汉族男性人群GLUT9基因启动子区痛风和高尿酸血症相关SNP位点筛查

论文摘要

目的探讨中国汉族男性群体GLUT9基因启动子区基因多态性与痛风和高尿酸血症易感性之间的关系。方法应用聚合酶链反应（PCR）技术,特异性扩增GLUT9基因第一外显子起始位点上游启动子区2000bp,并进行基因测序,分析基因型及频率。进行基因型-表型相关性分析,并预测基因多态性的改变对转录因子结合位点改变的影响。结果①共检测到GLUT9基因中21种SNP位点,其中5种以前未见报道。②rs13124007和rs6850166位点基因多态性与痛风易感性有关联性存在（p=0.009;p=0.042）.rs13124007位点C等位基因频率和痛风易感性相关（p=0.006,0R 1.709[95%CI1.162-2.514]）。痛风组rs6850166位点A等位基因频率高于正常对照组（p=0.029,0R 1.645[95%CI 1.050-2.577]）。单体型分析显示正常对照组单体型GG频率高于痛风组（p=0.0053）,而单体型CA与痛风易感性相关联（p=0.0326）。rs13124007位点C等位基因频率和rs6850166位点A等位基因频率和痛风石发生存在相关性（p=0.002,OR 2.191[95%CI 1.305-3.679];p=0.046,0R 1.864[95%CI1.002-3.466]）。基因型-表型分析显示rs13124007位点和血清甘油三酯水平具有相关性（P=0.001）。rs13124007位点C等位基因代替G等位基因导致转录因子结合位点IRF-1的缺失。③rs78201117和rs13137343位点基因多态性和高尿酸血症易感性有关联性存在（P=0.007;P=0.045）。高尿酸血症组rs78201117位点A等位基因频率高于正常对照组（P=0.0078,0R 2.893[95%CI 1.278-6.549]）。单体型分析显示单体型AT与高尿酸血症易感性相关联（P=0.0062,0R 6.265[95% CI=1.396-28.113]）。rs78201117位点A等位基因代替G等位基因导致转录因子结合位点C/EBP delta和D1的缺失与新的转录因子结合位点Hb和Spl的产生。rs13137343位点T等位基因代替G等位基因导致转录因子结合位点NF-1的缺失与新的转录因子结合位点C/EBP alpha的产生。结论中国汉族男性人群中GLUT9基因启动子区rs13124007和rs6850166位点基因多态性与痛风易感性有关联性存在,而rs78201117和rs13137343位点基因多态性与高尿酸血症相关联。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 引言
• 第一章 材料和方法
• 1.1 研究对象
• 1.1.1 痛风组和正常对照组
• 1.1.2 高尿酸血症组和正常对照组
• 1.2 仪器、材料与实验试剂
• 1.2.1 主要仪器
• 1.2.2 主要试剂
• 1.3 实验方法
• 1.3.1 标本收集
• 1.3.2 外周血DNA的抽提
• 1.3.3 测定提取的DNA的0D值
• 1.3.4 扩增片段序列
• 1.3.5 引物
• 1.3.5.1 引物的设计
• 1.3.5.2 引物的稀释
• 1.3.6 PCR反应
• 1.3.6.1 PCR反应体系
• 1.3.6.2 PCR反应条件
• 1.3.7 PCR产物的电泳检测和基因型分析
• 1.4 统计学分析
• 1.5 转录因子结合位点预测
• 第二章 结果
• 2.1 基因多态性检测结果
• 2.1.1 PCR产物的电泳结果
• 2.1.2 PCR产物测序图
• 2.2 痛风组和正常对照组比较结果
• 2.2.1 临床资料和生化指标的比较
• 2.2.2 遗传分析
• 2.2.2.1 基因型频率和等位基因频率比较
• 2.2.2.2 单体型分析
• 2.2.3 基因型-表型分析
• 2.2.4 转录因子结合位点预测
• 2.3 高尿酸血症组和正常对照组比较结果
• 2.3.1 临床资料和生化指标的比较
• 2.3.2 遗传分析
• 2.3.2.1 基因型频率和等位基因频率比较
• 2.3.2.2 单体型分析
• 2.3.3 转录因子结合位点预测
• 第三章 讨论
• 结论
• 参考文献
• 综述
• 综述参考文献
• 攻读学位期间的研究成果
• 附录
• 致谢