本文主要研究内容
作者王鹏洋,曲姗姗,梁源,付泽元(2019)在《水稻WRKY转录因子家族的生物信息学分析》一文中研究指出:[目的]对水稻WRKY转录因子家族成员进行生物信息学分析,为进一步研究水稻WRKY转录因子的功能提供依据。[方法]从NCBI网站下载水稻全基因组序列,利用CDD、Blast、MEME、MEGA、ProtParam等在线工具或本地软件筛选WRKY家族成员,对所得WRKY家族成员的理化性质、系统进化亲缘关系、保守元件等项目进行生物信息学分析。[结果]共从水稻基因组中鉴定筛选出65个WRKY家族成员,每一个成员中都具有WRKYGQK的保守元件,除此之外还有一个保守锌指结构的元件存在。利用MEGA对所得WRKY家族成员进行聚类发现,65个WRKY家族成员可以分为A、B、C、D、E 5类,其中A、B、C、D 4类的亲缘关系较近,可以聚为一类;而A类相对亲缘关系较远,认为A类成员可能是长期进化过程中被保留下来的较为原始的一类。[结论]该研究较系统地鉴定了水稻WRKY家族,为进一步研究水稻WRKY转录因子功能和互作关系提供参考。
Abstract
[mu de ]dui shui dao WRKYzhuai lu yin zi jia zu cheng yuan jin hang sheng wu xin xi xue fen xi ,wei jin yi bu yan jiu shui dao WRKYzhuai lu yin zi de gong neng di gong yi ju 。[fang fa ]cong NCBIwang zhan xia zai shui dao quan ji yin zu xu lie ,li yong CDD、Blast、MEME、MEGA、ProtParamdeng zai xian gong ju huo ben de ruan jian shai shua WRKYjia zu cheng yuan ,dui suo de WRKYjia zu cheng yuan de li hua xing zhi 、ji tong jin hua qin yuan guan ji 、bao shou yuan jian deng xiang mu jin hang sheng wu xin xi xue fen xi 。[jie guo ]gong cong shui dao ji yin zu zhong jian ding shai shua chu 65ge WRKYjia zu cheng yuan ,mei yi ge cheng yuan zhong dou ju you WRKYGQKde bao shou yuan jian ,chu ci zhi wai hai you yi ge bao shou xin zhi jie gou de yuan jian cun zai 。li yong MEGAdui suo de WRKYjia zu cheng yuan jin hang ju lei fa xian ,65ge WRKYjia zu cheng yuan ke yi fen wei A、B、C、D、E 5lei ,ji zhong A、B、C、D 4lei de qin yuan guan ji jiao jin ,ke yi ju wei yi lei ;er Alei xiang dui qin yuan guan ji jiao yuan ,ren wei Alei cheng yuan ke neng shi chang ji jin hua guo cheng zhong bei bao liu xia lai de jiao wei yuan shi de yi lei 。[jie lun ]gai yan jiu jiao ji tong de jian ding le shui dao WRKYjia zu ,wei jin yi bu yan jiu shui dao WRKYzhuai lu yin zi gong neng he hu zuo guan ji di gong can kao 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自安徽农业科学的王鹏洋,曲姗姗,梁源,付泽元,发表于刊物安徽农业科学2019年12期论文,是一篇关于水稻论文,转录因子论文,生物信息学论文,系统进化树论文,安徽农业科学2019年12期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自安徽农业科学2019年12期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。
标签:水稻论文; 转录因子论文; 生物信息学论文; 系统进化树论文; 安徽农业科学2019年12期论文;