导读:本文包含了启动子因子论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:水稻(Oryza,sativa),GLK转录因子,启动子,多态性
启动子因子论文文献综述
文苏麟[1](2019)在《水稻转录因子GLK的启动子多态性及基因表达模式分析》一文中研究指出GLK转录因子隶属于GARP家族,广泛存在于高等植物中,其编码的转录因子能够起到促进叶绿体发育的调控机制,水稻中有一对GLK基因,分别为OsGLK1与OsGLK2。为深入探究该基因的功能,本文克隆了水稻中OsGLK2的启动子序列,并对水稻GLK基因的表达进行分析。在OsGLK2启动子上发现了8个TATA-box,13个CAAT-box,5个G-box位点;不同水稻种质上OsGLK2基因启动子存在很大多态性,OsGLK1及OsGLK2主要在叶子及根中表达,不同种质间的表达差异明显,3个基因型的表达量明显低于及其他样;分析发现CAAT-box是影响OsGLK2表达量的调控位点。(本文来源于《山地农业生物学报》期刊2019年05期)
张右迁,李靖远[2](2019)在《O~6-甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移酶启动子甲基化与表皮生长因子受体基因表达对胶质母细胞瘤预后影响研究》一文中研究指出目的探讨O~6-甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移酶(MGMT)启动子甲基化与表皮生长因子受体(EGFR)基因表达对胶质母细胞瘤患者预后的影响。方法收集葫芦岛中心医院和医联体医院神经外科研究所2010—2015年收治的57例胶质母细胞瘤患者的胶质母细胞瘤标本,对肿瘤标本进行基因检测;随访12个月,观察患者预后情况。结果 57例患者中,MGMT启动子甲基化阳性者24例(42.1%),阴性者33例(57.9%);EGFR基因表达阳性者49例(86.0%),阴性者8例(14.0%)。12个月后,24例MGMT启动子甲基化阳性者中,15例存活,存活率为62.5%(15/24),33例阴性者中,11例存活,存活率为33.3%(11/33),差异有统计学意义(P<0.05);49例EGFR基因表达阳性者中,20例存活,存活率为40.8%(20/49),8例阴性者中,6例存活,存活率为75.0%(6/8),差异有统计学意义(P<0.05)。结论 MGMT启动子甲基化与EGFR基因表达影响胶质母细胞瘤患者预后,可作为预后判断的参考指标。(本文来源于《临床军医杂志》期刊2019年09期)
杨涛,许厚强,陈伟,周迪,王圆圆[3](2019)在《牛MSTN启动子与MEF2C转录因子相互作用的研究》一文中研究指出旨在解析牛MSTN启动子与MEF2C之间的相互调控作用,进一步探讨MSTN基因在肉牛肌肉生长发育方面的调控机制。首先,通过PCR扩增关岭牛MSTN启动子序列2 267 bp和MEF2C基因CDS区1 425 bp。其次,构建pGL3-Basic-MSTN和pcDNA3.1(+)-MEF2C双荧光素酶报告载体,采用脂质体法共转染至小鼠C2C12成肌细胞,24 h后检测其双荧光素酶活性。最后,通过PCR扩增MSTN启动子核心片段MSTN-P1,重新构建以MSTN-P1片段替代(CMV)区的重组表达载体pEGFP-N3-MSTN-P1-MEF2C,将其分别转染至小鼠C2C12成肌细胞和大鼠下颌腺上皮细胞,24 h后观察绿色荧光蛋白发光情况,48 h后提取细胞总RNA,利用qRT-PCR检测MEF2C基因在不同细胞中的表达情况。结果显示,在小鼠C2C12成肌细胞中,共转染pcDNA3.1(+)-MEF2C试验组较pGL3-Basic-MSTN试验组能显着增强MSTN启动子的活性(P<0.05),较pGL3-Basic对照组能极显着增强MSTN启动子的活性(P<0.01);MSTN启动子核心片段MSTN-P1能驱动MEF2C基因在小鼠C2C12成肌细胞中的表达量极显着上调(P<0.01),且能驱动MEF2C基因在大鼠下颌腺上皮细胞中的表达量显着上调(P<0.05)。结果表明,在转录水平,MSTN启动子与MEF2C可能同时参与了牛肌肉生长和分化的调控。(本文来源于《畜牧兽医学报》期刊2019年08期)
