OsJMJ714在水稻侧根发育中的功能分析

OsJMJ714在水稻侧根发育中的功能分析

论文摘要

组蛋白赖氨酸甲基化是一种重要的表观遗传学修饰,在调控基因表达过程中起重要作用。在动物中已经证明JmjC蛋白具有组蛋白去甲基化酶活性,并且JmjC结构域为这类蛋白的催化域。进化分析发现水稻中有20个含有JmjC结构域的蛋白,分为4个家族,其中JmjC domain only家族中的7个蛋白只含有JmjC结构域。研究报道水稻OsJMJ760影响组蛋白去甲基化,在花器官的形成与发育过程中具有重要作用,而其他成员的功能尚不清楚。OsJMJ714是JmjC domain only家族成员之一,其氨基酸序列的生物信息学分析结果表明OsJMJ714催化域的核心序列包含保守的Fe(II)和αKG结合位点;在此基础上,我们在水稻体内和体外组蛋白去甲基化实验中均证实OsJMJ714具有使组蛋白发生H3K9me1/2/3去甲基化修饰的组蛋白去甲基化酶活性。在转录水平上,我们通过荧光定量PCR分析了该基因在水稻苗期的表达特性。OsJMJ714基因在苗期不同组织的表达分析结果表明, OsJMJ714基因在根中的表达高于地上部的表达。我们发现OsJMJ714基因的表达受不同浓度NaCl处理的诱导;而且随着盐处理时间增长, OsJMJ714基因表达量增强。这些结果暗示着OsJMJ714可能参与水稻根系生长发育过程以及盐胁迫的应答反应过程。为了分析OsJMJ714在水稻中的生理功能,我们通过农杆菌介导的转化方法创建了35S启动子驱动的转OsJMJ714基因水稻材料。野生型和T2代转基因种子同步萌发生长三天后,我们发现野生型水稻根系开始形成大量侧根,而转基因水稻形成少量侧根,表明在正常生长条件下OsJMJ741的过表达延缓水稻侧根的发生。拟南芥中已报道JMJC基因的突变导致基因组DNA甲基化模式发生改变。在此研究中,我们运用甲基化敏感扩增多态性实验(MSAP)对转基因水稻和野生型水稻的基因组DNA甲基化模式比较分析,过表达OsJMJ714增强了转基因水稻基因组DNA的甲基化水平。我们对MSAP实验中差异基因的表达进行了分析,我们发现两个编码no apical meristem (NAC)家族蛋白的基因(AK099237,AK068501)在过表达OsJMJ714水稻中的表达水平降低,另外,在转基因水稻中DNA去甲基化基因(Os05g446000)表达较野生型中的表达降低。在水稻中,生长素和细胞分裂素的生物合成、稳态、转运和信号转导均影响根系的生长发育进程。我们发现不同浓度的NAA处理,能恢复转基因水稻和野生型水稻间侧根生长发育的差异,同时用NAA和NaCl处理,也能恢复转基因水稻与野生型水稻小侧根起始发育的差异,说明OsJMJ714可能通过调控生长素水平来影响水稻侧根的起始发生。另外不同浓度6-BA处理后,转基因水稻和野生型水稻小侧根发育均受到抑制,但转基因水稻的小侧根发育相对野生型来说对细胞分裂素不敏感。我们进一步对激素合成及其调控的相关基因的表达水平进行了分析。结果表明OsJMJ714过表达导致水稻中生长素合成关键基因OsYUCCAs、细胞分裂素合成关键基OsIPTs和细胞分裂素途径中关键基因OsRRs表达降低,进而影响转基因水稻根系的生长发育进程。综上所述,我们推测OsJMJ714可能通过影响组蛋白H3K9甲基化水平和基因组DNA甲基化修饰,从而影响如NAC家族基因、DNA去甲基化相关基因、激素合成关键基因OsYUCCAs、OsIPTs以及细胞分裂素途径中关键基因OsRRs的表达,最终影响水稻根系的生长发育进程。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 缩略词表
  • 第一章 引言
  • 1.1 植物组蛋白甲基化研究进展
  • 1.1.1 组蛋白修饰
  • 1.1.2 植物中组蛋白甲基化与DNA 甲基化
  • 1.1.3 植物中组蛋白去甲基化
  • 1.1.4 含JmjC 结构域的蛋白与植物生长发育
  • 1.2 水稻根的形成与发育
  • 1.2.1 水稻根的类型
  • 1.2.2 水稻初生根的模式
  • 1.2.3 植物激素与根发育
  • 1.3 根结构与盐胁迫
  • 1.4 研究目的与意义
  • 第二章 材料与方法
  • 2.1 实验材料
  • 2.1.1 植物材料
  • 2.1.2 质粒载体及菌株
  • 2.1.3 主要试剂
  • 2.1.4 引物
  • 2.1.5 培养基配制
  • 2.2 实验方法
  • 2.2.1 生物信息学分析
  • 2.2.2 水稻材料的种植与培养
  • 2.2.3 转基因水稻材料的创建与鉴定
  • 2.2.4 转基因水稻根系表型分析实验
  • 2.2.5 分子克隆
  • 2.2.6 植物表达载体的构建
  • 2.2.7 农杆菌电击感受态的制备
  • 2.2.8 农杆菌电击转化
  • 2.2.9 水稻总RNA 提取
  • 2.2.10 cDNA 第一条链的合成
  • 2.2.11 荧光定量PCR(Real-time PCR)反应体系及程序
  • 2.2.12 CTAB 法提取水稻DNA
  • 2.2.13 DNA 纯度与浓度检测
  • 2.2.14 MSAP 检测方法
  • 2.2.15 BL21 电击感受态制备
  • 2.2.16 BL21 感受态细胞电击转化
  • 2.2.17 原核重组蛋白的诱导与纯化
  • 2.2.18 western-blot 检测
  • 2.2.19 体外组蛋白去甲基化活性试验
  • 2.2.20 体内组蛋白去甲基化活性试验
  • 第三章 结果与分析
  • 3.1 生物信息学分析
  • 3.2 OSJMJ714 基因克隆及转基因材料创建
  • 3.2.1 OsJMJ714 基因全长的扩增及植物表达载体的构建
  • 3.2.2 转OsJMJ714 基因水稻材料的创建
  • 3.2.3 转OsJMJ714 基因水稻材料的鉴定
  • 3.3 OSJMJ714 受盐诱导表达
  • 3.4 OSJMJ714 具有组蛋白去甲基化酶活性
  • 3.5 过表达OSJMJ714 影响水稻侧根发育
  • 3.6 生长素NAA 恢复过表达OSJMJ714 水稻小侧根的发育
  • 3.7 过表达OSJMJ714 下调生长激素合成途径关键基因的表达
  • 3.8 OSJMJ714 水稻小侧根发育的抑制与6-BA 相关
  • 3.9 过表达OSJMJ714 水稻中基因组DNA 甲基化模式的MSAP 分析
  • 3.9.1 过表达OsJMJ714 微弱影响水稻基因组DNA 甲基化敏感多态性
  • 3.9.2 过表达OsJMJ714 提高水稻基因组DNA 甲基化水平
  • 3.9.3 MSAP 实验中差异基因的表达分析
  • 第四章 讨论
  • 第五章 全文结论
  • 参考文献
  • 致谢
  • 作者简历
  • 相关论文文献

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