从核rDNA与16S rDNA序列探讨隙蛛亚科Coelotinae的分类地位

从核rDNA与16S rDNA序列探讨隙蛛亚科Coelotinae的分类地位

论文摘要

本研究基于核rDNA与16S rDNA部分序列探讨了隙蛛亚科的分类地位,并对蜘蛛类16S rDNA3′端二级结构进行了研究。 1 核基因与线粒体基因在蜘蛛类系统发生中的应用 核基因与线粒体基因在生物进化过程中不断积累着变异,能够提供物种进化历史的精确信息。本文综述了核基因与线粒体基因在蜘蛛类系统发生中的应用情况。 2 漏斗蛛科与暗蛛科研究概况 漏斗蛛科与暗蛛科是蜘蛛目的两个重要类群。本文简要地介绍了漏斗蛛科与暗蛛科的研究历史、形态特征和生物学特性。 3 从核rDNA序列探讨隙蛛亚科的分类地位 隙蛛亚科Coelotinae原隶属于漏斗蛛科Agelenidae,现已转入暗蛛科Amaurobiidae。关于隙蛛亚科究竟隶属于漏斗蛛科抑或暗蛛科仍存在疑义。我们测定了隙蛛亚科2属、漏斗蛛亚科2属、暗蛛亚科1属和管巢蛛科1属的核28S rDNA和18S rDNA部分序列,选用狒蛛科Theraphosidae为外群,进行系统发生分析。基于28S rDNA和18S rDNA+28S rDNA序列重建的NJ树、MP树、ML树和BI树均支持隙蛛亚科是漏斗蛛亚科的姐妹群,并强烈支持隙蛛亚科+漏斗蛛亚科是暗蛛亚科的姐妹群。基于18S rDNA序列分析所得树的拓扑结构与28S rDNA序列的相似,但置信度偏低。因此,我们认为隙蛛亚科Coelotinae可能是漏斗蛛科Agelenidae的一个亚科。 4 蜘蛛类16S rDNA部分序列高变区二级结构分析及在系统发生重建中的应用

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 第一章 核基因与线粒体基因在蜘蛛类系统发生中的应用
  • 1 核rDNA
  • 2 mt DNA
  • 3 其它核基因
  • 4 结论
  • 5 参考文献
  • 第二章 漏斗蛛科与暗蛛科研究概况
  • 1 世界漏斗蛛科与暗蛛科的研究简史
  • 2 中国漏斗蛛科与暗蛛科的研究简史
  • 3 漏斗蛛科与暗蛛科生物学特征
  • 3.1 漏斗蛛科的生物学特征
  • 3.2 暗蛛科的生物学特征
  • 3.2.1 暗蛛科暗蛛亚科的生物学特征
  • 3.2.2 暗蛛科隙蛛亚科的生物学特征
  • 4 结论
  • 5 参考文献
  • 第三章 从核rDNA序列探讨隙蛛亚科Coelotinae的分类地位
  • 1 研究材料
  • 2 研究方法
  • 2.1 DNA提取
  • 2.2 引物的设计与PCR反应
  • 2.3 PCR产物的纯化与测序
  • 2.4 序列分析
  • 3 结果
  • 3.1 18S rDNA序列与系统发育分析结果
  • 3.2 28S rDNA序列与系统发育分析结果
  • 3.3 18S与28S rDNA两序列结合的分析
  • 4 讨论
  • 5 参考文献
  • 第四章 蜘蛛类16S rDNA部分序列高变区二级结构分析及在系统发生中的应用
  • 1 实验研究
  • 1.1 DNA抽提
  • 1.2 引物的设计与16S rDNA的扩增与测序
  • 1.3 序列分析
  • 2 结果
  • 2.1 高变区二级结构的进化
  • 2.2 系统发生分析
  • 3 讨论
  • 3.1 高变区二级结构的进化趋势
  • 3.2 蜘蛛类16S rDNA的系统发生
  • 4 参考文献
  • 致谢
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