杨涛[4](2019)在《牛MEF2家族转录因子与MSTN启动子相互作用的机制研究》一文中研究指出肌肉组织是畜禽机体重要的组成部分之一,探究肌肉生长发育的调控机制,对于提高畜禽品种的肌肉产量和改善畜禽生长性状等都具有重要意义。肌肉生长抑制素(Myostatin,MSTN)又称GDF8(Growth differentiation factor 8,GDF8),是一种负调控骨骼肌生长和分化的主效基因。MSTN基因的超量表达会导致动物肌肉萎缩,而抑制或敲出MSTN基因会导致动物的肌肉肥大,产生“双肌”现象。肌细胞增强因子2(Myocyte enhancer factor 2,MEF2)属于MADS超基因家族,主要由(MEF2A、MEF2B、MEF2C、MEF2D)4个成员构成。MEF2家族转录因子能特异性的识别并结合与肌肉调控相关的启动子,从而调节动物肌肉的生长发育。本文试图通过研究MSTN启动子和转录因子间的相互作用,阐明MSTN基因表达的调控机制。本研究以贵州地方黄牛为研究对象,采用实时荧光定量PCR检测MSTN基因在4个贵州地方黄牛(心脏、肝脏、脾脏、肺脏、肾脏、脂肪、背最长肌)7个组织中的表达量;将成功构建的pGL3-Basic-MSTN和pcDNA3.1(+)-MEF2A(M EF2B、MEF2C、MEF2D)真核表达载体分别共转染至小鼠C2C12细胞,24 h后,检测其双荧光素酶活性;重新构建的以启动子核心片段MSTN-P1替代(C MV)区的pEGFP-N3-MSTN-P1-MEF2C重组真核表达载体转染小鼠C2C12细胞和大鼠下颌腺上皮细胞,12~24小时后,观察细胞所发出绿色荧光的情况,初步验证MSTN-P1核心启动子片段启动MEF2C基因在细胞中的表达水平。48 h后,采用qRT-PCR检测MEF2C基因在小鼠C2C12细胞和大鼠下颌腺上皮细胞中的表达量,进一步验证MSTN基因启动子对MEF2C基因在转录水平的调控作。研究结果如下:(1)MSTN基因在4种贵州地方黄牛7个组织中均有表达,在背最长肌中表达量最高,在部分组织中的表达因品种不同而存在差异。(2)MSTN启动子有启动活性,且MEF2C能明显增强MSTN启动子活性,而MEF2A、MEF2B、MEF2D对MSTN启动子活性影响不大。(3)MSTN-P1启动子片段对MEF2C基因在小鼠C2C12细胞和大鼠下颌腺上皮细胞中mRNA表达量有正向调控作用,说明MSTN启动子能启动MEF2C基因在细胞中的表达。(4)MEF2C基因能正向调控MSTN启动子的转录活性。(本文来源于《贵州大学》期刊2019-06-01)
冯肖莉[5](2019)在《盐穗木转录因子HcSCL13启动子活性及盐响应调控机制的初探》一文中研究指出作为固着生物,植物在其整个生活史中面临多种环境压力。其中,盐分是显着影响植物生长及产量的不良环境因素之一。GRAS作为植物特有的转录因子,在植物的生长发育和非生物胁迫中发挥重要作用。当植物暴露于高盐环境下,细胞质膜上的受体感知信号,继而通过胞内信号转导在启动子水平对GRAS等转录因子进行调节,从而调控下游基因以应对盐刺激。前期研究发现属GRAS家族PAT1分支的盐穗木转录因子HcSCL13调节了转基因拟南芥的生长和抗盐性。为明确该转录因子发挥生物学功能的转录调控机制,本研究通过组织化学染色和GUS酶活性检测对盐穗木HcSCL13基因启动子P_(HcSCL13)在植物不同发育阶段、不同非生物胁迫(盐、低温、干旱、损伤和光照)及不同长度截断删除启动子的启动活性及盐响应的关键区域进行分析。