本文主要研究内容
作者黄勇,龚望宝,陈海刚,孙西红（2019）在《基于高通量测序的杂交鳢转录组数据分析》一文中研究指出：运用高通量技术对杂交鳢进行转录本测序和数据分析,经拼接与组装,最终获得52 065条unigenes,长度范围201～12 407 bp,序列平均长度为710 bp。从长度分布、GC含量和基因表达量等方面对unigenes进行评估,数据显示测序质量较好。进一步的数据分析,共鉴定出20 535个CDS,37 324个SNP位点和7 830个微卫星。用6大数据库Swiss–Prot、Nr、Pfam、KEGG、KOG和GO注释杂交鳢转录组unigenes,分别对应有20 955、28 938、19 339、14 052、19 358和18 635条unigenes获得注释。根据GO数据库的注释,可将这些unigenes分为生物过程、细胞组分和分子功能3大类共50亚类。KEGG代谢通路分析表明,这些unigenes参与了5大类30亚类共268个代谢通路,其中,参与信号转导通路的unigenes数量最多,有1 716条。
Abstract
yun yong gao tong liang ji shu dui za jiao li jin hang zhuai lu ben ce xu he shu ju fen xi ,jing pin jie yu zu zhuang ,zui zhong huo de 52 065tiao unigenes,chang du fan wei 201～12 407 bp,xu lie ping jun chang du wei 710 bp。cong chang du fen bu 、GChan liang he ji yin biao da liang deng fang mian dui unigenesjin hang ping gu ,shu ju xian shi ce xu zhi liang jiao hao 。jin yi bu de shu ju fen xi ,gong jian ding chu 20 535ge CDS,37 324ge SNPwei dian he 7 830ge wei wei xing 。yong 6da shu ju ku Swiss–Prot、Nr、Pfam、KEGG、KOGhe GOzhu shi za jiao li zhuai lu zu unigenes,fen bie dui ying you 20 955、28 938、19 339、14 052、19 358he 18 635tiao unigeneshuo de zhu shi 。gen ju GOshu ju ku de zhu shi ,ke jiang zhe xie unigenesfen wei sheng wu guo cheng 、xi bao zu fen he fen zi gong neng 3da lei gong 50ya lei 。KEGGdai xie tong lu fen xi biao ming ,zhe xie unigenescan yu le 5da lei 30ya lei gong 268ge dai xie tong lu ,ji zhong ,can yu xin hao zhuai dao tong lu de unigenesshu liang zui duo ,you 1 716tiao 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自湖南农业大学学报(自然科学版)的黄勇,龚望宝,陈海刚,孙西红，发表于刊物湖南农业大学学报(自然科学版)2019年05期论文，是一篇关于杂交鳢论文,转录组论文,基因注释论文,湖南农业大学学报(自然科学版)2019年05期论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自湖南农业大学学报(自然科学版)2019年05期论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。