导读:本文包含了绿色杜氏藻论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:绿色杜氏藻,异戊烯基焦磷酸异构酶基因(IPI),生物信息学,CBS结构域蛋白(CDCP)
绿色杜氏藻论文文献综述
陈俊粤,龚一富,马颖瑞,周丽亚,王何瑜[1]（2017）在《绿色杜氏藻异戊烯基焦磷酸异构酶基因(DvIPI)的生物信息学与诱导表达分析》一文中研究指出异戊烯基焦磷酸异构酶(isopentenyl diphosphate isomerase,DvIPI)是绿色杜氏藻中类胡萝卜素等萜类物质合成过程中甲羟戊酸途径(mevalonate pathway,MVA)通路上一个重要的限速酶。实验中获得绿色杜氏藻IPI基因的全长序列(Gen Bank序号:KX189195),该基因全长4 641 bp,开放阅读框(ORF)为1 147 bp,编码382个氨基酸,并含有3个CBS结构域。蛋白质预测结果表明,DvIPI分子呈亲水性,不含信号肽,也不存在跨膜区域;同时,DvIPI中α-螺旋所占比例最高,中部呈现不规则的扭曲缠绕,两边各自有一个扭曲的多肽链单独远离中心。系统进化树分析显示,DvIPI与细菌IPI亲缘关系较近,而与被子植物以及其他藻类IPI亲缘关系较远。定量检测结果与RT-PCR结果表明,茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,Me JA)浓度为50~100μmol/L时,对绿色杜氏藻类中类胡萝卜素含量、叶绿素含量以及绿色杜氏藻IPI基因表达水平的影响最为明显,且叁者的变化趋势基本一致,推测Me JA对绿色杜氏藻类中类胡萝卜素、叶绿素的诱导作用可能与绿色杜氏藻类IPI基因有关。(本文来源于《生命科学研究》期刊2017年03期）
朱帅旗,龚一富,章丽,俞凯,王何瑜[2]（2017）在《绿色杜氏藻不同β-胡萝卜素羟化酶基因家族胁迫应答模式研究》一文中研究指出β-胡萝卜素羟化酶(β-carotenoid hydroxylase,CHYB)是植物类胡萝卜素生物合成途径中的一个重要限速酶。本研究对绿色杜氏藻转录组测序数据进行分析,获得2条β-胡萝卜素羟化酶家族基因chyb1和chyb2。采用染色体步移法分别克隆并获得了绿色杜氏藻chyb1和chyb2基因的启动子序列,全长分别为1080 bp(Gen Bank登录号:KY012338)和1155 bp(Gen Bank登录号:KY012339)。利用Plantcare软件分析两个启动子的顺式作用元件,结果表明绿色杜氏藻chyb1基因启动子含有与甲基茉莉酸、花生四烯酸、水杨酸等非生物胁迫相关的顺式作用元件,而绿色杜氏藻chyb2基因启动子含有与光照相关的顺式作用元件。通过q RT-PCR分析了绿色杜氏藻CHYB基因家族在不同胁迫下的基因表达水平,结果表明该基因家族的基因表达水平与启动子调控相关,且不同的家族基因应答不同的胁迫。(本文来源于《遗传》期刊2017年02期）
周静,龚一富,马颖瑞,刘浩,朱帅旗[3]（2017）在《绿色杜氏藻DvGGPS生物信息学及转录差异研究》一文中研究指出香叶酰香叶酰焦磷酸合成酶(GGPS)能够催化焦磷酸异戊烯酯(IPP)与二甲基丙烯焦磷酸(DMAPP)反应形成二萜化合物通用前体香叶酰基香叶酰焦磷酸(GGPP)。为深入了解GGPS蛋白在类胡萝卜素合成途径中的作用,通过Illumina Hi Seq TM 2000高通量测序获得Dv GGPS基因c DNA全长序列,对GGPS基因序列进行生物信息学分析,并研究花生四烯酸(AA)、乙酰水杨酸(ASA)和硫酸铈铵(ACS)对Dv GGPS基因转录水平的影响及绿色杜氏藻类胡萝卜素含量变化。生物信息学分析结果表明,Dv GGPS基因c DNA全长2 229 bp,含1 041 bp开放阅读框,编码346个氨基酸。GGPS蛋白质序列理论等电点(p I)为5.82,相对分子质量为37.66 k Da,该蛋白为疏水性蛋白,无信号肽和跨膜区域。二级结构预测显示该蛋白分子中α-螺旋结构最多,占57.23%。