具体结果如下:(1)采用GUS组织化学染色对转HcSCL13启动子拟南芥萌发种苗(1 d、3 d、5 d、10 d、12 d和15 d)及成苗(55 d)进行活性分析,结果显示:转HcSCL13启动子纯系拟南芥无论在种苗还是成苗阶段均显示出较强的GUS活性,其中种苗的子叶和根中活性最强;此外,在拟南芥成苗的根、茎、叶、花和角果等各个组织器官中也显示出一定的活性。以上结果表明,盐穗木HcSCL13启动子可调节下游基因在植物整个发育阶段的表达,尤其能够显着调节植物种苗期在子叶和根中的表达。(2)生物信息学分析显示HcSCL13启动子具有一些与盐、低温、干旱和光等胁迫相关的顺式作用元件,因而我们对该启动子偶联GUS报告基因的拟南芥进行了上述逆境胁迫下的组织化学染色和酶活分析。结果显示:300 mM NaCl胁迫3 d后转HcSCL13启动子拟南芥的GUS酶活性显着高于对照组;低温和干旱胁迫处理不同时间后,HcSCL13启动子活性未出现明显变化;叶片、叶柄及花茎处在受到机械损伤后GUS活性显着提高;净光照处理下,不同萌发天数的拟南芥下胚轴无GUS活性;而净黑暗(除萌发第1 d)及16 h光照/8 h黑暗光周期处理条件下,下胚轴均显示出一定的GUS活性,且16 h光照/8 h黑暗光周期下下胚轴中的GUS活性最强;将黑暗条件下萌发5 d的拟南芥种苗移至净光照条件下培养2 d,本无GUS活性的下胚轴呈现出了一定的GUS活性;子叶与胚轴具有类似的光响应调节模式。萌发1 d的胚根,在16 h光照/8 h黑暗光周期下活性最强,净黑暗条件下活性最弱;萌发第3 d、5 d和10 d,净光照下的整个根部都有较强烈的GUS基因表达,净黑暗下胚根的根冠部GUS基因表达明显强于分生区、伸长区和成熟区,而16 h光照/8 h黑暗光周期条件下整个根部的GUS基因表达较为均匀,无明显差异,但在种子萌发后第10 d整个根部的GUS基因表达明显增加。该结果表明盐穗木P_(HcSCL13)是一个能够响应盐和损伤胁迫,且受光周期调节的启动子。(3)为探究影响启动子活性及盐响应的关键区域,基于盐穗木HcSCL13启动子P_(HcSCL13)的生物信息学分析,将该启动子截断删除为5个不同长度的片段:SP1(-1730 bp)截断删除的片段含有厌氧诱导(ARE)与防御和应急反应(TC-rich repeats)相关顺式作用元件;SP2(-1450 bp)截断删除的片段含有厌氧诱导(ARE)与防御和应急反应(TC-rich repeats)相关顺式作用元件;SP3(-1120 bp)截断删除的片段含有盐响应相关元件(CACG);SP4(-720 bp)截断删除的片段含有真菌引发子元件(Box-W1);SP5(-239bp)截断删除的片段含有盐响应相关(GAAAAA)与防御和应激反应的顺式元件(TC-rich repeats)。将截断删除启动子序列构建至含有GUS基因的植物表达载体pBI121上,瞬时注射本氏烟草叶片黑暗处理12 h后使用300 mM NaCl处理植株24 h,随后进行烟草叶片的GUS组织化学染色和GUS酶活性分析。结果发现正常条件下不同长度的启动子片段均能启动GUS基因的表达,但GUS基因表达水平有明显差异。注射全长启动子SP与截断删除的SP1和SP2启动子烟草叶片染色程度基本一致,GUS酶活性无显着差异,而注射截断删除的SP3和SP4启动子片段烟草叶片GUS酶活性显着降低,但截断删除的SP5启动子片段却显着增强了烟草叶片的GUS酶活性,推测在截断删除的SP2和SP3启动子片段之间可能含有决定启动子活性的关键顺式作用元件,截断删除的SP4和SP5启动子片段之间之间可能存在增强启动子活性的元件,SP3和SP5截断删除的序列中含有影响启动子活性的元件。300 mM NaCl胁迫处理下,全长启动子SP能够积极响应盐胁迫,GUS酶活性显着升高;注射截断删除的SP1、SP2、SP3和SP4启动子烟草叶片的GUS酶活性在盐胁迫处理后无明显变化,而截断删除的SP5在盐胁迫后GUS酶活性显着降低,以上结果提示盐穗木HcSCL13启动子能够积极响应盐胁迫,SP5(-239 bp)截断删除的片段含有盐相关的负反馈调节元件。综上所述,盐穗木HcSCL13启动子P_(HcSCL13)能够显着调节植物子叶和根生长发育,且是一个受光周期调节,能够响应盐、损伤等非生物胁迫的启动子。(本文来源于《新疆大学》期刊2019-06-01)
