中国西南三省腐生暗色丝孢菌的分类研究及冬枣果腐病菌的分子鉴定

论文摘要

腐生暗色丝孢真菌（Hyphomycetes）为无性型真菌,主要分布于潮湿环境森林中的枯枝、腐木、落叶上。对林木等腐生基质的降解具有重要的意义,也是森林生物多样性的重要组成部分。我国对该类群真菌研究却相对滞后。西南三省（云南、贵州、湖南）地处长江中上游,地理生态区域独特,地形地貌复杂,海拔高度差异显著,气候条件特殊,分布着面积广大的热带及亚热带雨林,森林生态系统复杂,蕴涵着大量的真菌种类。本研究旨在通过对云南西双版纳国家森林公园、勐仑植物园、野象谷、雨林谷,昆明小白龙森林公园,贵州安顺黄果树瀑布、宽阔水自然保护区,湖南张家界自然保护区的枯腐林木生暗色丝孢真菌属、种多样性进行研究,并尽可能深入地揭示该基质类群真菌在这一特定地区的存在状况和分布规律,为今后开展相关研究奠定基础。共采集凋落枯枝标本140余份,经室内处理,分类研究,共鉴定出枯腐林木生暗色丝孢菌22属,32种。每种均作详细的形态描述、描绘及分布地点与生境的引证。研究标本、玻片、菌株等保存于北京林业大学微生物研究室。对冬枣贮藏期引发黑斑病、浆胞病和轮纹病的九株真菌菌株进行了分子水平鉴定。采用结合病原物形态特征和rDNA ITS区序列特点的方法对获得的菌株进行分析。以ITS1和ITS4为引物,对9株菌的基因组进行扩增,得到约550bp左右的ITS区rDNA片段。将测序结果登陆GenBank进行BLAST分析,依据Neighbor-joining方法构建系统发育树。形态与分子鉴定结果表明,供试的九个菌株中,冬黑4（DH4）、和轮纹5（LW5）为链格孢（Alternaria alternata）；冬浆3（DJ3）、冬浆4（DJ4）为细极链格孢（Alternata tenuissima）；冬黑1（DH1）和轮纹4（LW4）为拟茎点霉属1种（Phomopsis sp.）；冬黑2（DH2）为球状茎点霉（Phoma glomerata）；轮纹3（LW3）为嘴突凸脐蠕孢（Exserohilum rostratum）；冬浆5（DJ5）为番茄匍柄霉（Semphylium solani）。

论文目录

• 摘要
• ABSTRACT
• 引言
• 1.枯腐林木生暗色丝孢真菌的研究状况
• 2.枯腐林木暗色丝孢真菌的多样性
• 2.1 物种的多样性
• 2.2 生存环境的多样性
• 3.枯腐林木暗色丝孢真菌有性态—无性态的分类问题
• 4.枯腐林木暗色丝孢真菌研究存在的问题
• 5.真菌分类技术在枯腐林木生真菌研究中的应用
• 6.枯腐林木生暗色丝孢菌的分类标准
• 6.1 属级分类标准
• 6.2 种级分类标准
• 7.冬枣果腐病菌的研究现状
• 8.本研究的科学意义
• 第二章 云南贵州湖南三省枯腐林木生暗色丝孢菌分类研究
• 1.材料与方法
• 1.1 标本来源及采集
• 1.2 培养基
• 1.3 实验方法
• 1.3.1 标本室内处理
• 1.3.2 玻片制作
• 1.3.3 分离纯化
• 1.3.4 简易促进产孢的方法
• 1.3.5 分生孢子萌发及产孢方式观察
• 1.3.6 描述鉴定
• 2.分类研究结果
• 2.1 链格孢属（Alternaria）
• 链格孢（A.alternata）
• 细极链格孢（A.tenuissima）
• 2.2 平脐蠕孢属（Bipolaris）
• 澳大利亚平脐蠕孢（B.australiensis）
• 夏威夷平脐蠕孢（B.hawaiiensis）
• 2.3 枝孢属（Cladosporium）
• 多主枝孢（C.herbarum）
• 2.4 心形孢属（Cordana）
• 香蕉暗双孢（C.musae）
• 少隔心形孢（C.pauciseptata）
• 2.5 棒孢属（Corynespora）
• 竹叶蕉棒孢（C.donae）
• 2.6 弯孢属（Curvularia）
• 棒弯孢（C.clavata）
• 新月弯孢（C.lunata）
• 塞纳加尔弯孢（C.senegalensis）
• 2.7 砖格孢属（Dictyosporium）
• 七臂砖格孢（D.heptasporum）
• 2.8 埃里彼格孢属（Ellisembia）
• 竹埃里彼格孢（E.bambusicola）
• 细小埃里彼格孢（E.leptospora）
• 2.9 凸脐蠕孢属（Exserohilum）
• 长孢凸脐蠕孢（E.longisporum）
• 嘴突凸脐蠕孢（E.rostratum）
• 2.10 小镰孢属（Fusariella）
• 暗绿小镰孢（F.atrovirens）
• 2.11 粘鞭霉属（Gliomastix）
• 芭蕉生粘鞭霉（G.musicola）
• 2.12 膝梗孢属（Gonytrichum）
• 巨枝膝梗霉（G.macrocladum）
• 2.13 基膨孢属（Guedea）
• 卵形基膨孢（G.ovata）
• 2.14 腐质霉属（Humicola）
• 棕黑腐质霉（H.fuscoatra）
• 2.15 单格孢属（Monodictys）
• 厚垣单格孢（M.clamydosporum）
• 2.16 齿梗孢属（Scolecobasidium）
• 多变齿梗孢（S.tshawytschae）
• 2.17 葚孢属（Sporidesmium）
• 长喙葚孢（S.longirostratum）
• 尖孢葚孢（S.macrurum）
• 少隔葚孢（S.parvum）
• 平截钝圆葚孢（S.valdivianum）
• 2.18 带孢霉属（Taeniolella）
• 湖南小带孢（T.hunanensis）
• 2.19 四绺孢属（Tetraploa）
• 芒四绺孢（T.aristata）
• 2.20 色串孢属（Torula）
• 草色串孢（T.herbarum）
• 2.21 短梗蠕孢属（Trichocladium）
• 暗色短梗蠕孢（T.opacum）
• 2.22 维郎那霉属（Vernonaea）
• 芭蕉维郎那霉（V.musae）
• 3.总结与讨论
• 第三章 冬枣果腐病菌的分子鉴定
• 1.材料与方法
• 1.1 菌种来源
• 1.2 菌体培养
• 1.3 形态特征鉴定
• 1.4 DNA的提取和纯化
• 1.4.1 试剂及配制
• 1.4.2 仪器
• 1.4.3 基因组DNA的提取和检测步骤
• 1.5 PCR扩增
• 1.5.1 扩增产物纯化检测
• 1.5.2 序列测定和系统进化分析
• 2.结果与分析
• 2.1 形态学鉴定
• 2.2 ITS rDNA的序列分析
• 2.3 系统发育树分析
• 3.总结与讨论
• 参考文献
• 个人简介
• 导师简介
• 代表论文
• 致谢
• 附录