同源比对结果表明,绿色杜氏藻GGPS蛋白与雨生红球藻亲缘关系最近。qRT-PCR结果表明,62.5 mg·L~(-1)AA、50 mg·L~(-1)ASA和0.8 mg·L~(-1)ACS处理的Dv GGPS基因转录水平达到最高,此时类胡萝卜素含量也均有提高,说明绿色杜氏藻类胡萝卜素的生物学合成可能是通过诱导Dv GGPS基因表达实现的,Dv GGPS基因在类胡萝卜素生物合成中起关键作用。Dv GGPS基因的克隆及表达调控研究为今后探明类胡萝卜素积累的分子机理提供了重要参考,也为进一步通过代谢工程手段提高绿色杜氏藻类胡萝卜素含量奠定了理论基础。(本文来源于《核农学报》期刊2017年04期）
张燕,龚一富,景丹丹,朱帅旗,俞凯[4]（2017）在《绿色杜氏藻GGR基因生物信息学分析及表达研究》一文中研究指出采用Illumina HiSeqTM 2000高通量测序方法获得绿色杜氏藻GGR基因(Gen Bank序号:KX100480)cDNA全长序列,研究了甲基茉莉酸(Me JA)对绿色杜氏藻GGR基因表达的影响.测序结果表明,绿色杜氏藻GGR基因cDNA全长2 356 bp,开放阅读框1 539 bp,编码512个氨基酸,分子量为52.296 1 k Da,理论等电点为6.54.序列分析结果表明,该蛋白具有保守的Chl P结构域,为可溶性蛋白,具有跨膜区域,无信号肽.Target P 1.1 Server预测结果表明,该蛋白可能定位于线粒体.系统进化树结果表明,绿色杜氏藻GGR蛋白较其他植物的GGR蛋白亲缘关系较远.RT-PCR结果表明,100μmol·L-1 Me JA可显着地提升绿色杜氏藻GGR基因的表达(P<0.01).同时,绿色杜氏藻叶绿素和类胡萝卜素含量达到最高,说明GGR基因与绿色杜氏藻叶绿素和类胡萝卜素的合成存在一定关系.(本文来源于《宁波大学学报(理工版)》期刊2017年01期）
马颖瑞,龚一富,周静,刘浩,朱帅旗[5]（2017）在《绿色杜氏藻香叶基焦磷酸合成酶基因(GPS)生物信息学与诱导表达分析》一文中研究指出香叶基焦磷酸合成酶(GPS)在植物体内催化二甲烯丙基焦磷酸与异戊烯基焦磷酸结合成萜类化合物前香叶基香叶基焦磷酸(GPP)。为深入理解GPS蛋白在类胡萝卜素生物合成过程中的作用,本研究采用高通量测序方法获得绿色杜氏藻GPS基因(Gen Bank序号:KT751181)c DNA全长序列,并研究乙酰水杨酸(ASA)、硫酸铈铵(CAS)和花生四烯酸(AA)3种诱导子对绿色杜氏藻GPS基因表达的影响。测序结果表明,绿色杜氏藻GPS基因c DNA全长2 281 bp,开放阅读框为1 449 bp,编码463个氨基酸。绿色杜氏藻GPS蛋白的分子量为53 714.9,理论等电点(p I)为6.66,该蛋白分子呈亲水性,无信号肽和跨膜结构域。二级结构分析显示,该蛋白分子中螺旋结构占主导地位,占47.7%。系统进化树结果表明,绿色杜氏藻GPS蛋白与莱茵衣藻亲缘关系最相近。诱导表达分析显示,62.5 mg·L-1AA、0.2~0.8 mg·L-1ACS和10 mg·L-1ASA可极显着提高绿色杜氏藻GPS基因表达;同时,类胡萝卜素含量也极显着升高,这一结果表明GPS基因与类胡萝卜素合成有关,GPS基因可能通过控制GPP的去向,间接影响绿色杜氏藻类胡萝卜素合成。本研究结果为揭示藻类类胡萝卜素合成机理及利用代谢工程策略提高类胡萝卜素含量奠定了理论基础。(本文来源于《核农学报》期刊2017年02期）
朱帅旗,龚一富,刘浩,章丽,王何瑜[6]（2015）在《葡萄糖诱导绿色杜氏藻转录组及相关通路差异分析》一文中研究指出绿色杜氏藻是研究耐盐机理的模式绿藻.葡萄糖不仅是营养物质,而且还是信号物质.目前,对绿色杜氏藻转录组、糖处理后差异表达基因和β-胡萝卜素生物合成途径关键基因表达还不清楚.本研究通过Illumina Hi SeqTM2000高通量测序,获得葡萄糖处理和未处理绿色杜氏藻转录组信息.利用P value值和差异倍数对样本进行差异表达分析,共111条转录本存在差异表达,3条为上调转录本,108条为下调转录本.利用RT-q PCR检验差异表达分析的准确性.