导读:本文包含了全基因组扫描法基因定位论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:糖尿病肾病,全基因组扫描,易感基因定位,KK,Ta小鼠
全基因组扫描法基因定位论文文献综述
范秋灵,阎雪晶,李艳秋,姚丽,李子龙[1]（2012）在《全基因组扫描2型糖尿病KK/Ta小鼠白蛋白尿易感基因定位》一文中研究指出目的利用全基因组扫描方法进行2型糖尿病KK/Ta小鼠白蛋白尿易感基因定位。方法以近交纯品系雌性BALB/c小鼠与雄性KK/Ta小鼠交配建立第一代杂交小鼠(F1),以雄性(KK/Ta×BALB/c)F1小鼠与雌性KK/Ta小鼠回交。提取208只雄性回交小鼠基因组DNA。根据扩增的101个微卫星DNA分离片段大小决定回交小鼠基因型,同时测定体质量、血糖、尿白蛋白及尿肌酐等表现型。采用基因定位专用软件(MAPMAKER/QTL,Map manager)进行数量性状位点(QTL)分析。结果 KK/Ta小鼠的体质量、空腹血糖水平、经腹腔葡萄糖耐量试验空腹与注射葡萄糖后2 h血糖之和显着高于BALB/c和F1小鼠(P<0.01)。20,28周龄的KK/Ta小鼠平均尿白蛋白水平显着高于BALB/c和F1小鼠(P<0.01)。20周龄与28周龄的白蛋白尿水平与第2条染色体83.0 cM D2Mit311微卫星DNA标记附近区域显着连锁,最大对数优势积分值(LOD)为3.5,我们将这一易感基因座位命名为尿白蛋白1(UA-1)。KK/KK组回交小鼠20周龄和28周龄的尿白蛋白水平显着高于KK/BALB组回交小鼠。结论与2型糖尿病KK/Ta小鼠尿白蛋白水平紧密连锁的易感基因座位位于第2条染色体83.0 cM处D2Mit311微卫星DNA标记附近区域(UA-1)。UA-1区域附近的生长激素释放激素基因GHrH、生长抑素受体4基因Smstr4、血栓调节蛋白(TM)基因Thbd等为糖尿病肾病的可能易感基因。(本文来源于《中国医科大学学报》期刊2012年04期）
布娟,杨建军,李宁东,杨永佳,赵堪兴[2]（2009）在《先天性白内障一家系全基因组扫描基因定位及候选基因序列分析》一文中研究指出目的应用全基因组扫描、连锁分析的方法对常染色体显性遗传性先天性白内障(ADCC)一家系进行基因定位、寻找候选基因并进行突变筛查。方法提取该家系成员外周血DNA,进行全基因组扫描。在ABI 3130-avant全自动遗传分析仪上读取370对微卫星标记物的等位基因片段大小,并采用Genescan 3.1和Genotyper 2.0软件进行两点法计算LOD值并构建单体型。根据连锁分析的结果,对该区域内在晶状体中呈高表达,且对维持晶状体纤维细胞的分化状态起重要作用的基因-BFSP1进行直接的序列分析。结果该家系的致病基因位于20p12~20p11.2的13.96 cm区域内。在该区域内的基因-BFSP1全部外显子及外显子与内含子交界处均未发现任何突变。结论首次将一常染色体显性遗传绕核型先天性白内障家系的致病基因定位于20p12~20p11.2的13.96 cm区域内。(本文来源于《眼科研究》期刊2009年10期）
黄进贤,古洁若[3]（2006）在《强直性脊柱炎家系全基因组扫描基因定位的荟萃分析》一文中研究指出目的综合分析强直性脊柱炎(ankylosing spondylitis,AS)家系的全基因组扫描基因定位的结果,探讨进一步研究和确定AS的遗传易感位点的思路和方法。方法采用基因组寻证荟萃分析(genome search meta analysis,GSMA)法,对符合该方法分析的4个AS家系的全基因组扫描结果包括参数连锁分析和非参数连锁分析的结果进行分析。根据连锁分析的最大值被赋值并按降序排列,从而计算出总的等级分值(Rsumrnk)。根据每个研究的受累个体数进行加权GSMA对结果进行修正。本研究共有479个家系,1151例AS患者。总的等级分析概率(Psumrnk)和有序的等级分析概率(Pord)<0.05被认为可能含有易感区域;GSMA Psumrnk<0.000417时,被认为在全基因组连锁中有显着意义。结果GSMA显示10组结果的Psumrnk和Pord均小于0.05,表明这些组内最可能含有AS的易感基因位点,这些组分别是6.2、16.3、6.1、3.3、6.3、16.4、10.5、17.1、2.5、2.9。GSMA生成的具有显着意义的全基因组连锁分析的证据位于6p22.3-p21.1(BIN6.2,Psumrnk<0.000417),包含HLA位点。结论本GSMA研究进一步证实了HLA位点是AS的主要易感区域,并初步提供非HLA区域包括16q,3p,10q,2p,17p和2q证据。(本文来源于《现代临床医学生物工程学杂志》期刊2006年06期）
