SCIRR69对BDNF的转录调节及功能研究

SCIRR69对BDNF的转录调节及功能研究

论文摘要

前期工作证实Scirr69(spinal cord injury regeneration related gene No.69)是具有转录激活活性的新基因(GenBank accession #AY546001),该基因编码蛋白(521aa)结构特点与CREB/ATF转录因子家族成员高度相似。本研究是对上述工作的继续和深入。染色质免疫沉淀(Chromatin immunoprecipitation,ChIP)结合PCR方法发现原代神经细胞内SCIRR69能与BDNF(Brain-Derived Neurotrophic Factor)promoterⅡ特异性结合。同样条件却未检测出SCIRR69与Bip及BDNF其它启动子形成复合物。相对荧光素酶活性检测进一步确认了SCIRR69与BDNF promoterⅡ之间的相互作用,排除SCIRR69与BDNF其它promoter之间的结合。通过比较SCIRR69全长及各C端缺失突变体与BDNF promoterⅡ相互作用后起始报告基因表达情况,发现SCIRR69(△379-521)突变体对BDNF promoterⅡ的转录激活作用最强。PC12细胞过表达SCIRR69后经55mM KCl作用BDNF出现明显高调。当siRNA沉默SCIRR69基因后,BDNF表达也呈现相应下调。明确SCIRR69作为BDNF转录激活子通过KCl调节BDNF表达。利用重叠延伸PCR方法对BDNF promoterⅡ进行系列缺失突变。比较各突变体相对荧光素酶活性确定BDNF promoterⅡ上SCIRR69反应元件(SCIRR69-responsive element,SRE)为5’-GCACTTCA-3’。将包含SRE的56bp序列作为探针,并进行5’端生物素标记后与表达SCIRR69的细胞核提取物反应,EMSA结果显示,SCIRR69经55mM KCl作用后入核的活性形式能与探针中SRE位点特异性结合,进一步证实BDNF promoterⅡ中的SCIRR69反应元件为5’-GCACTTCA-3’。过表达SCIRR69全长(FL)及不同C末端截短型突变体,比较PC12细胞BDNF表达情况,发现SCIRR69 C末端截短型突变体均能促进BDNF表达上调,尤以SCIRR69(△379-521)突变体作用明显,该结果证实了前述的各C末端截短型突变体相对荧光素活性结果,说明SCIRR69(△379-521)可能为SCIRR69从内质网切割后入核发挥转录激活作用的活性形式。收集表达SCIRR69(△379-521)突变体的PC12细胞培养液上清对皮层组织块进行条件培养,具有比BDNF(12.5ng/ml)更为强大的促神经再生功能。N端融合表达Flag tag SCIRR69经rabbit anti-Fiag IP,mouse anti-SCIRR69Western blotting。结果显示除80KD及分子量略小于80KD条带外,还存在两条约50KD和52KD条带。当表达SCIRR69细胞经蛋白酶S1P抑制剂AEBSF作用后,52KD条带消失,说明SCIRR69能被蛋白酶S1P识别并切割。通过突变分析确定RNLL(427aa~430aa)为S1P在SCIRR69上的识别位点,Glutamine(396)为蛋白酶S2P识别位点。EMSA证实经S2P切割后释出的SCIRR69 N端片段是入核发挥转录激活作用的活性形式。

论文目录

  • 缩略词表
  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 前言
  • 参考文献
  • 第一部分 蛋白酶对SCIRR69切割机制研究
  • 实验材料
  • 实验方法
  • 实验结果
  • 小结
  • 讨论
  • 参考文献
  • 第二部分 SCIRR69与BDNF promoter Ⅱ作用调节BDNF表达
  • 第一节 SCIRR69与BDNF promoter Ⅱ相互作用
  • 实验材料
  • 实验方法
  • 实验结果
  • 小结
  • 第二节 SCIRR69表达变化对BDNF转录水平的影响
  • 实验材料
  • 实验方法
  • 实验结果
  • 小结
  • 第三节 SCIRR69 C端缺失突变体与BDNF promoter作用比较
  • 实验材料
  • 实验方法
  • 实验结果
  • 小结
  • 讨论
  • 参考文献
  • 第三部分 确定BDNF promoter Ⅱ上SCIRR69反应元件
  • 第一节 SCIRR69反应性元件在BDNF promoter Ⅱ上定位
  • 实验材料
  • 实验方法
  • 实验结果
  • 小结
  • 第二节 SCIRR69与SCIRR69反应元件相互作用
  • 实验材料
  • 实验方法
  • 实验结果
  • 小结
  • 讨论
  • 参考文献
  • 第四部分 突变体SCIRR69(△379-521)体外促神经再生研究
  • 实验材料
  • 实验方法
  • 实验结果
  • 小结
  • 讨论
  • 参考文献
  • 结论
  • 一、实验结果
  • 二、下一步工作计划
  • 附录 主要仪器设备和常用试剂的配制
  • 本课题英文文章手稿
  • 个人简历
  • 致谢
  • 相关论文文献

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