稻瘟病菌mnh6和mtp1基因的克隆和功能分析

稻瘟病菌mnh6和mtp1基因的克隆和功能分析

论文摘要

稻瘟病是一种严重危害水稻的毁灭性病害,其病原菌为子囊菌Magnaporthe grisea。稻瘟病菌也是一种研究病原真菌-寄主植物相互作用的模式生物。研究稻瘟病菌致病的分子机理不仅对于了解病原真菌-寄主的互作机理,而且对于开发新的杀菌剂具有重要的促进作用。稻瘟病菌致病相关基因的克隆和功能分析是研究稻瘟病菌致病机制的一种快速且有效的途径。非组蛋白基因6(mnh6)和Ⅲ型膜整合蛋白(mtp1)是稻瘟病菌的两个功能未知的基因。目前为止,还没有在稻瘟病菌或其他丝状真菌中研究过mnh6和mtp1基因或其同源基因的功能。本文克隆了mnh6和mtp1基因,通过DNA同源置换分别敲除了这2个基因,并分析了基因缺失引起的稻瘟病菌表型和致病性变化,确定了这2个基因在稻瘟病菌生长、发育和致病过程中的部分功能。主要研究结果如下:1.利用长距离PCR从稻瘟病菌附着胞cDNA文库中克隆了mnh6和mtp1基因的cDNA序列,并从基因组DNA中克隆了mnh6和mtp1基因的全长DNA序列。2.使用多种分析软件,分析和预测了MNH6和MTP1蛋白的结构和功能。MNH6为非组蛋白(DNA结合蛋白),属于HMGB蛋白家属。MTP1为一种Ⅲ型膜整合蛋白,具有8个跨膜区,可能结合在细胞膜上。3.通过构建基因敲除载体和原生质体转化,分别获得了mnh6缺失或mtp1缺失的基因缺失突变子,并从DNA水平和RNA水平进行了验证。4.突变子△mnh6的菌落形态不同于野生型GUYl1,菌落呈灰白色,菌丝稀疏,生长速度变慢,产孢菌丝细胞壁的溶剂疏水性消失,菌丝细胞壁容易被细胞壁降解酶降解,产孢减少,孢子形态变得细长,孢子的附着胞形成率降低,附着胞的膨压降低,附着胞对寄主植物表面的穿透能力减弱,侵入后生长速度减慢,喷雾接种后对大麦和水稻C039的致病性消失。mnh6基因重新引入△mnh6后,突变子的表型恢复。5.MNH6-GFP融合蛋白主要在细胞核内表达,说明MNH6蛋白的作用位点主要在细胞核内。MNH6在稻瘟病菌致病循环过程中的各个发育时期具有重要作用,如菌丝生长,产孢,附着胞形成,穿透,侵入生长等时期,表明MNH6是稻瘟病菌致病性和完成侵染循环所必需的。6.突变子△mtp1的菌落形态类似于野生型Guyl1,但菌丝颜色较黑,产孢减少,孢子萌发延迟,附着胞形成延迟,离体接种发现突变子对大麦和水稻C039的致病性与野生型一致。突变子△mtp1在各种培养基上的生长速度与野生型没有差异,两者附着胞膨压也没有区别。7.mtp1启动子指导的GFP蛋白主要在稻瘟病菌的菌丝和孢子中表达,附着胞中表达量较少。mtp1基因对于稻瘟病菌的生长没有明显的作用,但对于稻瘟病菌的产孢、孢子萌发具有重要的作用。它对于稻瘟病菌的致病性是非必需的。