省慧[6](2019)在《玉米ZmHAK1启动子功能分析及与转录因子ZmRAP2.11和ZmARF2相互作用研究》一文中研究指出玉米高亲和钾转运蛋白(ZmHAK)家族基因在玉米(Zea mays L.)吸收和运输钾营养的过程中起关键作用。其中ZmHAK1能提高玉米在低钾胁迫条件下的吸钾能力及植株的抗逆性。该基因在发挥功能时受启动子和转录因子调控。ZmHAK1基因的启动子及启动子上的调控元件在ZmHAK1基因调控中发挥至关重要的作用。因此研究启动子的结构及转录因子的功能可为通过基因工程提高植株抗逆性提供理论依据,这在科学研究过程中具有重要的意义。本研究中我们对玉米ZmHAK1基因启动子进行了分析,并对转录因子ZmRAP2.11和ZmARF2的功能进行了探究,主要研究结果如下:1.以玉米叶片DNA为模板,TA克隆获得玉米ZmHAK1基因启动子2246bp序列,将其命名为PZmHAK1:pMD-18T。使用在线数据库PLANTCARE分析启动子上可能存在的顺式作用元件,包括核心元件TATA-box、CAAT-box以及响应非生物胁迫(干旱、逆境)与激素(茉莉酸甲酯、生长素、脱落酸)的顺式作用元件。2.将ZmHAK1启动子定向替换植物双元表达载体pCAMBIA1301中的35S启动子,将其与GUS报告基因融合,同时构建ZmHAK1启动子5’端一系列缺失表达载体,通过农杆菌瞬时转化法转化烟草。GUS组织染色结果表明全长启动子在植物的根、茎、叶中均有表达;GUS定量结果发现,ZmHAK1基因启动子受非生物胁迫(低钾、高温、低温、盐、干旱、黑暗)和激素(IAA、ABA、MeJA、SA)等多因素诱导。3.利用花粉管通道法将ZmHAK1基因启动子转入玉米自交系,通过潮霉素筛选和PCR鉴定,成功筛选得到阳性苗。4.以玉米叶片cDNA为模板,成功克隆得到玉米转录因子ZmRAP2.11和ZmARF2基因。对这两个转录因子进行生物信息学分析,结果显示转录因子ZmRAP2.11是AP2/ERF家族成员,ZmARF2属于生长素响应因子家族。亚细胞定位结果显示转录因子ZmRAP2.11主要定位于细胞核,转录因子ZmARF2主要定位于细胞核与细胞膜。5.通过酵母单杂交的方法证明ZmRAP2.11和ZmARF2与ZmHAK1基因启动子存在互作关系,将启动子分成六段,分别研究各段启动子与转录因子之间的互作关系,液体显色结果表明转录因子ZmRAP2.11与ZmHAK1基因启动子的第叁段和第六段存在互作;转录因子ZmARF2与ZmHAK1基因启动子第一段和第叁段存在互作。(本文来源于《吉林大学》期刊2019-06-01)
代伟娜[7](2019)在《葡萄转录因子VvDof14负调控VvABCG20启动子活性的研究》一文中研究指出VvABCG20基因在葡萄花和胚珠中高表达,在营养器官中低表达;在有核葡萄和无核葡萄胚珠发育过程中的表达模式存在差异;在种皮中的表达要高于胚乳;VvABCG20基因直系同源的基因参与种皮软木脂的生物合成影响种子发育,因此推测VvABCG20基因可能通过转运种皮相关物质参与种子的发育,进而影响胚珠的败育。启动子在转录水平上参与调控下游相应基因表达,因此通过研究VvABCG20基因的启动子来探讨启动子对基因表达的影响。在本论文中,克隆了‘黑比诺’和‘无核白’中VvABCG20基因启动子,构建了VvABCG20基因启动子及其缺失片段与GUS基因的重组载体,通过瞬时转化烟草叶片来分析启动子全长及各片段的启动子活性,同时对VvABCG20基因启动子甲基化和转录因子调控分析。并且对调控VvABCG20基因的VvDof14基因及其家族进行胚珠发育表达分析和植物激素处理的表达分析。通过研究得出以下结果:1克隆了‘无核白’和‘黑比诺’的ABCG20基因启动子,发现都存在两种序列,全长及缺失41bp的序列,缺失序列在两个品种中无明显差异。