羊生长性状的分子标记研究
论文类型: 博士论文
论文专业: 动物遗传育种与繁殖
作者: 张恩平
导师: 袁志发,陈玉林
关键词: 南江黄羊,生长性状,分子标记
文献来源: 西北农林科技大学
发表年度: 2005
论文摘要: 本研究旨在运用RAPD、微卫星和候选基因SNP分子标记技术,对102只南江黄羊基因组DNA进行标记分析,研究影响南江黄羊生长性状的QTL遗传标记,建立分了标记数据分析统计数学模型,分析标记与生长性能之间的相关关系,为南江黄羊的选种选育提供分子遗传学依据,同时也为其它家畜分子标记研究提供统计学处理方法。论文研究结果如下: 1.RAPD标记与体尺体性状的相关分析 (1) 从10条随机引物中筛选出多态性良好的4条引物,对102只南江黄羊组基因DNA进行RAPD分析,共扩增出明显清晰的标记条带33条,其中多态性条带21条,多态频率58.86%。每个引物扩增条带数在7～9条之间,扩增片断长度在180～2000bp之间,条带分布均匀,分离良好。说明所选引物适于对南江黄羊基因组进行RAPD多态性分析。 (2) RAPD标记分析结果表明,与体重性状显著相关的标记有:A05引物扩增多态条带B和BF条带组合;F09引物扩增多态条带C、F及CF组合;CY0817引物扩增多态条带A和条带F;CY0818引物扩增多态条带A和条带F。上述标记中,A05引物扩增标记条带B、BF组合及F09引物扩增标记条带CF对体重和体尺性状均有显著影响,其它标记条带对体重性状作用显著,但对体尺性状影响不显著。 (3) 各标记条带替代效应对体重性状的贡献率在6.72%～19.26%之间,其中A05-B的替代效应贡献率最高,为19.26%,F09-CF次之,为13.53%,CY0817-A和CY0818-A最低,为6.72%。各标记条带替代效应对体尺性状的贡献率在1.14%～5.81%之间,部分标记与体尺性状呈负相关,但差异不显著。 2.微卫星标记与体重性状的相关分析 (1) 对南江黄羊群体10微卫星位点的遗传参数分析结果表明,微卫星位点的等位基因数在4～16之间,平均等位基因数为8.1个;有效等位基因数在3.84～11.47之间,平均有效等位基因数为6.14个;多态信息含量在0.4611～0.7738之间,平均值为0.5934;微卫星位点杂合度在0.7397～0.9128之间,平均值为0.8203。在10个微卫星位点中,INRA063位点等位基因数最少,为4个;BM1227位点等位基因数最多,为16个。南江黄羊群体含有丰富的微卫星多态信息,适合于微卫星标记分析。 (2) 建立了微卫星与性状间的相关系数的统计学模型,该模型在r_j显著的情况下有以下结论:若r_j>0,说明所研究的性状与该标记的出现与否呈正相关,相关系数越大,说明性状与标记的一致性越强,可用该标记作为所研究性状的辅助选择标记;若r_j<0,说明所研究的性状与
论文目录:
摘要
ABSTRACT
第一部分 文献综述
第一章 分子标记与动物遗传育种研究进展
1.1 动物遗传育种技术发展概述
1.2 DNA标记在动物育种中的应用价值
1.3 分子标记技术的原理和方法
1.3.1 随机扩增多态性 DNA标记技术
1.3.2 微卫星标记技术
1.3.3 SNP标记
第二章 分子标记与南江黄羊育种
2.1 南江黄羊的品种特性
2.2 南江黄羊在发展肉羊产业中的地位与作用
2.3 南江黄羊的发展前景
2.4 分子标记与南江黄羊育种
第二部分 试验研究
引言
1 材料与方法
1.1 材料
1.1.1 样品的采集
1.1.2 资料收集
1.1.3 试剂与溶液配制
1.2 实验主要仪器与设备
1.3 实验方法
1.3.1 采样方法
1.3.2 全血基因组的提取
1.3.3 基因组 DNA的RAPD分析
1.3.4 基因组 DNA的微卫星标记分析
1.3.5 候选基因的SNP分析
2. 结果与分析
2.1 南江黄羊基因组 RAPD分析
2.1.1 南江黄羊体重及体尺性状表型值变异
2.1.2 南江黄羊基因组 RAPD扩增多态性分析
2.1.3 RAPD标记与体尺体重性状的相关分析
2.2 南江黄羊群体的微卫星检测与分析
2.2.1 微卫星位点扩增产物的琼脂糖凝胶电泳
2.2.2 微卫星位点扩增结果的 PAGE检测
2.2.3 微卫星位点标记与南江黄羊体重性状的相关分析
2.2.4 应用微卫星标记估计南江黄羊群体近交系数的研究
2.3 与生长性状相关的部分候选基因的SNP标记分析
2.3.1 南江黄羊生长激素基因5’端区与exonl及部分intronl序列的PCR-RFLP检测及序列测定分析
2.3.2 南江黄羊 GH基因5’端区基因多型性与体尺体重性状的相关分析
2.3.3 南江黄羊 GHR基因5’端区启动子 P1的PCR-RFLP检测及序列测定分析
2.3.4 南江黄羊 GHR基因5' 端区启动子 P1基因多态性(型)与体尺体重性状的相关分析
2.3.5 胰岛素样生长因子-1外元4及部分编码序列 SNP检测分析
2.4 三种不同分子标记方法在南江黄羊群体中标记一致度的研究
2.4.1 不同微卫星标记选择的标记一致度
2.4.2 RAPD、微卫星和候选基因SNP三种不同分子标记方法选择的一致度
3. 讨论
3.1 南江黄羊生长性能分子标记方法的几点讨论
3.1.1 关于 RAPD扩增效果的分析
3.1.2 关于微卫星标记效果的讨论
3.1.3 关于 SNP标记的讨论
3.2 关于分子标记的有效性和不同方法标记一致度
3.3 关于对目标性状标记的候选基因的确定
3.4 关于南江黄羊分子标记采样群体和采样方法对标记结果的影响
3.5 关于候选基因标记位点多态性的问题
4. 结论
4.1 RAPD标记与体尺体重性状的相关分析
4.2 微卫星标记与体重性状的相关分析
4.3 与生长性状相关的部分候选基因的SNP标记分析
4.4 不同分子标记方法在南江黄羊群体中标记一致度的研究
4.5 关于标记与采样方法
参考文献
致谢
附件
作者简介
发布时间: 2007-04-06
参考文献
- [1].抑制素对山羊繁殖力的影响[D]. 赵中权.西南大学2011
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