论文目录

  • 致谢
  • 摘要
  • Abstract
  • 第一章 文献综述
  • 1 稻瘟病与稻瘟病菌
  • 2 稻瘟病菌的生活史和侵染循环
  • 3 稻瘟病菌附着胞形成过程的调控
  • 3.1 对植物表面信号分子的识别
  • 3.2 信号传导过程
  • 3.3 附着胞形成
  • 4 稻瘟病菌侵入和侵入后生长的调控
  • 4.1 附着胞的穿透
  • 4.2 侵入后生长
  • 5 HMG非组蛋白的功能
  • 5.1 HMG蛋白
  • 5.2 HMG家族及其分类
  • 5.3 HMGB蛋白
  • 6 本研究的目的和内容
  • 第二章 材料和方法
  • 1 试验使用的菌株、质粒、试剂和培养基等材料
  • 1.1 菌株
  • 1.2 质粒载体
  • 1.3 文库
  • 1.4 植物
  • 1.5 试剂
  • 1.6 培养基
  • 2 稻瘟病菌产孢培养、孢子收集和附着胞诱导培养
  • 3 E.coli DH5a感受态细胞的制备
  • 4 感受态细胞的转化
  • 5 X-gal和IPTG直接用于琼脂平板
  • 6 CTAB法抽提质粒
  • 7 CTAB法提取稻瘟病菌基因组DNA
  • 8 DNA的琼脂糖电泳
  • 9 质粒酶切与连接
  • 9.1 pEGFP质粒的单酶切(双酶切)
  • 9.2 双酶切酒精沉淀
  • 9.3 酶切片段的去磷酸化(CIP)处理
  • 9.4 DNA片段的连接反应体系
  • 10 DNA片段的胶回收
  • 11 小量质粒DNA的提取
  • 12 中量质粒DNA的提取
  • 13 RNA提取和分析
  • 14 基因表达的Real Time PCR检测
  • 14.1 反转录反应
  • 14.2 Real Time PCR反应
  • 15 DNA片段的PCR扩增
  • 15.1 长片段DNA的LD PCR扩增
  • 15.2 普通DNA片段的PCR扩增
  • 16 PCR产物的克隆
  • 16.1 PCR产物的琼脂糖电泳及胶回收。
  • 16.2 PCR产物的连接。
  • 17 DNA序列测序
  • 18 DNA和蛋白序列分析
  • 19 稻瘟病菌原生质体的制备
  • 20 稻瘟病菌原生质体转化和转化子验证
  • 21 稻瘟病菌基因组DNA Southern杂交(DIG法)
  • 21.1 探针的准备
  • 21.2 稻瘟病菌基因组DNA的消化及电泳
  • 22 免疫显色
  • 23 稻瘟病菌的表型观察
  • 23.1 生长速率的测定
  • 23.2 在营养缺陷型、高渗及含重金属培养基上的生长情况分析
  • 23.3 产孢量的测定
  • 23.4 孢子大小的测定
  • 23.5 孢子萌发率的测定
  • 23.6 孢子的附着胞形成率
  • 23.7 附着胞大小的测定
  • 23.8 附着胞膨压的测定
  • 23.9 产孢菌丝的疏水性分析
  • 23.10 细胞壁完整性分析
  • 23.11 菌丝、孢子和附着胞超微结构的观察
  • 23.12 附着胞对叶片表皮穿透率的测定
  • 23.13 对植物离体叶片致病性的点接种测定
  • 23.14 对植物致病性的喷雾测定
  • 24 稻瘟病菌基因的原核表达载体的构建和蛋白的原核表达
  • 25 数据的统计分析
  • 第三章 稻瘟病菌非组蛋白6基因的克隆和功能分析
  • 1 稻瘟病菌非组蛋白6基因的克隆
  • 1.1 mnh6基因的克隆
  • 1.2 MNH6蛋白的功能预测
  • 1.3 MNH6蛋白的分布
  • 2 非组蛋白6在细胞内作用位点的定位
  • 2.1 MNH6-GFP融合蛋白表达载体的构建
  • 3 稻瘟病菌mnh6基因的敲除
  • 3.1 稻瘟病菌基囚敲除载体的构建策略
  • 3.2 mnh6基因敲除载体的构建
  • 3.3 mnh6基因敲除载体的原生质体转化
  • 3.4 稻瘟病菌mnh6敲除转化子的筛选
  • 4 基因缺失突变子△mnh6的基因互补恢复
  • 4.1n mh6互补载体的构建
  • 4.2 mnh6互补载体的原生质体转化
  • 4.3 mnh6互补转化子的Southern杂交验证
  • 5 突变子△mnh6和s121hb1的mnh6基因表达的qRT-PCR验证
  • 6 突变子△mnh6的生长、产孢分析
  • 6.1 CM培养基上的生长分析
  • 6.2 CM培养基上的产孢分析
  • 6.3 孢子大小分析
  • 6.4 菌丝、孢子的超微结构分析
  • 7 突变子△mnh6的孢子萌发、附着胞形成分析
  • 7.1 孢子萌发率分析
  • 7.2 附着胞形成率分析
  • 8 突变子△mnh6的细胞壁完整性分析
  • 8.1 对细胞壁降解酶的敏感性
  • 8.2 疏水性和溶剂疏水性分析
  • 9 突变子△mnh6的表皮穿透率分析
  • 10 突变子△mnh6对大麦离体时片的致病性分析
  • 11 突变子△mnh6的对大麦和水稻植株的致病性分析
  • 11.1 大麦
  • 11.2 水稻CO39
  • 12讨论
  • 12.1 稻瘟病菌非组蛋白6(MNH6)的结构分析和功能预测
  • 12.2 mnh6在稻瘟病菌生长和发育过程中的作用
  • 13.3 mnh6在稻瘟病菌致病过程中的作用
  • 13.4 mnh6基因与MPS1细胞完整性MAPK途径的关系
  • 第四章 稻瘟病菌Ⅲ型膜整合蛋白基因的克隆和功能分析
  • 1 稻瘟病菌Ⅲ型膜整合蛋白mtp1基因的克隆
  • 2 MTP1蛋白在稻瘟病菌发育过程中的表达研究
  • 3 稻瘟病菌mtp1基因的敲除
  • 4 突变子△mtp1的表型分析
  • 5 讨论
  • 参考文献
  • 相关论文文献

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