中国高原型细毛羊种质特性研究——微卫星DNA标记分析

论文题目: 中国高原型细毛羊种质特性研究——微卫星DNA标记分析

论文类型: 博士论文

论文专业: 动物遗传育种与繁殖

作者: 罗玉柱

导师: 赵有璋

关键词: 微卫星标记,基因多样性,遗传距离,系统发育,主成分分析,种质特性,青海细毛羊,甘肃高山细毛羊

文献来源: 甘肃农业大学

发表年度: 2005

论文摘要: 生物的种质应该指该物种的全套遗传物质,即其基因组。每个物种都有其种质特征,从而使得一种生物有别于另一种生物。甘肃高山细毛羊和青海细毛羊是中国育成的高原型细毛羊品种,它们都繁育在海拔3000 m左右的地区,已成为当地农牧民的重要经济收入来源之一。为了阐明高原型细毛羊的部分分子遗传标记特征,阐述高原型细毛羊品种间的遗传相关和遗传差异,为国内外评价细毛羊品种种质特征和遗传多样性提供基础数据,选择甘肃高山细毛羊和青海细毛羊作为研究对象,选择藏羊、滩羊、湖羊、小尾寒羊、岷县黑裘皮羊5个国内绵羊品种共7个群体及国外引进品种无角陶赛特羊和特克赛尔羊2个品种为比较研究对象,共11个群体采集血样432份,运用15个微卫星座位,对绵羊群体的微卫星DNA标记开展研究。实验数据采用相关的软件通过计算机处理。结果如下:(1)11个绵羊群体的15个微卫星座位共发现201个等位基因,青海细毛羊和甘肃高山细毛羊群体中的等位基因数均为128个。每个微卫星座位上都有占有优势的等位基因,且对于不同群体在相同座位上的优势基因是不同的,如青海细毛羊和甘肃高山细毛羊在HSC座位上的优势基因分别是281 bp(频率为23.86%)和279 bp(频率为21.59%);在ILSTS005座位上的优势基因均为196 bp(频率分别为34.44%和51.11%)。在15个微卫星座位上,在甘肃高山细毛羊和青海细毛羊群体中所发现的等位基因平均数相同,均为8.53个。(2)在11个绵羊群体中,2个引进绵羊品种的遗传多样性相对于中国9个绵羊群体较低。青海细毛羊和甘肃高山细毛羊的观察杂合度分别为0.7465和0.7435,期望杂合度分别为0.7577和0.7565。(3)在准确性检验、杂合子缺失检验和杂合子增加检验中,分别有25个、

论文目录:

插图目次

附表目次

摘要

SUMMARY

1 文献综述

1.1 种质与种质资源

1.1.1 种质学说

1.1.2 种质

1.1.3 种质概念的应用——种质资源和遗传资源

1.1.3.1 有关作物方面的应用

1.1.3.2 有关畜禽方面的应用

1.1.3.3 关于种质资源评价与利用

1.1.3.4 关于种质资源的机构及信息网

1.2 中国细毛羊繁育与种质

1.2.1 新疆的细毛羊繁育和生产

1.2.1.1 细毛羊育种场及基础设施

1.2.1.2 细毛羊群体结构与育种方案

1.2.1.3 细毛羊育种体系

1.2.1.4 细毛羊生产与技术推广体系

1.2.1.5 细毛羊营养研究

1.2.1.6 细羊毛生产

1.2.1.7 细毛羊育种和生产建议

1.2.2 甘肃的细毛羊选育和生产

1.2.2.1 甘肃高山细毛羊种质特性

1.2.2.2 甘肃高山细毛羊选育与生产建议

1.2.3 青海细毛羊选育

1.2.4 细毛羊种质特性研究

1.3 微卫星DNA 标记

1.3.1 形态学方法

1.3.2 蛋白质多态技术

1.3.3 分子遗传标记技术

1.3.3.1 限制性内切酶酶切片段长度多态标记

1.3.3.2 随机引物扩增多态标记

1.3.3.3 扩增片段长度多态标记

1.3.3.4 小卫星DNA 标记

1.3.3.5 微卫星标记

2 选题依据和意义

3 试验材料和方法

3.1 血样制备

3.2 实验室体系建立

3.2.1 DNA 提取

3.2.2 引物设计

3.2.3 PCR 体系的建立

3.2.4 胶液的配制及灌胶

3.2.5 Marker 的配制及点样

3.3 数据分析

3.3.1 原始数据的获得

3.3.2 微卫星数据处理

4 结果与分析

4.1 等位基因的变异

4.1.1 等位基因数变异

4.1.2 等位基因频率变异

4.1.3 等位基因平均数变异

4.2 基因多样性（杂合性）分析

4.3 哈代——温伯格比率的偏差

4.4 系统发育分析

4.4.1 遗传距离估计

4.4.2 系统发育树的构建

4.5 主成分分析

4.6 群体遗传结构的推导

5 讨论

5.1 绵羊群体内遗传多样性

5.2 绵羊群体间的遗传关系

5.3 小结

6 结论

参考文献

致谢

作者简介

导师简介

发布时间: 2007-03-12

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