利用非遗传信息和微卫星多态性分析小尾寒羊种群生存力

论文摘要

小尾寒羊具有个体大、生长发育快、繁殖率高、适应性强等许多优良特性,是我国优异的地方品种资源。为了探讨其未来100年内的种群动态及影响因素,本研究通过实践调查和测算得出小尾寒羊的非遗传信息,同时,通过实验室工作,分析了100只小尾寒羊5个微卫星基因座的多态信息,然后将非遗传信息和微卫星多态信息结合,运用漩涡模型（VORTEX 9.72）模拟了小尾寒羊的种群生存力。模拟结果如下:1.理想条件下（无交配限制、无近亲交配衰退、无灾害等）,小尾寒羊种群数量在未来的前30年间迅速增长,后70年间稳定的维持在接近800万只,但种群的基因杂合度略有下降,近交衰退略有增加。2.非理想条件下,当有灾害有近交时,小尾寒羊种群的灭绝概率为0,基因杂合度较理想条件下降了0.5%,种群的增长趋势将受到抑制。有灾害无近交的情况下,小尾寒羊的增长率为63.1%;而有近交无灾害影响下增长率则为99.7%。因此,灾害较近交对小尾寒羊种群产生的影响大。近交和灾害综合作用下增长率则降低为9.5%,从此可以得知,近交和灾害具有协同作用。3.灵敏度分析认为,疫病和过度宰杀是影响小尾寒羊种群动态的重要因素。当疫病危害程度非常严重,严重和比较严重时,种群的增长率分别为为7.76%、11.3%和12.3%;当过度宰杀的频率增倍或减半时,灵敏度指数分别为0.077和-0.234;其次是繁殖母羊的比例和羔羊的死淘率,当繁殖母羊比例增加、羔羊死淘率减少时,灵敏度指数升高;近交衰退和环境波动对种群动态的影响较小,但它们对小尾寒羊种群增长具有减缓作用。因此,适当提高繁殖母羊的比例以及把过度宰杀控制在一定范围内等措施,会在不同程度上有利于山东小尾寒羊种群的稳定和发展。综上所述,小尾寒羊在未来100年的种群存活概率为100%。根据利用非遗传信息和微卫星多态信息分析小尾寒羊种群生存力的模拟结果,可以更加准确的提出保护小尾寒羊的措施。

论文目录

• 英文缩略词
• 中文摘要
• 英文摘要
• 1 引言
• 1.1 小尾寒羊品种资源概况
• 1.2 种群生存力分析研究进展
• 1.2.1 PVA 的起源与发展
• 1.2.2 PVA 的研究对象
• 1.2.3 物种灭绝的特征
• 1.2.4 PVA 常用模型
• 1.2.5 PVA 的生物学意义
• 1.2.6 我国PVA 研究的现状
• 1.2.7 PVA 的发展趋势
• 1.2.8 PVA 灵敏度分析
• 1.2.9 PVA 所需的相关数据
• 1.3 微卫星标记技术在羊育种及保护中的应用
• 1.3.1 微卫星DNA 的含义及其分布
• 1.3.2 微卫星DNA 多态性分析的特点
• 1.3.3 微卫星DNA 多态性形成的机制
• 1.3.4 微卫星位点多态性检测原理及方法
• 1.3.5 微卫星标记在种质资源保护方面的利用
• 2. 本课题的研究目的和意义
• 3. 研究区概况和研究方法
• 3.1 研究区自然概况
• 3.2 研究方法
• 3.2.1 微卫星DNA 研究方法
• 3.2.2 预测模型原理和软件选择
• 3.2.3 构建非遗传信息参数体系
• 4 结果与分析
• 4.1 微卫星DNA 多态性检测结果
• 4.2 理想状态下的种群动态及杂合度变化
• 4.3 模拟条件下的种群动态
• 4.4 参数灵敏度分析
• 4.4.1 不同环境波动下种群变动趋势
• 4.4.2 灾害对种群动态的影响
• 4.4.3 疫病对种群动态的影响
• 4.4.4 死淘率对种群动态的影响
• 4.4.5 不同繁殖母羊比例对种群动态的影响
• 4.4.6 近交衰退对种群动态的影响
• 4.4.7 不同因子影响下小尾寒羊种群基因杂合度的变化
• 5. 讨论
• 5.1 PVA 的准确性和适用范围
• 5.2 近交衰退对小尾寒羊影响的分析
• 5.3 灾害对小尾寒羊种群动态的影响
• 5.4 繁殖母羊比例作为影响因子的分析
• 5.5 基因杂合度下降的分析
• 5.6 PVA 应用于家养动物的可行性分析
• 5.7 保护和管理建议
• 结论
• 参考文献
• 致谢
• 作者简介
• 攻读学位期间发表论文情况