人乳头瘤病毒的临床检测及病毒L1基因的克隆

人乳头瘤病毒的临床检测及病毒L1基因的克隆

论文摘要

人乳头瘤病毒(Human Papillomavirus,HPV)是造成妇女子宫颈癌(Cervical Cancer)的元凶,每年在世界范围内导致50 万女性死亡。由于缺乏经济可靠的临床检测方法,目前为止我国还没有关于HPV 流行病学的准确资料,也不知道高危型HPV 的频率分布情况。为尝试解决此问题,本研究收集了北京等地妇科门诊患者宫颈脱落细胞样本122 例及尖锐湿疣样本22 例(包含5 例宫颈湿疣),以HPV DNA 序列为模板设计了通用引物和14 对针对HPV 不同类型的特异引物,采用SSP-PCR 方法检测样本中HPV 的感染率和病毒类型。每一检测设两个PCR 重复,同时包括HPV 阳性及阴性对照。检测结果表明,使用HPV 通用引物时样本中HPV 保守DNA 片段的平均检出率为59%,与国外的报道相似。而使用自行设计的HPV 特异引物时,妇科门诊细胞学异常样品的总感染率为95.1%,门诊随机宫颈样本中HPV 的总检出率也达到89.1%。全部尖锐湿疣中存在着高浓度的HPV6 及HPV11 病毒,检出率达100%。检测发现12 种高危型HPV 在61 例细胞学异常的宫颈样本中都有检出,其中频率最高的5 种HPV 阳性率顺序为HPV18 (83.6%) > HPV33 (53.0%) > HPV16 (39.3%) > HPV56 (24.6%) > HPV58 (23.0%)。同样,12 种HPV 高危型在55 例门诊随机宫颈样品中均有检出,频率最高的5 种HPV 排列为HPV33 (75.0%) > HPV18 (65.5%) > HPV56 (27.3%) > HPV16 (25.5%) > HPV39 (21.8%)。抽样TA 克隆及DNA 序列测定证实,12 种高危型及2 种低危HPV 的PCR 放大片段与已知类型的HPV DNA 序列完全吻合。全部序列均已存入国际基因数据库GenBank 中(序列检索号DQ003066-DQ003079)。检测发现大部分门诊宫颈细胞样本中都存在严重的HPV 混合感染现象。在细胞学异常的样本中,三种HPV 混合感染的比例达到样本总数的30%,五种及以上HPV 混合感染的比例高达13.8%。在门诊随机样本中,两种HPV 混合感染的比率占样本总检测数的30.9%,也有相当比例的三种、四种及以上HPV 感染的情况。研究中我们还克隆了HPV33 编码L1 衣壳蛋白的DNA 全长基因。本研究建立了临床检测HPV 的灵敏可靠方法,首次报道HPV 病毒在我国人群中存在很高的感染及混合感染,并显示高危HPV 类型在我国人群中的频率分布可能与国外人群有所不同。检测结果预示北京地区宫颈癌正处于高发趋势。

论文目录

  • 第一章 引言
  • 1.1 HPV 病毒的生物学
  • 1.1.1 病毒的基本结构
  • 1.1.2 病毒的生活史
  • 1.1.3 病毒的类型化分
  • 1.1.4 病毒造成的危害
  • 1.1.5 病毒的致病机理
  • 1.1.6 病毒的流行病学
  • 1.2 HPV 防治面临的主要问题
  • 1.3 本课题的研究目标
  • 第二章 临床样本中HPV 的检测和类型检定
  • 2.1 材料和方法
  • 2.1.1 样本采集
  • 2.1.2 试剂、耗材及仪器
  • 2.1.3 特异HPV引物设计
  • 2.1.4 样本DNA 制备
  • 2.1.5 SSP-PCR 检测
  • 2.1.6 TA 克隆
  • 2.1.7 DNA 序列测定
  • 2.2 结果
  • 2.2.1 细胞学异常宫颈样品中HPV 检测结果
  • 2.2.2 妇科门诊随机样本中HPV检测结果
  • 2.2.3 尖锐湿疣样本中HPV 检测结果
  • 2.2.4 TA 克隆和DNA 序列测定结果
  • 第三章 HPV33衣壳蛋白L1基因的分子克隆
  • 3.1 材料和方法
  • 3.1.1 特异引物设计
  • 3.1.2 SSP-PCR 扩增
  • 3.1.3 TA 克隆
  • 3.1.4 DNA 序列测定及分析
  • 3.2 结果
  • 第四章 讨论
  • 4.1 宫颈癌在我国北京呈高发趋势
  • 4.2 SSP-PCR 可以成为HPV 检测的可靠方法
  • 4.3 关于检测技术及结果的几点讨论
  • 参考文献
  • 附录
  • 致谢
  • 作者简介
  • 相关论文文献

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