与HIV-1感染相关的基因在中国20个民族群体中的多态性研究

与HIV-1感染相关的基因在中国20个民族群体中的多态性研究

论文摘要

HIV-1在全世界各地广泛流行,可是不同地区的流行病学特征都各不相同。导致这种差异的原因很多,包括机体免疫功能强弱、感染毒株的毒力、是否接受治疗以及遗传背景等因素。其中,与HIV-1感染相关基因的多态性与个体的感染艾滋病风险和感染后疾病进展密切相关。基于以上原因,本研究希望通过在大量健康个体中对HIV-1感染相关的基因进行突变分布研究,描述突变位点在不同群体中的分布特征,推测造成这种分布的原因,初步预测不同群体的易感性以及感染后疾病进展。本研究采用PCR和PCR-RFLP的方法对全国20个不同民族群体(包括11个云南特有的少数民族群体)进行了5个与HIV-1感染相关基因的突变位点的检测,即艾滋病易感性筛查研究。这5个基因均与艾滋病病毒入侵人体细胞密切相关,包括主要协同受体CCR5,次要协同受体CCR2、CX3CR1、CCR5天然配体RANTES以及CXCR4天然配体SDF。根据每个个体三个基因座位上的(CCR5-CCR2-SDF)突变基因型组合计算中国20个不同民族群体的相对感染风险值。研究结果显示:(1)所研究的中国20个民族群体中都缺乏CCR5△32突变,因此与欧洲群体相比来说,这些群体的CCR5△32频率都相对低得多。CCR2-64I、SDF1-3’A、RANTES In1.1C、CX3CR1-249I和CX3CR1-280M的频率表现出从南向北渐变的特征。(2)本研究中CCR2-64I、SDF1-3’A、RANTES In1.1C、CX3CR1-249I和CX3CR1-280M的分布在不同民族群体中存在差异。(3)不同民族群体之间存在RH值的差异。与欧洲群体相比,这些民族群体的RH值都较高。(4)分布于南方的群体相对于北方的群体来说具有较高的RH值,CX3CR1-249I-280M单倍型频率相对较低。(5)一定程度上相同语系的不同民族群体具有接近的CCR2-64I、SDF1-3’A、RANTES In1.1C、CX3CR1-249I和CX3CR1-280M分布。(6)具有共同起源或者遗传背景较为接近的群体具有相似CCR2-64I、SDF1-3’A、RANTES In1.1C、CX3CR1-249I和CX3CR1-280M分布。

论文目录

  • 缩略语表
  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 前言
  • 一、实验材料和方法
  • (一)、实验材料
  • (二)、实验方法
  • 二、实验结果
  • 三、讨论
  • 第一部分 相关方法学的讨论
  • 第二部分 与HIV-1感染相关基因间的相互作用以及与艾滋病的关系
  • 第三部分 与HIV-1感染相关基因突变的形成机制与其分布的关系探讨
  • 第四部分 与HIV-1感染相关基因突变频率及其分布的研究讨论
  • 第五部分 HIV-1流行病学研究及群体风险差异的原因
  • 四、小结
  • 五、问题及展望
  • 参考文献
  • 论文综述 与HIV-1感染和疾病进展相关基因的研究进展
  • 致谢
  • 研究生简历
  • 相关论文文献

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