抗肿瘤中药活性成分多靶点的计算机虚拟筛选

抗肿瘤中药活性成分多靶点的计算机虚拟筛选

论文摘要

研究表明许多中药具有抗肿瘤作用,中药尤其是中药复方化学成分复杂,含有多种活性成分,因此中药在抗肿瘤治疗时体现出药效弱、多靶点作用的特点。这种多靶点的作用一方面体现在多中种有效成分的多个靶点作用,另一方面也可能存在单分子对多个靶点作用。然而正是中药这种多靶点的作用,弥补了中药针对单靶点药效弱的不足,使得中药的抗肿瘤作用表现出整体治疗、调制并举的特点。然而如何用现代语言阐释中药这种整体治疗的原理与特色,到目前为止还是中医药研究领域的难点之一。因此本论文针对中药的抗肿瘤作用进行了两方面的研究:抗肿瘤中药复方活性成分多靶点的计算机虚拟筛选和抗肿瘤中药小分子化合物库的计算机虚拟筛选。1)选取中药复方半枝莲、白花蛇舌草和夏枯草的活性成分为研究对象,以抗肿瘤作用明确的靶点:表皮生长因子受体(EGFR)、血管内皮生长因子(VEGFR)、周期蛋白依赖性蛋白激酶(CDK)、局部黏着斑激酶(FAK)、法尼基转移酶(FTase)和抑制凋亡基因(Bcl-2)为筛选靶点,运用计算机虚拟筛选手段研究中药复方的多靶点抗肿瘤作用。结果发现该复方活性成分对多个抗肿瘤相关靶点均有抑制活性,其中针对EGFR为靶点的抑制作用,来源于白花蛇舌草的环烯醚萜类化合物起主要作用;针对FAK的抑制作用,黄酮类化合物起主要作用;针对VEGFR、CDK-2靶点的抑制作用,为环烯醚萜类化合物和黄酮类化合物的共同作用;针对Bcl-2靶点的抑制作用,甾体类化合物起主要作用。2)选取了11味具有抗肿瘤作用的中药,查阅其活性成分相关文献,构建中药小分子化合物库,针对6个抗肿瘤相关靶点进行计算机虚拟筛选。结果发现可以同时与4个及4个以上靶标蛋白有结合活性的化合物有15个,其中6个为木脂素类化合物。从6个木脂素类化合物中选取化合物物N15进行了结合模式的研究,并根据其结合模式进行了药效团的分析。

论文目录

  • 中文摘要
  • Abstract
  • 第一章 绪论
  • 1.1 计算机辅助药物设计概述
  • 1.1.1 计算机辅助药物设计
  • 1.1.2 计算机辅助药物设计方法分类
  • 1.1.3 计算辅助药物设计常用的技术手段
  • 1.2 肿瘤的分子靶向治疗
  • 1.2.1 肿瘤治疗的现状
  • 1.2.2 靶向抗肿瘤药物研究
  • 1.3 中药抗肿瘤作用研究
  • 1.3.1 抗肿瘤中药及有效成分
  • 1.3.2 中药活性成分抗肿瘤作用机制
  • 1.4 论文研究内容及意义
  • 参考文献
  • 第二章 抗肿瘤中药复方活性成分多靶点的虚拟筛选
  • 2.1 材料与计算方法
  • 2.1.1 研究对象
  • 2.1.2 化合物结构库的构建
  • 2.1.3 具有抗肿瘤疗效的靶标蛋白
  • 2.1.4 分子对接
  • 2.2 结果与讨论
  • 2.2.1 以EGFR 为靶点的虚拟筛选结果
  • 2.2.2 以VEGFR 为靶点的虚拟筛选结果
  • 2.2.3 以CDK-2 为靶点的虚拟筛选结果
  • 2.2.4 以Bcl-2 为靶点的虚拟筛选结果
  • 2.2.5 以FAK 为靶点的虚拟筛选结果
  • 2.2.6 以FTase 为靶点的虚拟筛选结果
  • 2.3 本章小结
  • 参考文献
  • 第三章 抗肿瘤中药活性成分多靶点的虚拟筛选
  • 3.1 材料与计算方法
  • 3.1.1 中药小分子化合物库的建立
  • 3.1.2 分子对接
  • 3.2 结果与讨论
  • 3.2.1 筛选结果
  • 3.2.2 木脂素类化合物N15 结合模式分析
  • 3.3 本章小结
  • 参考文献
  • 第四章 结语与展望
  • 4.1 结语
  • 4.2 展望
  • 个人简历
  • 文章与专利
  • 致谢
  • 相关论文文献

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