一个水稻短生育期突变体的遗传分析与精细定位

论文摘要

在优良迟熟恢复系明恢86的转基因后代中,发现了一个非T-DNA插入引起的短生育期突变体（暂命名short growth period,简称sgp（t））。该突变体对光周期反应不敏感,在不同生态区域与不同播种期,平均抽穗期40.9±2.1～62.4±5.2天,比野生型明恢86早35～50天。进一步分析sgp（t）突变体与野生型明恢86、93-11、闽恢3301和博白B等4个品种的杂种F2群体抽穗分布发现,分离群体后代中出现早抽穗、较早抽穗和迟抽穗3种类型,分离比率为1:2:1,符合一对基因的不完全显性遗传。以F2代（sgp（t）×93-11）中的早熟株和迟熟株为定位群体,应用分子标记将sgp（t）基因定位在第6染色体长臂的RM3628和RM439之间,随后利用已经公布的水稻基因组序列,在sgp（t）基因附近区域新开发了新的分子标记,将sgp（t）基因进一步定位在两个标记NSSR0699和NSSR0692之间,物理距离为75.8kb。定位结果显示sgp（t）不同于目前报道的所有早熟和迟熟基因,sgp（t）是一个控制水稻生育期的新基因。

论文目录

• 摘要
• Abstract
• 中文文摘
• 第1章 绪论
• 1.1 课题背景
• 1.2 文献综述
• 1.2.1 双子叶植物的开花遗传研究进展
• 1.2.1.1 光周期开花途径
• 1.2.1.2 春化途径
• 1.2.1.3 自主途径
• 1.2.1.4 赤霉素途径
• 1.2.2 单子叶植物的开花遗传研究进展
• 1.2.3 基因分离策略与定位方法
• 1.2.3.1 定位克隆
• 1.2.3.2 BSA法与基因定位
• 1.2.3.3 筛选与目标基因连锁的分子标记
• 1.2.3.4 图位克隆研究实例
• 1.2.4 基因功能的生物信息学分析
• 1.2.4.1 序列同源比较
• 1.2.4.2 寻找蛋白质家族保守顺序
• 1.2.4.3 蛋白质结构的预测序
• 第2章 Sgp（t）的遗传分析与分子标记定位
• 2.1 前言
• 2.2 材料与方法
• 2.2.1 材料与杂交
• 2.2.2 定位亲本的选择
• 2.2.3 定位群体的构建
• 2.2.4 田间调查与采样
• 2.2.5 引物来源
• 2.2.6 DNA的提取
• 2.2.7 PCR反应
• 2.2.8 非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳
• 2.2.9 琼脂糖凝胶电泳
• 2.2.10 基因定位
• 2.3 结果与分析
• 2.3.1 sgp（t）突变体的遗传分析
• 2.3.1.1 sgp（t）突变体的表型及抽穗期对光周期的反应
• 2.3.1.2 早熟突变体sgp（t）由一个不完全显性基因控制的突变体
• 2.3.2 sgp（t）/9311定位群体分析与基因定位
• 2.3.2.1 连锁标记的筛选和sgp（t）的初步定位
• 2.3.2.2 SSR标记的设计、多态性筛选及对sgp（t）进一步定位
• 2.3.2.3 Indel标记的设计、多态性筛选及对sgp（t）的精细定位
• 2.3.3 02428/sgp（t）的定位群体分析与精细定位
• 2.3.3.1 sgp（t）定位区域标记的多态性筛选
• 2.3.3.2 sgp（t）基因的进一步精细定位
• 2.3.4 对sgp（t）基因的定位结果总结
• 2.3.5 讨论
• 结论
• 附录
• 参考文献
• 攻读学位期间承担的科研任务与主要成果
• 致谢
• 个人简历