结果表明,转录本表达结果与转录组分析结果一致.GO功能富集结果表明,71条下调转录本与代谢相关,占所有下调转录本的65.74%.KEGG富集分析结果表明,21条KEGG通路含89条下调转录本,14条通路与代谢相关.代谢中通路最多的为能量代谢(6条),含63条下调转录本.能量代谢中与光合作用相关的下调转录本最多,为29条.通过分析找到2条与β-胡萝卜素生物合成相关通路(MVA/MEP途径及β-胡萝卜素合成途径),并发现通路的关键基因hmgs、dxs、dxr、psy、pds、chyb,对其进行差异表达分析,均不存在差异表达.研究表明,葡萄糖抑制了绿色杜氏藻光合作用,代谢受阻,但未影响β-胡萝卜素生物合成相关通路及关键基因.(本文来源于《中国生物化学与分子生物学报》期刊2015年08期）
潘益芳,龚一富,俞凯,朱帅旗,王何瑜[7]（2015）在《绿色杜氏藻DHDDS基因生物信息学分析及表达研究》一文中研究指出绿色杜氏藻是一种能产生重要次生代谢产物类胡萝卜素的单细胞绿藻,脱氢多萜醇焦磷酸合成酶(dehydrodolichyl diphosphate synthase,DHDDS)是其在类胡萝卜素合成途径中的相关酶。旨在研究DHDDS基因表达与类胡萝卜素含量之间的关系。提取绿色杜氏藻总RNA,通过转录组测序获得DHDDS基因全长,对该基因进行生物信息学分析;并用不同浓度甲基茉莉酸(Me JA)处理绿色杜氏藻,采用实时定量PCR研究该基因转录差异。结果显示,绿色杜氏藻DHDDS基因全长2 211 bp,含有一个1 740 bp长的开放阅读框(ORF),编码579个氨基酸序列。DHDDS蛋白质理论等电点为7.63,相对分子质量为62 472.7 Da。预测结果表明,DHDDS蛋白不含信号肽,也不存在跨膜区域,该蛋白定位于细胞质基质。氨基酸序列比对结果显示,绿色杜氏藻DHDDS蛋白与小球藻的同源性最高(59%)。实时定量PCR结果表明,经100μmol/L Me JA处理的绿色杜氏藻DHDDS表达水平最高,具有极显着差异;在该浓度下,类胡萝卜素含量均高于其他浓度组。且DHDDS基因的表达与类胡萝卜素含量呈一定的相关性。绿色杜氏藻DHDDS是一种定位于细胞质基质中的酶,其与绿色杜氏藻类胡萝卜素合成途径有关。在一定浓度范围的Me JA诱导下,低浓度的Me JA对其表达起促进作用,高浓度Me JA对其表达有抑制作用,且其表达与类胡萝卜素含量呈一定的相关性。(本文来源于《生物技术通报》期刊2015年07期）
朱帅旗,龚一富,杭雨晴,刘浩,王何瑜[8]（2015）在《绿色杜氏藻转录组分析》一文中研究指出为了深入了解绿色杜氏藻(Dunaliella viridis)基因信息及功能、耐盐相关通路(甘油脂代谢)及关键酶,本文首次通过Illumina Hi SeqTM 2000高通量测序技术对绿色杜氏藻转录组进行测序,利用Trinity软件将数据组装形成转录本,对所有转录本进行COG(Clusters of Orthologous Groups)、GO(Gene Ontology)和KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)分类和功能注释、Pathway注释以及蛋白编码区(Opening reading fragment,ORF)的预测,并对甘油脂代谢通路关键酶基因进行了分析。转录组测序共获得81 593个转录本,其中ORF共有77 117条,约占所有转录本的94.50%。COG分类结果表明,16 569条转录本被分为24个类别。GO分类结果表明,76 436条转录本被注释。在所有注释分类中,生物学过程转录本数量最多,为30 678条,占总转录本数的40.14%。KEGG分析结果表明,317个标准途径中包含26 428条转录本,含转录本最多的类别是代谢,为9949条(37.65%)。与代谢有关的途径为131条,占所有注释途径的41.32%。在甘油脂代谢通路中仅发现1条关键酶转录本(二羟丙酮激酶),该酶可能与绿色杜氏藻耐盐胁迫中甘油的合成有较大关系。本研究进一步完善了绿色杜氏藻的基因信息,为绿色杜氏藻代谢途径研究奠定了坚实的基础。(本文来源于《遗传》期刊2015年08期）
