贵州周边地区主要山羊品种mtDNA Cyt b基因遗传多样性研究

贵州周边地区主要山羊品种mtDNA Cyt b基因遗传多样性研究

论文摘要

本研究选择了线粒体DNA中的细胞色素b基因全序列,对贵州周边地区6个山羊品种72个个体细胞色素b基因进行PCR扩增、测序、分析,我们得到如下结论:1.贵州周边地区六个山羊品种72个个体mtDNA Cyt b基因全序列长度均为1140bp,都是以起始密码子ATG开始,中间没有插入/缺失,以终止密码子AGA结束。A+T平均含量58.7%,G+C平均含量为41.3%。2.贵州周边地区六个山羊品种72个个体mtDNA Cyt b基因单倍型有18种,共产生了30个多态位点,其中两碱基的单一多态位点17个,两碱基间变异的简约信息位点为13个;在30个碱基替换位点上,观察到74次非同义突变,66次发生在密码子的第一位,2次发生在密码子的第二位,6次在密码子的第一位和第二位都发生了突变。3.六个山羊品种单倍型多样度为0.505-0.808,核苷酸多样度为0.025%~0.246%,均处在中等偏上的水平,表明中国山羊品种遗传多样性丰富。4.根据mtDNA Cyt b基因18种单倍型的系统发育分析,观察到三个支系,即支系A、支系B和支系C,出现的频率分别为:支系A93.06%(67/72)、支系B5.55%(4/72)和支系C1.39%(1/72),表明六个山羊品种(群体)中绝大部分个体起源于1个母系即支系A。5.通过六个山羊品种线粒体DNA细胞色素b基因的系统起源分析,表明六个山羊品种均起源于西南亚的胃石山羊(Capra aegagrus)。6.本研究发现不同品种间的的亲缘关系与品种地城分布有密切的联系,地理间隔越近亲缘关系就越近,反之则越远。

论文目录

  • 目录
  • 摘要
  • Summary
  • 前言
  • 第一部分 文献综述
  • 一、山羊的起源及我国山羊种质资源概况
  • 1.1 山羊的起源
  • 1.2 中国山羊的种质资源
  • 1.3 山羊地方品种遗传资源保护的原则
  • 1.4 本研究选用的山羊品种简介
  • 二、山羊遗传多样性研究及研究方法概况
  • 2.1 遗传多样性的概念
  • 2.2 山羊遗传多样性的研究概况
  • 2.3 遗传多样性研究的分子遗传学方法
  • 2.4 家养动物遗传多样性研究的意义
  • 三、线粒体DNA在家畜遗传多样性研究中的应用
  • 3.1 家畜mtDNA的基本特征
  • 3.2 线粒体DNA与家畜的系统发育研究
  • 3.3 mtDNA多态性研究的应用
  • 3.4 线粒体DNA上的细胞色素b的研究概况
  • 第二部分 实验研究
  • 一、研究目的和意义
  • 二、材料与方法
  • 三、数据处理
  • 四、山羊mtDNA Cyt b基因的遗传多样性
  • 五、六个品种山羊单倍型间的系统发育分析
  • 六、六个山羊品种间的亲缘关系分析
  • 七、六个山羊品种的系统起源分析
  • 八、讨论
  • 结论
  • 致谢
  • 参考文献
  • 作者简介
  • 相关论文文献

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