构建启动子全长及缺失的GUS重组载体,通过瞬时转化烟草发现:启动子缺失5‘UTR之后对启动子活性没有明显影响;根据顺式元件的位置将启动子截断为p586,p283,p197,p155,启动子活性依次降低,推测-586~-155片段中存在增强基因表达的顺式作用元件。并且对VvABCG20基因启动子转基因拟南芥GUS染色分析发现,葡萄VvABCG20基因在生殖器官花和胚中高表达,在营养器官中低表达。通过重亚硫酸处理‘黑比诺’叶片和胚的DNA,扩增VvABCG20基因启动子区的CpG岛区域,测序发现甲基化水平在叶片和胚珠中保持稳定,甲基化不是造成基因在组织器官中表达差异的原因,具体的原因还需继续研究。2利用数据库预测可能与VvABCG20基因启动子互作的转录因子,通过酵母单杂交体系验证出VvDof14基因与VvABCG20基因启动子结合,根据Dof-motif的数量和位置,将启动子截断为P1-P7,VvDof14基因仅与P7片段结合;通过烟草共转化实验,进一步确定了VvDof14与VvABCG20基因全长启动子以及P7缺失体的结合,且是抑制GUS活性,即VvDof14负调控VvABCG20基因启动子活性。构建VvDof14基因与GFP重组表达载体,通过共聚焦显微镜观察发现葡萄VvDof14蛋白定位于细胞核,属于典型的转录因子。构建VvDof14-pGBKT7载体,转入酵母Y2HGOLD菌株验证自激活,发现VvDof14蛋白没有自激活活性,可以继续与其他蛋白的互作研究。3通过葡萄基因组网站和NCBI网站鉴定出葡萄Dof基因家族有25个成员,通过进化树分析,可以将25个家族基因分为3类,且每个类别内的基因有着相似的基因结构。利用ClustalX2软件对葡萄Dof家族25个基因的蛋白序列比对发现,Dof家族基因成员各序列之间相似性在19.4%到61%之间,在AA160到220之间相似性最高,为Dof家族基因保守结构域。通过RT-PCR分析发现,葡萄Dof家族基因在‘黑比诺’和‘无核白’胚珠中的表达模式存在多样性,大部分VvDof基因在两个品种胚珠中的表达都是有高有低,只有VvDof10在‘黑比诺’胚中的表达远高于‘无核白’,而且在胚珠发育的整个时期都呈相同的模式。葡萄Dof家族基因对不同GA3,ETH,MEJA植物生长调节剂的响应各有不同,其中VvDof6,VvDof14,VvDof20,VvDof22对3种激素的响应模式很一致,且VvDof14对MEJA的响应尤为明显。(本文来源于《西北农林科技大学》期刊2019-05-01)
陈梦雅[8](2019)在《干扰素调节因子8(IRF8)基因启动子甲基化水平与强直性脊柱炎的关联性研究》一文中研究指出目的1.在强直性脊柱炎(Ankylosing Spondylitis,AS)患者与健康对照中检测干扰素调节因子8(Interferon regulatory factor8,IRF8)基因启动子的甲基化及其m RNA的表达水平。2.探讨IRF8基因启动子的甲基化与AS临床特征之间是否具有相关性,探索IRF8基因启动子的甲基化与疾病预后之间的关系。方法1.2016年到2019年,本研究收集病例与对照的5ml血液样本及流行病学资料。病例与对照的收集一共分为两个部分,第一部分,我们比较了99例AS患者和99例健康对照之间IRF8基因启动子的甲基化水平。第二部分,我们比较了另外19个AS患者和19个健康对照之间IRF8基因的m RNA表达水平。根据药物治疗情况分为非生物制剂组和生物制剂组。非生物制剂组是指使用缓解病情风湿药,非甾体抗炎药和糖皮质激素类药物的患者。生物制剂组是指使用肿瘤坏死因子-α(Tumor necrosis factor-α,TNF-α)抑制剂的患者。2.首先对收集到的样本进行DNA的提取,并且进行IRF8基因启动子的甲基化和m RNA表达水平的检测,本次实验检测方法分别采用DNA试剂盒、Methyl Target方法和定量实时逆转录聚合酶链反应(Quantitative real-time reverse transcription-polymerase chain reaction,q RT-PCR)方法。