中国汉族女性乳腺癌易感位点的筛选及常见危险因素的Meta分析

论文摘要

研究背景和目的：乳腺癌是女性最常见的恶性肿瘤之一。尽管中国相对西方国家属于低发地区,但近几年来的流行病资料显示,随着工业化的发展以及人们生活方式的改变,乳腺癌总的发病率在提高且发病年龄呈年轻化趋势。2005年统计结果显示,乳腺癌在城市地区女性肿瘤发病率中位居第一,为49.25/100,000。如果按照当前的趋势,预计到2021年,中国妇女乳腺癌的发病率将达到85.3/100,000。因此乳腺癌已成为我国肿瘤计划制定和实施重点之一。这种趋势使得我们有必要在妇女人群中开展针对乳腺癌危险因素的评估,建立适合中国女性的乳腺癌风险评估模型,筛选出高危人群从而进行个体化预防指导,最终实现一级预防,降低乳腺癌发病率。乳腺癌的发生发展是一个多因素多步骤相互作用的复杂过程。与乳腺癌发病相关的危险因素根据其来源可以分为内源性和外源性两大类。内源性的因素主要包括机体的免疫状态、遗传背景、激素水平等,其中个体之间遗传背景的差异可以在一定程度上解释了为什么相同致癌环境下并不是所有妇女都会患乳腺癌,即每个个体的肿瘤易感性是不一样的。与肿瘤易感性密切相关的基因称为易感基因。到目前为止,除了早期发现的与乳腺癌高度相关的易感基因—BRCA1/2外,近年来还发现了其它一些与乳腺癌相关的易感基因,如HER-2/neu、CyclinDl、COX、FGFR-2等。单核苷酸多态性（Single nucleotidepolymorphism, SNP）则是易感基因引起肿瘤易感性的表现方式之一。它是继限制性片段长度多态性（Restriction Fragment Length Polymorphism, RFLP）、DNA单链构象多态性（Single-Strand Conformation Polymorphism, SSCP）之后出现的第三代遗传标记,主要是指在基因组水平上由单个核苷酸变异（包括转换、颠倒、缺失、插入）所引起的DNA序列多态性,在基因组中的分布密度高,大约每隔300-1000个碱基就出现一次。大量研究发现SNP是疾病易感性、药物敏感性等生物性状（表型）差异的重要遗传学基础,因此SNP的相关研究将会为疾病的诊断、预防和治疗等个体化医疗发展提供重要数据基础和理论依据。外源性因素主要来自外界环境,与自然环境和生活方式密切相关：如饮食、生活环境、个体口服避孕药史等。针对上述这些乳腺癌危险因素,在发病率相对较高的西方国家,例如美国,已在1989年就建立了Gail模型,随后各种风险评估模型陆续被开发,如BRCAPRO模型、Claus模型、Tyrer-Cuzick模型、BOADICE模型等。另外为了更好的普及,这些国家还推出了在线风险评估模型。同属于乳腺癌低发病率的国家一韩国、日本也有了适合本国人群的乳腺癌风险评估模型。此外,乳腺癌易感SNP数据也逐渐开始运用到乳腺癌风险预测过程中。毫无疑问的是,通过风险评估模型来筛选高危人群能够更好的进行普查。从经济层次考虑,这样也利于资源的合理利用。在我国,随着乳腺癌发病率不断上升,建立符合我国女性发病特点的乳腺癌风险评估模型,从而筛选出高危人群,有针对性的给予预防性建议是十分必要的,也是未来乳腺癌预防个体化的趋势。目前我国尚处于摸索阶段,相关危险因素（包括乳腺癌易感性SNP）的研究相对较少,相关的数据也较少,目前还没有合适的乳腺癌风险评估模型。本研究通过综合分析两部分数据：一部分是在中国汉族女性人群中验证到目前为止由全基因组关联分析或大量样本分析中得到的SNP位点数据；另一部分是通过Meta分析方法评估国内近十年有关乳腺癌危险因素的相关研究得到的数据。为下一步乳腺癌风险评估模型的初步建立奠定良好的数据基础。方法：第一章乳腺癌易感SNP位点的筛选1.研究对象的收集根据病例对照研究设计,收集国内乳腺癌病例及正常女性对照全血标本及相应临床资料。2.待验证乳腺癌易感SNP位点的挑选从乳腺癌全基因组关联分析或其它大量样本分析得到的阳性SNP位点和SNP信息数据库初步挑选出可能的易感SNP位点。3.中国汉族女性人群乳腺癌易感SNP位点的筛选利用Sequenom MassARRAY-iPLEX平台对筛选出的位点进行检测,检测结果经整理及SPSS13.0软件进行相关统计分析,筛选出与乳腺癌发病风险相关的易感SNP位点。第二章中国女性乳腺癌危险因素的Meta分析1.文献的收集筛选按照一定的检索策略和筛选原则收集2000年至2010年为止报道的有关中国乳腺癌危险因素研究的文献。2.文献数据提取整理分析从经过初步筛选的文献中提取相关数据并整理,利用Stata11.0软件进行Meta分析并计算相应的合并OR值。