辣椒分子连锁图谱的构建及抗疫病QTL定位

论文摘要

辣椒是世界上最重要的蔬菜作物之一，辣椒疫病（Phytophthora capsici L．）是一种毁灭性的土传病害，在世界各地均有发生，且有逐年加重的趋势。世界许多辣椒生产国已将辣椒抗疫病育种作为辣椒育种的主要目标之一，我国从“八五”开始将选育辣椒抗疫病品种列入了国家科技攻关项目。本研究用抗辣椒疫病的材料“perennial”与综合园艺性状优良的高感材料“83-60”，及其F2代群体（144株）为试材，采用AFLP技术，利用亲本从AFLP引物组合中筛选多态性引物，在F2代群体中进行标记的分析、辣椒分子遗传图谱的构建及QTL的研究。本研究得到如下结果：（1）从512对AFLP引物组合中筛选出具有多态性的引物组合380对，应用其中的28对引物组合在F2代群体中进行抗病性标记的分析。得到146个多态性标记，结合RAPD和SSR分子标记（胡勇胜，硕士论文），应用Joinmap3.0软件进行分析，取LOD值等于4.0时，构建了一张有12个连锁群，70个分子标记的辣椒分子连锁图谱，其中54个为AFLP分子标记。图谱覆盖长度为429.02cM，每个连锁群长度在4.30-85.85cM之间，标记间平均图距为6.13cM。（2）采取切茎法进行抗病性鉴定，病原菌为辣椒疫霉菌（Phytophthora capsici L．）长沙分离株，在PDA培养基上18℃恒温培养3天，浓度为103个游动孢子／ml，接种10天后调查发病情况。以病斑长度和病斑形态进行抗病性分级。0级24株、1级29株、2级41株、3级20株、4级18株、5级12株。（3）运用Windows QTL Cartographer（2.0）软件的区间作图法进行QTL分析。应用Permutation功能，计算出显著QTL阈值区间是LOD＞2.2，在第四连锁群上检测到2个QTL位点，一个OTL位点的LOD值为2.89，在连锁群上的支持区域是0～7.2cM，距离最近的标记E41M53-7仅0.4cM；另一个QTL位点的LOD值为4.18，在连锁群上的支持区域是13.6～35.6cM，距离最近的分子标记E41M52-6为7cM，两个QTL解释表型差异的贡献率分别为9.5％和16.4％。本试验的研究结果为分子标记辅助育种提供可参考的标记，为加快辣椒抗疫病优良品种的培育提供可能的途径。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 第一章 文献综述
• 1.1 辣椒疫病的研究概况
• 1.1.1 辣椒疫病
• 1.1.2 辣椒疫病抗源的筛选
• 1.1.3 辣椒疫病接种鉴定方法
• 1.1.4 辣椒抗疫病遗传规律的研究
• 1.2 分子标记技术
• 1.2.1 分子标记的类型
• 1.2.2 分子标记在辣椒育种上的应用
• 1.2.3 AFLP技术在蔬菜育种中的应用
• 1.3 分子遗传图谱
• 1.3.1 亲本选择
• 1.3.2 作图群体
• 1.3.3 作图群体的大小
• 1.3.4 辣椒分子遗传图谱的研究进展
• 1.4 数量性状基因定位方法及应用
• 1.4.1 QTL定位方法
• 1.4.2 辣椒抗疫病的QTL分析
• 1.5 研究目的、意义及试验设计
• 1.5.1 研究目的及意义
• 1.5.2 试验设计
• 第二章 辣椒分子连锁图谱的构建
• 2.1 材料与方法
• 2.1.1 试验材料
• 2.1.2 模板DNA的提取
• 2.1.3 AFLP分析及反应体系的优化
• 2.1.4 标记数据记录
• 2.1.5 数据统计分析
• 2.2 结果与分析
• 2.2.1 DNA的提取
• 2.2.2 AFLP反应体系的优化
• 2.2.3 利用亲本进行AFLP引物筛选
• 2.2.4 构图分子标记的筛选
• 2.3 辣椒分子连锁图谱的构建
• 2.4 小结
• 第三章 辣椒抗疫病QTL定位
• 3.1 材料与方法
• 3.1.1 试验材料
• 3.1.2 辣椒疫病人工接种鉴定
• 3.1.3 数据统计分析
• 3.2 结果与分析
• 3.2.1 抗病性鉴定结果
• 3.2.2 QTL分析
• 3.3 小结
• 第四章 讨论
• 4.1 试验亲本及作图群体的选择
• 4.2 辣椒疫病抗病性鉴定方法
• 4.3 辣椒分子遗传图谱的构建
• 4.4 辣椒抗疫病QTL分析
• 第五章 全文结论
• 5.1 采用切茎法进行辣椒疫病的人工接种及抗病性鉴定
• 5.2 构建辣椒分子连锁图谱
• 5.3 初步检测到2个辣椒抗疫病性状的QTL
• 参考文献
• 附录
• 致谢
• 作者简介