3.使用SPSS23.0软件进行统计分析并且根据不同的数据性质及分布类型采用不同的统计分析方法。符合正态分布的定量资料用均数±标准差进行描述,呈现偏态分布的定量资料采用中位数和四分位数间距(Interquartile range,IQR)进行描述;而对于定性资料的分布特征采用频数及百分比来进行描述。统计方法的选择如下:满足正态分布的定量资料采用t检验进行两组间的比较,不满足正态分布的定量资料则采用Mann-Whitney U检验进行病例和对照间该资料的比较;而关于定性资料在两组间的比较则采用卡方检验进行分析;采用Spearman相关性进行双变量的相关分析。由于性别、药物治疗和HLA-B27状态可能会影响基因的甲基化水平,所以在进行统计分析同时按照性别,治疗和HLA-B27状态进行了分层;使用Kruskal Wallis Test检验比较多组之间是否有统计学差异,多组之间的两两比较采用Mann-Whitney U检验。Graph Pad Prism版本7(Graph Pad Software,La Jolla,CA USA)进行图形的绘制。P值≤0.05被认为具有统计学意义。多重比较时采用Bonferroni校正。结果1.一般情况的概述:本次研究分为两个部分。第一部分,研究共纳入了99个AS患者和99个健康对照。AS患者的平均年龄为31.14±9.93岁,男女性别比为3.5:1。健康对照的平均年龄为31.77±8.69岁,男女性别比为5.18:1。AS患者和健康对照在年龄分布(t=0.475,P=0.635)和性别(χ2=0.861,P=0.353)上无统计学差异。第二部分共纳入19名AS患者和19名健康对照。两组之间的性别和年龄没有显着差异(年龄:32.21±7.58 vs.32.05±7.75岁,P=0.950;男/女:13/6 vs.14/5,P=0.721)。2.91个Cp G位点的甲基化水平与AS易感性的关联分析:研究共选择了91个Cp G位点,差异性甲基化分析发现了31个差异表达的Cp G位点,这表明AS患者的IRF8基因有显着的DNA甲基化水平的变化。3.IRF8基因的四个Cp G区域总体甲基化水平:Cp G-1的甲基化水平在AS患者中的中位百分数是1.53%,在健康对照中中位百分数是1.40%;Cp G-2的甲基化水平在AS患者中的中位百分数是3.43%,在健康对照中的中位百分数是3.20%;Cp G-3的甲基化水平在AS患者中的中位百分数是1.23%,在健康对照中中位百分数是1.17%;Cp G-4的甲基化水平在AS患者中的中位百分数是1.40%,在健康对照中中位百分数是1.35%;IRF8基因启动子的4个Cp G区域的甲基化状态在AS患者中均显着高于健康对照(Cp G-1:1.53%vs.1.40%,P<0.001;Cp G-2:3.43%vs.3.20%,P<0.001;Cp G-3:1.23%vs.1.16%,P<0.001;Cp G-4:1.40%vs.1.34%,P=0.02)。就总体水平来说,AS患者中IRF8基因的总体甲基化水平显着高于健康对照组(IRF8:1.91%vs.1.78%,P<0.001)。4.IRF8甲基化水平的亚组分析:性别的分层分析结果显示,无论是男性还是女性分组,DNA甲基化差异在AS和健康对照中均具有统计学意义。药物的分层分析结果显示,IRF8甲基化水平在未用药与生物制剂组之间的差异具有统计学意义(Z=-2.502,P=0.012)。而IRF8甲基化水平在未用药与非生物制剂组(Z=-1.425,P=0.154)和非生物制剂组与生物制剂组(Z=-1.185,P=0.236)均无统计学意义。HLA-B27的分层分析结果显示,无论是HLA-B27阳性组还是HLAB27阴性组中,IRF8的甲基化水平均高于健康对照组,而且HLA-B27阳性组与HLA-B27阴性组相比,IRF8的甲基化水平的差异不具有统计学意义。