胃癌基因芯片差异表达基因的验证和筛选

论文题目: 胃癌基因芯片差异表达基因的验证和筛选

论文类型: 博士论文

论文专业: 老年消化

作者: 黄海力

导师: 王孟薇

关键词: 胃癌,组织芯片,原位杂交,免疫组织化学,预后

文献来源: 中国人民解放军军医进修学院

发表年度: 2005

论文摘要: 背景:胃癌的发病率和死亡率很高,目前缺乏有效的诊治手段。基因芯片是全面了解胃癌的发生发展机制,筛选生物学标志物的重要手段,但要从中筛选出有价值的指标需要多方面的验证分析。目的:从基因芯片中筛选有价值的差异表达基因。方法: 1、挑选8个基因芯片实验中显示的胃癌差异表达基因,加S100蛋白家族中S100A2,S100A4,AKR1C2共11个基因,用RT-PCR和REAL-TIME PCR方法分析这11个感兴趣基因在22例新鲜胃癌组织及对应的正常胃黏膜组织的差异表达。 2、构建包含208例1020个组织点有预后资料胃癌患者的组织芯片,每一例患者组织均进行配对设计。 3、用免疫组化方法检测了S100A2,S100A4,S100A6蛋白在胃癌芯片中的表达,构建正义以及反义FAM3B基因的CRNA探针,用原位杂交方法检测了它在胃癌芯片中的表达。分析上述基因与胃癌临床病理指标以及预后的相关性。 4、构建S100A2干扰载体,通过瞬时转染,RT-PCR和WESTERN检测筛选了S100A2基因的有效干扰序列。结果: 1、RT-PCR和REAL-TIME PCR验证的8个基因中,与基因芯片结果一致的基因有5个,它们是:S100A6,IGFBP4,AKR1C2,FAM3B,SAFB1,CKBB。吻合率为62.5%。以BETA-MICROGLOBIN为内标,用REAL-TIME PCR定量分析了S100A2,S100A4,S100A6基因表达,他们在胃癌中表达升高的比率分别为80%,55%,74%。表达升高的倍数分别为:10.78,2.31,2.25倍。它们相对于β2-microglobulin表达丰度分别为2.83E-04,6.44E-02,0.41。 2、成功构建了胃癌转移以及预后组织芯片,共1020点,组织点有效率为98%。 3、免疫组化显示,正常胃黏膜,癌灶,淋巴结转移灶S100A2,S100A4,

论文目录:

中文摘要

英文摘要

前言

第一部分 RT-PCR以及Real-Time RT-PCR验证胃癌基因芯片中差异表达基因

1．材料

2．方法

3．结果

4．讨论

5．参考文献

第二部分 S100A2，S100A4，S100A6，FAM3B基因在胃癌中的原位表达分析

1．材料

2．方法

3．结果

4．讨论

5．参考文献

第三部分 S100A2原位杂交探针的制备及RANi有效位点筛选

1．材料

2．方法

3．结果

4．讨论

5．参考文献

小结

附图及照片

文献综述

攻读学位期间发表文章情况

致谢

个人简历

发布时间: 2005-07-15

参考文献

[1].肺癌相关新基因CT120A/B的功能研究[D]. 潘东宁.复旦大学2005
[2].CAGE基因在颅脑肿瘤中的表达及其机制的研究[D]. 高飞.中国医科大学2006
[3].应用基因芯片技术筛选胰腺癌放射耐受相关基因[D]. 吴斌.中国协和医科大学2006
[4].食管癌表达降调基因的研究[D]. 陈宝生.中国协和医科大学2002
[5].用mRNA差异显示方法初步分离小鼠乳癌MA891细胞转移相关基因[D]. 张权庚.中国协和医科大学1996
[6].食管上皮癌变不同时期差异表达基因与基因表达概况的分析[D]. 周津.中国协和医科大学2000
[7].人食管癌表达下调基因的克隆及其结构分析[D]. 许智雄.中国协和医科大学1999
[8].Ad5E1A蛋白的表达、抗癌作用和相关新基因片段的筛选及在克服DXR中的功能研究[D]. 马业伟.中国协和医科大学2003
[9].食管癌与EMP-1基因的功能研究[D]. 王海涛.中国协和医科大学2002
[10].食管癌遗传易感性分子基础的探讨[D]. 王亮.中国协和医科大学1995

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