金迎[4]（2002）在《中国汉族Graves病的全基因组扫描基因定位研究及家系流行病学调查》一文中研究指出Graves病(Graves' disease，GD)是一种常见的器官特异性自身免疫病，是自身免疫甲状腺病(Autoimmune thyroid disease，AITD)之一。遗传因素在本病的发生中起重要作用。但是，GD并不遵循典型的孟德尔式遗传，其遗传易感性可能由多个外显率不同的基因所决定，并受环境因素的影响，这就给GD易感基因的研究带来了很大困难。尽管进行了大量的研究，但GD发病的遗传学机制至今尚未阐明。目前对GD易感基因的研究绝大多数为关联研究，所研究的候选基因为可能参与GD自身免疫过程的相关基因。然而，仅人类白细胞抗原(Human leukocyte antigen，HLA)基因和细胞毒性T淋巴细胞相关抗原-4(Cytotoxic T lymphocyte associatedantigen-4，CTLA-4)基因与GD的相关性得到了较为普遍的认可。但是，关联研究所确定的相关基因有可能是在疾病总的遗传易感性中所起作用较小的基因。连锁分析则是确定疾病主要易感基因的最有效途径。对HLA及CTLA-4基因与GD连锁关系的研究所得结论不一，有研究表明CTLA-4和HLA基因与GD相连锁，也有的研究得出与之相反的结论，这种研究结果的不一致可能是各研究对象的遗传背景不同所致。一项对白种人的研究表明染色体20q11区与GD相连锁，提示该区域存在主要的GD易感基因。为了确定中国人GD的主要易感位点，并研究CTLA-4基因所在的2q31-q33区、HLA基因所在的6p21区、以及染色体20q区是否存在与中国人GD相连锁的位点，我们对54个中国北方汉族GD多发家系进行了全基因组扫描连锁分析研究，并对上述叁个染色体区进行了仔细筛查。碘是人体所必需的微量元素，是合成甲状腺激素的主要原料。一些流行病学调查提示碘摄入量与AITD的发病率和甲状腺自身抗体的产生明显相关；过量的碘摄入影响已患AITD者的病程和治疗。动物实验也表明，碘摄入量增加能加重具有遗传倾向的AITD动物模型的自身免疫性甲状腺炎。但是，目前尚无碘对于具有明确AITD遗传倾向人群作用的文献报道。另一方面，对于GD多发家系这样具有高度遗传易感性的人群，甲状腺自身抗体与功能异常的发生情况如何，目前尚不清楚。针对这些问题，我们调查了GD多发家系成员中甲状腺自身抗体与功能异常的发生情况，并研究了碘摄人量对GD发病率和甲状腺自身抗体产生的影响。方法 1.全基因组扫描。采用277个微卫星筛查54个GD多发家系(322名个体，其中GD患者139人)，这些微卫星覆盖了22条常染色体和X染色体，其平均间距为13.4厘摩(centimorgan，。M)，平均杂合度为71%，均选自Genethon连锁图。抽取所有受试者的静脉血，以酚一氯仿法抽提基因组DNA。以基因组DNA为模板，采用复合PCR的方法扩增目的片断。PcR产物由MegaBASE 1000 DNA测序仪检测。基因分型采用Genetic Profiler软件。连锁分析采用参数法与非参数法连锁分析。在参数法连锁分析中:两点LoD(肠g;。of the。ddsfor link娜)值的计算采用llNKAGE软件。设定疾病呈显性或隐性遗传湿性遗传的外显率设为30%、60%和90%，隐性遗传的外显率设为30%、60%、90%和100%;GD的人群患病率设为1%，设定Hardy一Weinberg平衡，根据计算时所采用的遗传方式和外显率调整疾病基因频率;微卫星的等位基因频率由家系资料计算。