山羊DQA1、DQB1、DQA2基因外显子2多态性及与线虫抗性、免疫性状的相关研究

山羊DQA1、DQB1、DQA2基因外显子2多态性及与线虫抗性、免疫性状的相关研究

论文摘要

主要组织相容性复合物(MHC)是一群紧密连锁高度多态的基因,编码主要组织相容性抗原,在脊椎动物机体的免疫系统中具有重要作用,因此MHC常作为家畜抗病育种的候选基因。本研究采用PCR-SSCP、PCR-RFLP技术对莱芜黑山羊、波尔山羊、鲁波杂交山羊3个山羊种群共175只个体的DQA1、DQA2、DQB1基因外显子2进行了遗传多态性分析,并对DQB1、DQA2基因多态性与线虫抗性、免疫性状的相关性进行了研究,其结果如下:1.采用PCR-SSCP技术对DQA1基因外显子2多态性进行了分析,共检测到8种基因型,并对其纯合子进行了测序,检测到23处碱基突变。2.对人类、山羊、绵羊、牛DQA1基因外显子2核苷酸序列进行同源性比较,结果发现同源性很高。3.采用PCR-RFLP技术对莱芜黑山羊、鲁波杂交山羊和波尔山羊DQA2、DQB1基因外显子2进行多态性分析,共检测到4种DQA2基因外显子2基因型,7种DQB1基因外显子2基因型。通过酶切图谱和测序分析表明,DQA2基因外显子2的第77、79、80和169位的碱基表现出多态性,DQB1基因外显子2的第24、151位的碱基表现出多态性。4.应用SAS 8.0软件GLM程序对DQA2、DQB1基因不同基因型与线虫抗性进行了相关分析,在DQA2基因中,基因型与线虫EPG有一定的相关性,但没有达到显著水平(P>0.05)。在DQB1基因中,BC、DD基因型的线虫EPG显著低于BB基因型(P<0.05),在种群内的分析中发现,鲁波杂交山羊中,BC基因型的线虫EPG显著低于AC基因型(P<0.05)。其它基因型与线虫EPG也有一定的相关性,但没有达到显著水平(P>0.05)。5.应用SAS 8.0软件GLM程序对DQA2、DQB1基因不同基因型与免疫性状进行了相关分析,在DQA2基因中,莱芜黑山羊中AB基因型的RBC低于BB、BC基因型(P>0.05),而MCH高于BB、BC基因型,但没有达到显著水平(P>0.05);BC基因型的W-LCR高于AB、BB基因型(P>0.05),而W-SCC低于AB、BB基因型,但没有达到显著水平(P>0.05)。鲁波杂交山羊中AB基因型的RBC显著高于BB基因型(P<0.05),高于BC基因型(P>0.05);AB基因型的WBC显著高于BC基因型(P<0.05),高于BB基因型(P>0.05);AB基因型的HCT显著高于BB、BC基因型(P<0.05);BC基因型的W-LCR显著高于BB基因型(P<0.05),高于AB基因型(P>0.05)。在DQB1基因中,莱芜黑山羊中BC基因型的W-SCR显著高于AC、CC基因型(P<0.05),W-LCR显著低于CC基因型(P<0.05),W-LCC低于AC、CC基因型,但差异不显著(P>0.05);波尔山羊中BC基因型的W-LCC低于AA、AB基因型,但差异不显著(P>0.05);鲁波杂交山羊中BC、AC基因型的W-LCC显著低于AA基因型(P<0.05)。

论文目录

  • 英文缩略词
  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 1 引言
  • 1.1 遗传因素对动物感染寄生虫的影响
  • 1.2 关于山羊消化道线虫病
  • 1.3 MHC 及与家畜抗病性的相关性研究
  • 1.4 绵羊和山羊MHC 的研究进展
  • 1.5 本研究的目的与意义
  • 2 材料与方法
  • 2.1 实验材料
  • 2.2 主要仪器设备
  • 2.3 工具酶及主要试剂
  • 2.4 缓冲液及主要试剂配制
  • 2.5 实验方法
  • 2.5.1 虫卵漂浮法、三期幼虫培养及分离法、粪检虫卵计数法
  • 2.5.2 基因组DNA 的提取、纯化DNA 基因组、DNA 样品浓度测定
  • 2.5.3 山羊DQA1 基因的PCR-SSCP 分析
  • 2.5.4 山羊DQB1、DQA2 基因的PCR-RFLP 分析
  • 2.5.5 山羊DQA1、DQB1、DQA2 基因的克隆测序与分析
  • 2.6 数据统计分析
  • 2.6.1 基因频率和基因型频率的计算
  • 2.6.2 基因和基因型频率的差异显著性检验
  • 2.6.3 群体Hardy-Weinberg 平衡状态的检测
  • 2.6.4 基因杂合度、有效等位基因数以及多态信息含量的计算
  • 2.6.5 DQA2、DQB1 基因多态性与线虫抗性、免疫性状的相关分析
  • 3 结果与分析
  • 3.1 山羊全血中基因组DNA 的提取
  • 3.2 山羊DQA1 基因遗传多态性分析
  • 3.3 山羊DQA2、DQB1 基因遗传多态性分析
  • 3.4 山羊DQA2、DQB1 基因多态性与线虫抗性的相关分析
  • 3.5 山羊DQA2、DQB1 基因多态性与免疫性状的相关分析
  • 4 讨论
  • 4.1 PCR-SSCP 与PCR-RFLP 分析
  • 4.2 关于粪检虫卵实验结果的分析
  • 4.3 关于MHC-DQA1、DQA2、DQB1 基因多态性
  • 4.4 Hardy-Weinberg 平衡状态分析
  • 4.5 关于DQA2、DQB1 基因多态性与线虫抗性的关系分析
  • 4.6 关于DQA2、DQB1 基因多态性与免疫性状的关系分析
  • 5 结论
  • 主要参考文献
  • 附录
  • 致谢
  • 作者简介
  • 相关论文文献

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    • [2].人类白细胞抗原DQA1基因多态性与尘肺病发病相关性分析[J]. 中国职业医学 2014(02)
    • [3].贵州山羊品种DQA1基因第3外显子遗传变异分析[J]. 生物技术 2014(04)
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    • [6].中医体质和HBV感染结局的关联及其与人类白细胞抗原-DQA1基因多态性的关系[J]. 中国中西医结合杂志 2010(02)
    • [7].自行构建人类白细胞抗原DQA1位点基因分型寡核苷酸芯片性能评价:100例样本与PCR-SSP法的比较[J]. 中国组织工程研究与临床康复 2010(44)
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    • [9].豫籍汉人AIH-Ⅰ型和AIH-Ⅰ型-PBC重叠综合征在HLA-DRB1和DQA1基因的遗传易感性[J]. 山东医药 2010(01)
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