FSHβ基因和FSHR基因多态性及其对小尾寒羊产羔数的遗传效应

论文摘要

本研究以绵羊中产羔数各不相同的小尾寒羊87只、藏羊28只、甘肃高山细毛羊30只、特克塞尔27只和陶蒙杂种40只为试验材料,采用单链构象多态性（SSCP）分析方法对5个绵羊群体FSHβ基因CDS区（外显子2和外显子3）和FSHR基因外显子10进行单核苷酸多态性检测,探索FSHβ基因CDS区和FSHR基因外显子10在不同绵羊群体中的遗传多态性,并进而分析其对小尾寒羊产羔数的遗传效应,为“1胎多羔”绵羊品种（品系）选育提供有效的分子遗传标记。结果如下:①FSHβ基因外显子2在5个绵羊群体中都存在遗传多态性而外显子3和FSHR基因外显子10无多态性。②BB基因型和AA基因型相比在外显子2第147处有1个T→C的单碱基突变,但未引起氨基酸改变。③独立性检验表明基因型频率分布在5个群体间有一定的差异;Hardy-Weinberg平衡检验显示,除特克塞尔外,其余4个群体都处于平衡状态;各绵羊群体的多态信息含量均为中度多态（0.25<PIC<0.5）。④研究表明:FSHβ基因可能是控制小尾寒羊多羔性能的一个主效基因或与之存在紧密连锁的一个遗传标记,AA基因型可能具有增加绵羊产羔数的作用。因此利用FSHβ基因进行标记辅助选择来提高绵羊产羔数是有一定根据的。⑤基于绵羊、山羊、黄牛等10个物种FSHβ基因CDS区序列,构建NJ树和ME树。结果表明两种类型的树拓扑结构完全相同并都具有较高的Bootstrap值（大于70）,将建树结果与动物界的演化树比较,分类学上的近缘物种分别聚在一起。⑥绵羊FSHR基因外显子10序列与山羊、牛、小鼠、猪和人相应的序列做了比对,发现绵羊与山羊的同源性最高,其次为牛、猪和人,与小鼠的同源性最低。

论文目录

• 摘要
• Summary
• 第一章 文献综述
• 1. 小尾寒羊研究概况
• 2. 绵羊多羔性研究进展
• 2.1 国内外多羔绵羊品种的繁殖性状
• 2.2 绵羊多羔的内分泌机制
• 2.3 在基因组水平上对绵羊多羔遗传机制的研究
• 3. 促卵泡素β亚基（follicle-stimulating hormone β, FSHβ）基因的研究进展
• 3.1 促卵泡素（FSH）研究进展
• 3.2 促卵泡素β亚基基因研究进展
• 4. 促卵泡素受体（FSHR）研究进展
• 4.1 FSHR 的分子结构及其功能
• 4.2 FSHR 基因
• 4.3 FSHR 的表达及调控
• 4.4 FSHR 基因多态性与动物繁殖性能的关系
• 5. PCR-SSCP 技术
• 5.1 PCR-SSCP 的产生和建立
• 5.2 PCR-SSCP 技术原理
• 5.3 PCR-SSCP 的特点
• 6. 本研究的意义和内容
• 第二章 FSHβ基因和FSHR 基因多态性检测及序列分析
• 1. 材料和方法
• 1.1 试验材料
• 1.2 主要试剂
• 1.3 主要仪器设备
• 1.4 分析工具软件
• 1.5 溶液试剂配制
• 2. 主要试验步骤
• 2.1 绵羊血液DNA 的提取
• 2.2 PCR-SSCP 过程
• 2.3 FSHβ基因和FSHR 基因部分序列的克隆和测序
• 3. 统计方法
• 3.1 基因型频率
• 3.2 基因频率
• 3.3 基因型的独立性检验
• 3.4 基因位点 Hardy-Weinberg 平衡状态的检验
• 3.5 群体内遗传变异的度量指标—杂合度
• 3.6 有效等位基因数
• 3.7 多态信息含量
• 3.8 FSHβ基因和FSHR 基因基因型与小尾寒羊产羔数关系的研究
• 第三章 结果与分析
• 1. PCR-SSCP 多态性检测结果
• 1.1 FSHβ基因CDS 区外显子2 的PCR-SSCP 多态性检测结果
• 1.2 FSHβ基因CDS 区外显子3 的PCR-SSCP 多态性检测结果
• 1.3 FSHR 基因外显子10 的PCR-SSCP 多态性检测结果
• 2. 克隆与序列分析
• 2.1 FSHβ基因外显子2 扩增片断测序结果
• 2.2 FSHβ基因外显子3 阳性克隆鉴定结果
• 2.3 绵羊FSHβ基因CDS 区同源性比较及系统发育树绘制
• 2.4 FSHR 基因外显子10 序列分析
• 3. FSHβ基因外显子2 群体遗传学分析
• 3.1 FSHβ基因外显子2 基因频率和基因型频率在不同绵羊群体中的分布
• 3.2 FSHβ基因外显子2 基因型分布独立性检验
• 3.3 FSHβ基因外显子2 Hardy-Weinberg 平衡检验
• 3.4 FSHβ基因外显子2 的遗传特性
• 3.5 FSHβ基因外显子2 不同基因型小尾寒羊产羔数的最小二乘均值
• 第四章 讨论
• 1. 实验材料的选择
• 2. 血液采集及DNA 提取
• 3. 影响PCR 扩增的因素
• 3.1 引物的设计
• 3.2 模板的质量
• 3.3 引物的浓度
• 3.4 Tm 值
• 3.5 Taq DNA 聚合酶
• 4. 影响SSCP 检出的因素
• 4.1 PCR 的质量
• 4.2 PCR 片断的长度
• 4.3 非变性聚丙烯酰胺凝胶成分
• 4.4 温度和电压
• 5. SSCP 结果的检测
• 6. 绵羊FSHβ基因和FSHR 基因遗传特性的分析
• 6.1 绵羊FSHβ基因遗传特性的分析
• 6.2 系统发育树的构建及其结果
• 6.3 FSHR 基因遗传特性的分析
• 7. 绵羊FSHβ基因和FSHR 基因多态性与小尾寒羊产羔数的相关性分析
• 7.1 绵羊FSHβ基因多态性与小尾寒羊产羔数的相关性分析
• 7.2 绵羊FSHR 基因多态性与小尾寒羊产羔数的相关性分析
• 第五章 结论
• 致谢
• 参考文献
• 作者简介
• 导师简介
• 附录A FSHβ基因CDS 区外显子2AA 基因型序列图
• 附录B FSHβ基因CDS区外显子2BB基因型序列图