5.q RT-PCR验证:AS患者中IRF8基因的m RNA表达水平显着低于健康对照组。AS患者中IRF8基因的m RNA水平的中位数和四分位间距是0.77(0.65,1.00),P=0.038。6.IRF8基因甲基化与临床表现的相关性:相关分析发现IRF8基因启动子甲基化与病程和BASFI之间存在正向相关性。结论1.IRF8基因启动子的高甲基化通过降低其m RNA的表达可能会导致AS的发生。2.生物制剂治疗可能会改变IRF8基因启动子的甲基化水平,HLA-B27的状态与IRF8基因启动子的甲基化水平无关。3.IRF8基因启动子甲基化水平可以作为判断AS疾病预后的指标。(本文来源于《安徽医科大学》期刊2019-03-01)
梁珂豪,孙永江,袁义杭,张凌云[9](2019)在《青杄转录因子PwNAC30及其启动子序列的克隆与表达分析》一文中研究指出该研究以青杄(Picea wilsonii)为实验材料,通过PCR从青杄的cDNA文库中克隆得到一个NAC转录因子,命名为PwNAC30。生物信息学分析显示,PwNAC30开放阅读框1 179bp,共编码392个氨基酸,在其N端存在保守的NAM(no apical meristem)结构域,可分为A~E等5个亚结构域。多序列对比和系统进化树分析显示,PwNAC30蛋白与同为云杉属的北美云杉(Picea sitchensis)聚为一类。启动子克隆分析显示,PwNAC30基因启动子上存在脱落酸(ABA)、赤霉素(GA)、茉莉酸甲酯(MeJA)、TC-rich repeats等激素和逆境响应元件,在GA、ABA、MeJA、低温、干旱、盐的处理下,其启动子活性均明显增强。荧光定量PCR分析表明,PwNAC30在球果中的表达量最高,而在花粉和种子中的表达量最低。PwNAC30对于盐、干旱、低温、ABA、MeJA、GA处理均有响应,尤其对盐、干旱、MeJA的响应最为显着。亚细胞定位结果显示,PwNAC30蛋白定位于细胞核与细胞质,主要定位于细胞核中。酵母单杂及双杂结果表明,PwNAC30蛋白的全长和N端没有转录激活活性,而C端有转录激活活性,且PwNAC30自身能形成同源二聚体。研究表明,青杄PwNAC30基因可以作为一个转录因子发挥作用,其转录激活活性在C端,且自身能够形成同源二聚体结构;PwNAC30基因广泛参与了ABA、GA、MeJA等激素的信号通路,并对盐、干旱、低温处理有响应。(本文来源于《西北植物学报》期刊2019年01期)
刘芳,肖钢,官春云[10](2018)在《GT和GATA转录因子对甘蓝型油菜BnA5.FAD2和BnC5.FAD2启动子功能的调控》一文中研究指出【目的】脂肪酸去饱和酶2基因(FAD2)是控制油菜中油酸含量的重要基因,通过研究GATA和GT转录因子与BnA5.FAD2和BnC5.FAD2启动子的互作关系及其转录调控机制,为高油酸油菜育种提供分子理论基础。【方法】通过缺失启动子片段及生物信息学分析,预测BnA5.FAD2和BnC5.FAD2启动子区潜在顺式作用元件;从PlantTFDB转录因子数据库中筛选候选转录因子,通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测转录因子的表达规律,并与BnA5.FAD2和BnC5.FAD2表达规律对比,进一步筛选候选转录因子;利用酵母单杂交验证转录因子与启动子序列的互作情况;将转录因子与BnA5.FAD2和BnC5.FAD2启动子序列共转入拟南芥,通过Western blot检测报告基因GFP的蛋白表达情况,分析转录因子对于启动子功能的影响。【结果】单独敲除BnA5.FAD2和BnC5.FAD2启动子中的GT或GATA顺式作用元件后,GFP蛋白丰度均下降,表明GT和GATA顺式作用元件在调节基因转录中起重要作用。酵母单杂交结果显示,GATA家族转录因子(Bna010243-1、Bna026124-1和Bna026124-2)和GT家族转录因子(Bna010915和Bna013749)可以与BnA5.FAD2和BnC5.FAD2启动子相互作用。