儿童孤独症的分子遗传学研究 ——FMR1、SLC25A12、SCN2A2、NOTCH4基因多态性与儿童孤独症的关联研究

儿童孤独症的分子遗传学研究 ——FMR1、SLC25A12、SCN2A2、NOTCH4基因多态性与儿童孤独症的关联研究

论文摘要

孤独症是一种严重的广泛发育障碍性疾病,以社会交往障碍、兴趣与活动内容局限、刻板和重复行为为特征。多数起病于3岁以前,呈慢性病程,预后较差,不仅给患者本人造成终身的痛苦,而且给家庭和社会造成长期沉重的负担。因此,探索孤独症的病因并在基因水平上预防和治疗疾病是当前医学研究面临的重大课题。双生子及家系研究结果证实,遗传因素在孤独症发病中起着重要的作用,但并非经典的孟德尔单基因遗传疾病,属于多基因遗传的人类复杂性疾病。最近,基因组扫描研究认为2q24-33、6q16-21、7q31-33、X染色体区域与孤独症高度连锁。本研究以321名孤独症核心家系成员与850名正常对照为研究对象,采用7-deaza-dGTP PCR法和ALFred DNA测序法检测X染色体的FMR1基因CGG重复序列,分析FMR1基因CGG重复序列多态性与孤独症的关联性。以105个孤独症核心家系为研究对象,利用DHPLC法、PCR-SSCP法和直接测序法检测2q24-33染色体区域SLC25A12、SCN2A2基因4个SNPs的基因型,应用SSCP和UNPHASED统计软件进行基于家系的连锁不平衡分析。同时以323名孤独症核心家系成员和328名正常对照人群为对象,对SLC25A12基因rs3770448位点,进行病例-对照研究。另以中国北方地区汉族孤独症患儿24名和正常对照儿童30名为研究对象,利用PCR-RFLP法检测与脑发育相关的NOTCH4基因2个SNPs位点的基因型,分析与孤独症的关联性。试图寻找决定孤独症易感性的基因位点。本研究结果:(1) FMR1基因CGG重复序列扩展与孤独症未见有关联。虽然在孤独症组可见到,等位基因位点分布的偏移和频率的改变,但是都没有达到统计学显著性差异。(2)本研究所应用的抽样群体符合Hardy-Weinberg平衡。(3) SLC25A12基因rs3770448位点的病例-对照研究结果表明,该位点的等位基因及基因型分布与孤独症有关联,同时其等位基因分布与孤独症双亲组和父亲组也有关联。提示SLC25A12基因与孤独症及其家系有关联。(4)基于家系的连锁不平衡研究结果表明,SLC25A12基因的rs3770448 T/C和rs3765166 G/A、SCN2A2基因的rs997508 C/T和rs3769955 T/C等位基因及基因型分布与孤独症无关联。(5) rs3770448-rs3765166单倍型系统可能含有孤独症的易感基因位点或者与孤独症抗性基因紧密连锁。提示SLC25A12基因附近可能存在孤独症相关基因。(6)rs3769955-rs3770448-rs3765166单倍型系统可能含有孤独症的易感基因位点或者与孤独症抗性基因紧密连锁。提示SCN2A2基因及SLC25A12基因附近可能存在孤独症相关基因。(7)未发现NOTCH4基因的rs367398(G/A)和rs520688(A/G)位点与孤独症相关联。这些结果提示,SLC25A12基因是孤独症相关基因,而且2q24-33染色体区域可能存在多个决定孤独症易感性的突变位点。而FMR1基因CGG重复序列与孤独症无关联;NOTCH4基因与孤独症的相关性尚需进一步研究。

论文目录

  • 前言
  • 英文编写
  • 第一章 文献综述
  • 1. 人类基因组计划
  • 2. 单核苷酸多态性
  • 3. 儿童孤独症
  • 第二章 FMR1基因CGG重复序列多态性与孤独症的关联研究
  • 材料与方法
  • 1. 主要试剂
  • 2. 仪器
  • 3. 器材
  • 4. 研究对象
  • 5. 引物设计
  • 6. CGG 重复序列的扩增
  • 7. 基因型检测
  • 8. 统计分析
  • 实验结果
  • 1. FMR1 基因的 CGG 重复序列的扩增结果
  • 2. 基因型分布
  • 3. 孤独症患儿组与父母组和正常人群组的 CGG 多态性的比较
  • 4. 孤独症患儿组与父母组和正常人群组的 CGG 多态性位点的比较
  • 讨论
  • 1. FMR1 基因与儿童孤独症
  • 2. FMR1基因(CGG)n重复序列的检测方法
  • 小结
  • 第三章 SLC25A12、SCN2A2、NOTCH4 基因单核苷酸多态性与孤独症的关联研究
  • 材料与方法
  • 1. 主要试剂
  • 2. 器材
  • 3. 仪器
  • 4. 研究对象
  • 5. 引物设计
  • 6. DNA 提取
  • 7. PCR 扩增
  • 8. 基因分型
  • 9. 建立数据库
  • 10. 统计学处理
  • 实验结果
  • 1. 遗传标记的选择
  • 2. 等位基因及基因型频率
  • 3. Hardy-Weinberg平衡检验结果
  • 4. 遗传标记之间连锁不平衡程度的检验
  • 5. SNPs 与孤独症相关性分析
  • 6. NOTCH4 基因与孤独症相关性分析
  • 讨论
  • 1. 人类2 号染色体与孤独症
  • 2. NOTCH4 基因
  • 3. SNP 检测方法与分析方法的选择
  • 小结
  • 第四章 孤独症分子遗传学研究的几点启示
  • 1. 孤独症的研究现状
  • 2. SNPs 与孤独症的关联性
  • 3. 孤独症的遗传异质性
  • 4. 今后研究方向
  • 结论
  • 参考文献
  • 作者简介
  • 中文摘要
  • 英文摘要
  • 致谢
  • 相关论文文献

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