MDH、LDHC基因多态性与肉鸽生长及繁殖性状的相关性分析

论文摘要

本研究以鸽为试验对象,分析比较了肉鸽的生长繁殖性能,同时采集其羽髓样本,各100对,应用苯酚/氯仿抽提方法提取基因组DNA,以此为模板,根据NCBI上已发表的鸽、鸡等的苹果酸脱氢酶（Malate Dehydrogenase, MDH）和乳酸脱氢酶-C4（Lactate Dehydrogenase C4, LDHC）基因序列,设计引物,分别扩增MDH和LDHC基因序列,采用PCR-SSCP吉合测序的方法检测两个肉鸽群体MDH和LDHC基因的单核苷酸多态性（Single Nucleotide Polymorphisms, SNP）,应用数据统计分析软件SPSS分别分析MDH和LDHC基因不同基因型频率和基因频率,分析MDH和LDHC基因与肉鸽生长繁殖性状之间的相关性,主要结果如下：1.白羽王鸽和泰平王鸽的体重和体尺等性状均显著高于地方鸽（P<0.05）；白羽王鸽与泰平王鸽在产蛋性能上差异显著（P<0.05）,泰平王鸽年平均产蛋量为21.265个,比白羽王鸽多产1.4个蛋,平均产蛋间隔为30.964d,比白羽王鸽缩短了2.4d；白羽王鸽与泰平王鸽的受精率、孵化率均存在显著差异（P<0.05）,白羽王鸽在受精率和孵化率方面显著优于泰平王鸽。2.在MDH基因的外显子-1、外显子-2、外显子-3、外显子-5、外显子-9、外显子-12、外显子13和外显子-15位置并未发现多态位点。3.在LDHC基因的外显子-6上检测到一个C→T的碱基突变,表现为两种基因型,AA型和AB型,两种基因型对白羽王鸽的体尺及泰平王鸽的体重和体尺无显著影响（P>0.05）,对白羽王鸽的体重有显著影响（P<0.05）；对白羽王鸽的孵化率、年平均产蛋量和平均产蛋间隔有显著影响（P<0.05）,对泰平王鸽的受精率有显著影响（P<0.05）,两个肉鸽品种中,AA基因型个体的产蛋性能均高于AB基因型的个体,该基因型是肉鸽产蛋性能的有利基因型。LDHC基因与肉鸽繁殖性能之间存在相关,可以作为影响肉鸽繁殖性状的候选基因进行深入研究。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 目录
• 第1章 文献综述
• 1. 家鸽的简介
• 1.1 家鸽的起源和驯化
• 1.2 家鸽的形态
• 1.3 家鸽的品种
• 1.4 鸽的生物学习性
• 2 分子遗传标记概述
• 2.1 分子遗传标记的种类
• 2.1.1 限制性片段长度多型性标记（RFLP）
• 2.1.2 随机扩增多型性DNA标记（RAPD）
• 2.1.3 扩增片段长度多型性（AFLP）
• 2.1.4 微卫星DNA标记
• 2.1.5 单核苷酸多型性标记（SNP）
• 2.2 分子遗传标记在育种中的应用
• 2.2.1 评估遗传多样性水平
• 2.2.2 探讨群体的起源、进化以及系统发生关系
• 2.2.3 构建遗传图谱
• 2.2.4 标记辅助选择育种
• 2.2.5 预测杂种优势
• 2.2.6 个体识别与亲子鉴定
• 3 MDH的研究
• 3.1 MDH的主要生物学功能
• 3.2 MDH的结构特征
• 3.3 MDH研究进展
• 4 LDHC的研究
• 4.1 LDH及其同工酶
• 4.2 LDHC主要生物学功能及结构
• 4.3 LDHC研究进展
• 5 本研究的目的和意义
• 第2章 肉鸽生长繁殖性能的比较分析
• 1 材料与方法
• 1.1 试验动物
• 1.2 饲养管理与日粮
• 1.3 数据统计与处理
• 1.3.1 数据统计
• 1.3.2 数据分析处理
• 2 结果与分析
• 2.1 不同鸽品种体重比较
• 2.2 不同鸽品种体尺比较
• 2.3 不同鸽品种产蛋性能比较
• 2.4 不同鸽品种孵化情况比较
• 3 讨论
• 3.1 试验鸽种质资源简介
• 3.1.1 白羽王鸽
• 3.1.2 泰平王鸽
• 3.1.3 地方鸽
• 3.2 生长及繁殖性能比较分析
• 3.3 提高肉鸽生产性能的建议
• 第3章 MDH、LDHC基因多态性与肉鸽生长及繁殖性状的相关性分析
• 1 材料与方法
• 1.1 试验鸽的来源及采样方法
• 1.2 主要试剂及试剂盒
• 1.3 主要仪器设备
• 1.4 溶液配制
• 1.5 基因组DNA提取
• 1.6 引物的设计
• 1.6.1 MDH引物
• 1.6.2 LDHC引物
• 1.7 PCR扩增
• 1.7.1 MDH PCR反应体系
• 1.7.2 LDHC PCR反应体系
• 1.8 PCR扩增产物电泳检测与鉴定
• 1.9 PCR-SSCP检测
• 1.9.1 凝胶的制作及电泳
• 1.9.2 硝酸银染色
• 1.10 PCR-SSCP分析基因型判定
• 1.11 测序
• 1.12 数据分析
• 1.12.1 基因型频率（Genotypic Frequency）
• 1.12.2 等位基因频率（Allele Frequencies）
• 1.12.3 杂合度（Heterozygosity,H）
• 1.12.4 有效等位基因数（Effective Number of Alleles,Ne）
• 1.12.5 多态信息含量（Polymorphism Information Content,PIC）
• 1.12.6 不同多态位点各品种基因型分布的差异分析,采用卡方独立性测验
• 1.12.7 统计分析模型（单因素最小二乘分析法）
• 2 结果与分析
• 2.1 基因组DNA的提取
• 2.1.1 DNA浓度与纯度紫外分光光度检测
• 2.1.2 DNA质量的琼脂糖凝胶电泳检测
• 2.2 MDH基因多态性及其与肉鸽生长繁殖性状的相关分析
• 2.2.1 MDH基因PCR产物的检测
• 2.2.2 MDH基因SSCP电泳结果分析
• 2.3 LDHC基因遗传多态及其与肉鸽生长繁殖性状关联分析
• 2.3.1 LDHC基因PCR产物的检测
• 2.3.2 LDHC基因SSCP电泳结果分析
• 2.3.3 LDHC基因测序结果分析
• 2.3.4 群体遗传学分析
• 3 讨论
• 3.1 MDH基因多态性与肉鸽生长繁殖性状的相关性分析
• 3.2 LDHC基因多态性与肉鸽生长繁殖性状的相关性分析
• 第4章 结论
• 参考文献
• 致谢
• 攻读学位期间发表的学术论文目录