Western blot结果显示,当GATA家族转录因子与含有GATA元件的启动子片段共转化拟南芥时,GFP蛋白含量明显高于无转录因子时,当敲除GATA元件时,GFP蛋白含量无明显变化;当GT家族转录因子与含有GT元件的启动子片段共转化拟南芥时,GFP蛋白含量有明显变化,当敲除GT元件时,GFP蛋白含量无明显变化。【结论】GATA家族的转录因子Bna010243-1、Bna026124-1和Bna026124-2可以与BnA5.FAD2和BnC5.FAD2启动子中GATA元件相互作用,增强基因的表达水平。GT家族的转录因子Bna010915可以与BnA5.FAD2和BnC5.FAD2启动子中的GT元件发生互作,正向调节基因表达;Bna013749通过与BnA5.FAD2和BnC5.FAD2启动子中的GT元件发生互作,负向调节基因表达。(本文来源于《中国农业科学》期刊2018年24期)
启动子因子论文开题报告
(1)论文研究背景及目的
此处内容要求:
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例:
目的探讨O~6-甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移酶(MGMT)启动子甲基化与表皮生长因子受体(EGFR)基因表达对胶质母细胞瘤患者预后的影响。方法收集葫芦岛中心医院和医联体医院神经外科研究所2010—2015年收治的57例胶质母细胞瘤患者的胶质母细胞瘤标本,对肿瘤标本进行基因检测;随访12个月,观察患者预后情况。结果 57例患者中,MGMT启动子甲基化阳性者24例(42.1%),阴性者33例(57.9%);EGFR基因表达阳性者49例(86.0%),阴性者8例(14.0%)。12个月后,24例MGMT启动子甲基化阳性者中,15例存活,存活率为62.5%(15/24),33例阴性者中,11例存活,存活率为33.3%(11/33),差异有统计学意义(P<0.05);49例EGFR基因表达阳性者中,20例存活,存活率为40.8%(20/49),8例阴性者中,6例存活,存活率为75.0%(6/8),差异有统计学意义(P<0.05)。结论 MGMT启动子甲基化与EGFR基因表达影响胶质母细胞瘤患者预后,可作为预后判断的参考指标。
(2)本文研究方法
调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
启动子因子论文参考文献
[1].文苏麟.水稻转录因子GLK的启动子多态性及基因表达模式分析[J].山地农业生物学报.2019
[2].张右迁,李靖远.O~6-甲基鸟嘌呤-DNA-甲基转移酶启动子甲基化与表皮生长因子受体基因表达对胶质母细胞瘤预后影响研究[J].临床军医杂志.2019
[3].杨涛,许厚强,陈伟,周迪,王圆圆.牛MSTN启动子与MEF2C转录因子相互作用的研究[J].畜牧兽医学报.2019
[4].杨涛.牛MEF2家族转录因子与MSTN启动子相互作用的机制研究[D].贵州大学.2019
[5].冯肖莉.盐穗木转录因子HcSCL13启动子活性及盐响应调控机制的初探[D].新疆大学.2019
[6].省慧.玉米ZmHAK1启动子功能分析及与转录因子ZmRAP2.11和ZmARF2相互作用研究[D].吉林大学.2019
[7].代伟娜.葡萄转录因子VvDof14负调控VvABCG20启动子活性的研究[D].西北农林科技大学.2019
[8].陈梦雅.干扰素调节因子8(IRF8)基因启动子甲基化水平与强直性脊柱炎的关联性研究[D].安徽医科大学.2019
[9].梁珂豪,孙永江,袁义杭,张凌云.青杄转录因子PwNAC30及其启动子序列的克隆与表达分析[J].西北植物学报.2019
[10].刘芳,肖钢,官春云.GT和GATA转录因子对甘蓝型油菜BnA5.FAD2和BnC5.FAD2启动子功能的调控[J].中国农业科学.2018