由于本研究中两点LoD值呈阳性(LOD>0.1)的位点其最大LoD值均出现于重组率(e)>0处，提示遗传异质性的存在，故我们应用GENEHUNTER软件中的遗传异质性检验，计算在存在遗传异质性的情况下，各阳性位点的两点及多点LoD值，参数设定同各微卫星取得最大两点LoD值的参数。同时计算各位点的多点非参数连锁(Nonparametrie link娜，NPL)值。 2.为了确定染色体Zq31一够3、6衅1及20q区是否也存在与中国人GD相连锁的位点，我们对这叁个区域进行了仔细筛查。两点LOD值的计算采用llNKAGE软件，分别计算疾病在呈显性及隐性遗传，外显率分别为30%、50%、70%、和90%时，疾病位点与微卫星的重组率分别为O、0.1、0.2、0.3、0.4、0.5时各微卫星的两点LoD值。多点LOD值的计算采用GENEHUN，rER软件，分别计算在上述遗传方式及外显率下，各微卫星的多点LoD值。同时应用 GENEHuNTER中的遗传异质性检验，计算在存在遗传异质性的情况下，各位点的多点LOD值。疾病基因频率及微卫星的等位基因频率计算方法同上。多点NPL值的计算采用GENEHUN咒R软件。为了估价本组家系资料检测连锁的能力，我们采用SIMUNK软件模拟了54x100个与本研究完全相同的家系。疾病基因频率与外显率的设定同参数法连锁分析。计算结果表明，本组家系资料在每种遗传模式下均足以检测连锁:当微卫星与疾病位点间的重组率为0.01时，可得到的平均最大LOD值为6.4(隐性遗传、外显率为30%时)到l8.6(显性遗传、外显率为90%时);当微卫星与疾病位点间的重组率为0.05时，可得到的平均最大LOD值为3.6(隐性遗传、外显率为30%时)到9.2(显性遗传、外显率为90%时);模拟运算还表明，本组家系资料有能力在巧cM的范围内拒绝连锁。我们所选用的覆盖上述叁个区域的微卫星的最大间距均在15cM以下，故若这些微卫星均不与GD相连锁，我们可以排除这些区域存(本文来源于《中国医科大学》期刊2002-03-01）
张安平,张学军,朱文元[5]（2001）在《疾病相关基因定位的全基因组扫描策略与方法》一文中研究指出人类疾病均直接或间接与基因有关 ,复杂性状的多基因疾病相关基因的定位和遗传分析是近年来医学遗传学研究的热点和难点。全基因组扫描策略在此发挥了重要作用。(本文来源于《疾病控制杂志》期刊2001年02期）
全基因组扫描法基因定位论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
目的应用全基因组扫描、连锁分析的方法对常染色体显性遗传性先天性白内障(ADCC)一家系进行基因定位、寻找候选基因并进行突变筛查。方法提取该家系成员外周血DNA,进行全基因组扫描。在ABI 3130-avant全自动遗传分析仪上读取370对微卫星标记物的等位基因片段大小,并采用Genescan 3.1和Genotyper 2.0软件进行两点法计算LOD值并构建单体型。根据连锁分析的结果,对该区域内在晶状体中呈高表达,且对维持晶状体纤维细胞的分化状态起重要作用的基因-BFSP1进行直接的序列分析。结果该家系的致病基因位于20p12~20p11.2的13.96 cm区域内。在该区域内的基因-BFSP1全部外显子及外显子与内含子交界处均未发现任何突变。结论首次将一常染色体显性遗传绕核型先天性白内障家系的致病基因定位于20p12~20p11.2的13.96 cm区域内。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
全基因组扫描法基因定位论文参考文献
[1].范秋灵,阎雪晶,李艳秋,姚丽,李子龙.全基因组扫描2型糖尿病KK/Ta小鼠白蛋白尿易感基因定位[J].中国医科大学学报.2012
[2].布娟,杨建军,李宁东,杨永佳,赵堪兴.先天性白内障一家系全基因组扫描基因定位及候选基因序列分析[J].眼科研究.2009
[3].黄进贤,古洁若.强直性脊柱炎家系全基因组扫描基因定位的荟萃分析[J].现代临床医学生物工程学杂志.2006
[4].金迎.中国汉族Graves病的全基因组扫描基因定位研究及家系流行病学调查[D].中国医科大学.2002
[5].张安平,张学军,朱文元.疾病相关基因定位的全基因组扫描策略与方法[J].疾病控制杂志.2001