结果：第一章乳腺癌易感SNP位点的检测共挑选出待验证的乳腺癌易感SNP位点31个,经过检测及相关统计分析发现,有3个位点在中国汉族女性人群中无多态性,分别是：1) rs999737,基本为CC基因；2)rs10995190,基本为GG基因型；2)rs7895676,基本为CT基因型。有6个位点有统计学意义并与乳腺癌发病风险相关,分别是：1)rs2046210,符合显性遗传模型,与CC基因型相比,携带等位基因T的CT-TT基因型为危险基因型,其OR值（95%CI）为1.602（1.206-2.127）,P=0.001；2)rs3757318,符合显性遗传模型,与AA基因型相比,携带等位基因G的AG-GG基因型为危险基因型,其OR值（95%CI）为3.082（2.273-4.181）,P<0.0001；3)rs2981579,符合显性遗传模型,与CC基因型相比,携带等位基因T的CT-TT基因型为危险基因型,其OR值（95%CI）为1.374（1.017-1.855）,P=0.038；4)rs16886165,符合隐性遗传模型,与TT-TG基因型相比,GG基因型为危险基因型,其OR值（95%CI）为1.573（1.069-2.315）,P=0.022；5)rs4784227,符合显性遗传模型,与CC基因型相比,携带等位基因T的CT-TT基因型为危险基因型,其OR值（95%CI）为1.519（1.160-1.990）,P=0.002；6)rs8051542,符合显性遗传模型,与CC基因型相比,携带等位基因T的CT-TT基因型为危险基因型,其OR值（95%CI）为1.352（1.015-1.800）,P=0.039。累积风险计算结果显示：与携带2个危险基因型相比,携带3个、4个、5个及以上的危险基因型的OR值及95%C1分别为1.933（1.322-2.862,P=0.001）、1.881（1.244-2.846,P=0.003）、3.313（2.094-5.242,P<0.0001）。第二章中国女性乳腺癌危险因素的Meta分析纳入用于Meta分析的研究共27篇。针对8个到目前为止比较公认的乳腺癌危险因素进行Meta分析,发现有统计学意义并与乳腺癌发病相关的危险因素有6个,分别是：1)初潮年龄≤13岁,合并OR值为1.461,95%CI为1.254-1.730；2)有乳腺癌家族史,合并后OR值为2.252,95%CI为1.792-2.829；3)无哺乳史,合并后OR值为1.440,95%CI为1.182-1.756；4)绝经年龄≥50岁,合并后OR值为1.272,95%CI为1.075-1.506；5)有良性乳腺病史,合并后OR值为2.404,95%CI为1.636-3.533；6)首次生育年龄≥30岁,合并后OR值为1.420,95%CI为1.291-1.562。与乳腺癌发病风险无统计学意义的危险因素有2个,分别是：1)有口服避孕药史,合并OR值为1.038,95%CI为0.881-1.224；2)生育次数≤2,合并后OR值为0.924,95%CI为0.693-1.234。结论：1.本研究共挑选出的31个可能易感SNP位点,经过在中国汉族女性人群检测和统计分析,初步筛选出6个有统计学意义,可能与中国汉族女性乳腺癌发病风险相关易感SNP位点（rs2046210、rs2981579、rs16886165、rs3757318、rs4784227、rs8051542）。并发现随着个体携带危险基因型个数的增加,患乳腺癌的危险性也呈现增加的趋势。2.在乳腺癌常见危险因素的Meta分析中,与乳腺癌发病风险相关的危险因素中有6个有统计学意义：初潮年龄≤13岁、有乳腺癌家族史、无哺乳史、绝经年龄≥50岁、有良性乳腺病史、首次生育年龄≥30岁。另外两个危险因素：口服避孕药和生育次数≤个没有出现统计学意义。这些数据为下一步乳腺癌风险评估模型的初步建立奠定了良好的数据基础和理论依据。

论文目录

• 摘要
• ABSTRACT
• 前言
• 一、乳腺癌的流行病学情况
• 二、乳腺癌发病危险因素研究进展
• 三、乳腺癌危险因素在风险评估模型中的应用
• 四、SNP检测技术的发展
• 五、本研究的目的及意义
• 第一章 乳腺癌易感SNP位点的筛选
• 1.1 材料与方法
• 1.2 结果
• 1.3 讨论
• 1.4 小结
• 第二章 中国女性乳腺癌常见危险因素Meta分析
• 1.1 材料与方法
• 1.2 结果
• 1.3 讨论
• 1.4 小结
• 参考文献
• 附录
• 英文缩略词
• 硕士论文发表情况
• 致谢
• 统计学证明