CXCR2基因多态性及其与奶牛乳房炎和乳品质的关联研究

论文摘要

本文采用单链构象多态性分析法，以中国荷斯坦牛、中国西门塔尔牛和通江黄牛为研究对象，研究了CXCR2基因的多态性及其对牛奶品质性状的遗传效应，结论如下：在扩增的6个片段中共发现3个SNP多态位点，分别位于CXCR2基因序列的684bp、777bp和861bp处。SNP+684和SNP+777通过PCR-SSCP产生A、B、C三个等位基因。其中等位基因A为优势基因。基因型命名为AA、AB、AC、BB、BC、CC。两个位点在荷斯坦和西门塔尔两个群体中均显示高度多态（PIC＞0.50），而在通江黄牛中显示中度多态（0.25＜PIC＜0.50）；SNP+861经PCR-SSCP产生E和F两个等位基因，且等位基因E为优势基因。该位点在所研究的三个群体中均显示中度多态（0.25＜PIC＜0.50）。SNP+684和SNP+777两个位点不同基因型在品种间的分布达到显著水平（P＜0.05）。通过最小二乘分析和显著性检验发现，乳品质性状中除总蛋白之外，AA型和AB型的乳品质性状极显著（P＜0.01）或显著（P＜0.05）优于其它基因型。SNP+861位点不同基因型在品种间差异不显著（P＞0.05）。通过最小二乘分析和显著性检验发现，乳品质性状中除总蛋白之外，EE型奶牛的牛奶品质显著（P＜0.05）优于FF型。GLM分析结果显示：不同品种牛之间SCS差异极显著（P＜0.01），品种效应主要来自于中国荷斯坦牛；不同基因型对SCS效应达到极显著水平（P＜0.01），基因型效应主要来自与BC型、CC型和FF型；胎次对SCS的效应差异不显著。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 1 前言
• 1.1 奶牛乳房炎的研究概况
• 1.1.1 奶牛乳房炎的概述
• 1.1.2 乳房炎的分类
• 1.1.3 奶牛乳房炎的发生
• 1.1.4 奶牛乳房炎的判定
• 1.1.5 奶牛乳房炎的遗传学研究
• 1.1.6 奶牛乳房炎的防治现状与发展方向
• 1.2.CXCR2的研究进展
• 1.2.1.趋化因子概述
• 1.2.2 CXCR2的结构和功能
• 1.2.3 CXCR2基因的定位
• 1.2.4 CXCR2与疾病的关系
• 1.3 SSCP技术的研究概况
• 1.3.1 SSCP的建立与发展
• 1.3.2 PCR-SSCP方法的原理
• 1.3.3 PCR-SSCP的应用
• 1.3.4 SNP及其研究方法
• 1.4 本研究的目的和意义
• 2 试验材料与方法
• 2.1 试验材料
• 2.1.1 供试样本
• 2.1.2 试验主要仪器设备
• 2.1.3 试验主要试剂及配置
• 2.1.4 引物信息及PCR反应条件
• 2.2 试验方法
• 2.2.1 技术路线
• 2.2.2 基因组DNA提取
• 2.2.3 PCR反应及目的产物检测
• 2.2.4 PCR扩增产物的PCR-SSCP分析及基因型判定
• 2.3 序列结果
• 2.4 数据统计分析
• 2.4.1 目标生产性状的测定与数据收集
• 2.4.1.1 乳样采集与保存
• 2.4.1.2 目标生产性状的测定
• 2.4.1.3 数据收集
• 2.4.2 数据处理
• 2.4.3 遗传多态性分析
• 2.4.4 Hardy-Weinberg平衡状态的检验
• 2.4.5 CXCR2基因各多态位点的遗传多态性分布
• 3 结果与分析
• 3.1 模板DNA抽提和PCR扩增结果
• 3.1.1 模板DNA的抽提结果
• 3.1.2 牛CXCR2基因PCR扩增结果
• 3.1.3 PCR-SSCP多态性检测结果
• 3.1.4 CXCR2基因部分序列测序结果
• 3.2 CXCR2基因及突变位点的遗传学研究结果
• 3.2.1 各品种牛CXCR2基因型频率和基因频率分析
• 3.2.2 各品种牛CXCR2基因在不同位点的遗传特性分析
• 3.2.3 Hardy-Weinberg平衡的检验
• 3.3 牛CXCR2基因多态位点的遗传效应分析
• 3.3.1 不同品种牛奶品质性状的比较分析
• 3.3.2 牛CXCR2基因各引物不同基因型对产奶性状的遗传效应分析
• 3.4 牛CXCR2基因与奶牛乳房炎的关系
• 3.4.1 不同品种牛之间SCS差异比较
• 3.4.2 牛CXCR2基因不同基因型与奶牛乳房炎的关系
• 4.讨论
• 4.1 关于DNA抽提的优化
• 4.2 PCR反应体系与反应条件的优化
• 4.3 中国荷斯坦牛、中国西门塔尔牛和通江黄牛的遗传特征分析
• 4.4 牛CXCR2基因多态性与SCS的关系
• 4.4.1 品种对SCS的影响
• 4.4.2 基因型对SCS的影响
• 4.5 影响奶牛乳房炎的因素分析
• 4.5.1 品种对奶牛乳房炎的影响
• 4.5.2 基因型对奶牛乳房炎的影响
• 4.5.3 胎次对奶牛乳房炎的影响
• 4.6 品种和基因型对牛奶品质的影响
• 5.结论
• 参考文献
• 致谢
• 攻读硕士论文期间发表论文情况