陈琴,曹张磊,张福[9]（2013）在《秸秆,米糠发酵液对极端嗜盐绿色杜氏藻生长的影响》一文中研究指出极端嗜盐绿色杜氏藻是迄今发现的最耐盐的真核光合生物,内含丰富的多种活性物质,受到了国内外学者的广泛关注。对极端嗜盐绿色杜氏藻的营养强化进行探讨,以秸秆和米糠的发酵液作为营养强化物质,用对比法研究发酵液含量及盐度对绿色杜氏藻生物量的影响。结果表明最适宜杜氏藻生长的含量是:秸秆和米糠的发酵液含量都为0.5mL/100mL;最适宜杜氏藻生长的盐度是:秸秆发酵液与米糠发酵液皆为15°Be',并且在同含量及同盐度下米糠发酵液更有利于极端嗜盐绿色杜氏藻的生长。(本文来源于《苏盐科技》期刊2013年01期）
张福,刘同慧[10]（2010）在《卤水Na~+/Mg~(2+),Cl~-/SO_4~(2-)比值对极端嗜盐绿色杜氏藻生长的影响》一文中研究指出极端嗜盐绿色杜氏藻是世界上迄今发现的最耐盐的真核光合生物,藻体内含有植物蛋白、脂肪酸、多糖、叶绿素、甘油等多种营养成分和生物活性物质,具有开发天然保健品或生物药品的应用前景、文章依据人工海水理论和方法,研究了水体Na+/Mg2+、Cl-/SO42-比值对极端嗜盐绿色杜氏藻生长的影响,从而探讨适合该藻类生长的化学环境。(本文来源于《盐业与化工》期刊2010年05期）
绿色杜氏藻论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
β-胡萝卜素羟化酶(β-carotenoid hydroxylase,CHYB)是植物类胡萝卜素生物合成途径中的一个重要限速酶。本研究对绿色杜氏藻转录组测序数据进行分析,获得2条β-胡萝卜素羟化酶家族基因chyb1和chyb2。采用染色体步移法分别克隆并获得了绿色杜氏藻chyb1和chyb2基因的启动子序列,全长分别为1080 bp(Gen Bank登录号:KY012338)和1155 bp(Gen Bank登录号:KY012339)。利用Plantcare软件分析两个启动子的顺式作用元件,结果表明绿色杜氏藻chyb1基因启动子含有与甲基茉莉酸、花生四烯酸、水杨酸等非生物胁迫相关的顺式作用元件,而绿色杜氏藻chyb2基因启动子含有与光照相关的顺式作用元件。通过q RT-PCR分析了绿色杜氏藻CHYB基因家族在不同胁迫下的基因表达水平,结果表明该基因家族的基因表达水平与启动子调控相关,且不同的家族基因应答不同的胁迫。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
绿色杜氏藻论文参考文献
[1].陈俊粤,龚一富,马颖瑞,周丽亚,王何瑜.绿色杜氏藻异戊烯基焦磷酸异构酶基因(DvIPI)的生物信息学与诱导表达分析[J].生命科学研究.2017
[2].朱帅旗,龚一富,章丽,俞凯,王何瑜.绿色杜氏藻不同β-胡萝卜素羟化酶基因家族胁迫应答模式研究[J].遗传.2017
[3].周静,龚一富,马颖瑞,刘浩,朱帅旗.绿色杜氏藻DvGGPS生物信息学及转录差异研究[J].核农学报.2017
[4].张燕,龚一富,景丹丹,朱帅旗,俞凯.绿色杜氏藻GGR基因生物信息学分析及表达研究[J].宁波大学学报(理工版).2017
[5].马颖瑞,龚一富,周静,刘浩,朱帅旗.绿色杜氏藻香叶基焦磷酸合成酶基因(GPS)生物信息学与诱导表达分析[J].核农学报.2017
[6].朱帅旗,龚一富,刘浩,章丽,王何瑜.葡萄糖诱导绿色杜氏藻转录组及相关通路差异分析[J].中国生物化学与分子生物学报.2015
[7].潘益芳,龚一富,俞凯,朱帅旗,王何瑜.绿色杜氏藻DHDDS基因生物信息学分析及表达研究[J].生物技术通报.2015
[8].朱帅旗,龚一富,杭雨晴,刘浩,王何瑜.绿色杜氏藻转录组分析[J].遗传.2015
[9].陈琴,曹张磊,张福.秸秆,米糠发酵液对极端嗜盐绿色杜氏藻生长的影响[J].苏盐科技.2013
[10].张福,刘同慧.卤水Na~+/Mg~(2+),Cl~-/SO_4~(2-)比值对极端嗜盐绿色杜氏藻生长的影响[J].盐业与化工.2010