纤维蛋白溶解酶的发酵制备、分离纯化及酶学性质研究

纤维蛋白溶解酶的发酵制备、分离纯化及酶学性质研究

论文摘要

微生物种类繁多、分布广泛,从自然界中筛选纤维蛋白溶解酶产生菌,进一步开发高效、特异、安全、廉价的新型溶栓药物具有巨大的社会价值和经济价值。本文从虾酱中分离、筛选出一株纤维蛋白溶解酶产生菌,经纤维蛋白平板检测,表现较强的溶栓效果,并对其进行生理生化性质鉴定,结合16S rDNA序列分析,经中国典型培养物保藏中心(China Center for Type Culture Collection, CCTCC)鉴定为芽孢杆菌,定命名为Bacillus sp. nov. SK006 (CCTCC NO.: M 205071)。本文在摇瓶水平上对该菌发酵产酶的培养基组成进行了优化,并当以葡萄糖为碳源,浓度为2%,胰蛋白胨为氮源,浓度为3%,Na2HPO4·12H2O 1.5%、NaH2PO4·2H2O 0.13%、MgSO4·7H2O 0.05%、CaCl2 0.01%,初始pH 7.0,种龄为18 h,装液量为50 mL/250 mL,接种量为3%,37°C、180 r/min。进一步使用5 L全自动发酵罐对发酵过程的温度、pH和通气量变化对产酶的影响进行了研究,确定了阶段变温策略:0-36 h控制在37oC培养,36 h后至发酵过程结束控制在30oC;阶段调整通气量策略:在菌体的对数生长期,适当加大通气量有利于细胞的积累从而提高酶的产量。在5 L发酵罐研究结果的基础上,构建BP神经网络模型来模拟Bacillus sp. nov. SK006发酵生产纤维蛋白溶解酶过程,对发酵过程的生物量和纤维蛋白溶解酶的产量进行初步拟合、预测,结果表明,BP网络模型对纤维蛋白溶解酶的预测非常具有参考价值。通过Native-PAGE对Bacillus sp. nov. SK006发酵液进行初步活性鉴定,发现发酵液中含有多种具有纤溶活性的同工酶,通过乙醇沉淀、离子交换层析和凝胶过滤层析等一系列分离纯化手段,将其中两种主要的纤维蛋白溶解酶(SPFE-1与SPFE-2)纯化至电泳纯,并结合SDS-PAGE和凝胶过滤对酶的纯度和分子量进行鉴定,分析结果表明,这两种纤维蛋白溶解酶均为单体酶,分子量分别为46.0 kDa和12.3 kDa。SPFE-1在50°C以下相对稳定,在30-40oC保温4 h,相对酶活仍在60%左右,在50°C保温2 h,也能保持60%以上的酶活,而SPFE-2稳定性稍差,但在40oC以下保温2 h仍然保持较高的活力,总的说来,SPFE-1和SPFE-2具有较好的耐热性。SPFE-1与SPFE-2在比较宽的pH范围内都保持稳定,尤其SPFE-2在pH4.0-8.0的范围内稳定性较强。金属离子和酶抑制剂对酶活的影响研究表明:Mg2+和Co2+对SPFE-1几乎没有影响,而Zn2+能增强酶活力,EDTA、Cu2+、Ca2+、Mn2+、Fe3+、Fe2+和Hg2+则分别对酶产生了不同程度的抑制作用,其中以Cu2+,Hg2+抑制作用最为强烈;PMSF和PCMB对SPFE-1的酶活也表现出较为强烈的抑制作用,推测SPFE-1是一种丝氨酸蛋白酶,且活性中心存在半胱氨酸基团。对于SPFE-2来说,Cu2+和Ca2+促进酶活,而Zn2+却抑制酶活。2-mercaptoethanol对酶活也有抑制作用,推测Zn2+与SPFE-2活性中心催化部位的-S-S-结合,改变了酶的催化能力。低浓度的EDTA即可完全抑制SPFE-2,说明SPFE-2可能是一种金属蛋白酶。SPFE-1与SPFE-2对底物具有高度专一性,它们的最适底物为N-Succ-Ala-Ala-Pro-Phe-pNA,该底物是枯草杆菌蛋白酶(subtilisin)或胰凝乳蛋白酶(chymotrypsin)的最适底物,也是纳豆激酶的最适底物。采用Hanes-Woolf法作图法,求得它们作用最佳底物的特征常数分别为Km:0.60/0.51 mmol/L;kcat:712.93/154.25 s-1;kcat/Km:1.19×106/3.02×105 L·s-1 mol-1 (SPFE-1/SPFE-2)。SPFE-1与SPFE-2都既可以直接降解纤维蛋白,还对纤维蛋白溶解酶原有激活作用,从而间接降解纤维蛋白。在对纤维蛋白原的降解过程中,SPFE-1最先降解纤维蛋白原的β链,然后是α链,很难降解γ链,而SPFE-2顺次降解α、β和γ链。SPFE-1与SPFE-2的N-端氨基酸序列的前13个残基相同,依次为:AQSVPYEQPHLSQ,虽然与几种芽孢杆菌来源的纤维蛋白溶解酶有一定程度的同源性,但不完全相同于现已发现的纤维蛋白溶解酶。圆二色性分析表明,SPFE-2中β-折叠与回转结构为0,而SPFE-1中存在较大比例的更稳定的β-折叠。

论文目录

  • 摘要
  • ABSTRACT
  • 第一章 绪论
  • 1.1 血栓栓塞性疾病
  • 1.1.1 血栓的形成机理
  • 1.1.2 纤溶
  • 1.2 血栓栓塞疾病的治疗
  • 1.2.1 溶栓药物的研究进展
  • 1.2.2 溶栓剂的主要来源
  • 1.3 发酵食品中的溶栓剂
  • 1.3.1 传统发酵食品纤维蛋白溶解酶种类
  • 1.3.2 不同传统发酵食品纤维蛋白溶解酶同源性比较
  • 1.3.3 微生物发酵法产纤维蛋白溶解酶的研究进展
  • 1.4 纤维蛋白溶解酶活性测定方法
  • 1.4.1 合成发色基质S-2251 测定法(Synthetic substrate S-2251 method)
  • 1.4.2 紫外分光光度计(275 nm)测定法
  • 1.4.3 纤维蛋白平板法
  • 1.4.4 纤维蛋白块溶解时间法
  • 1.4.5 微量稀释法
  • 1.4.6 四肽底物法
  • 1.4.7 血清板法
  • 1.5 本课题的立题依据和意义
  • 1.6 本课题的研究内容
  • 参考文献
  • 第二章 纤维蛋白溶解酶产生菌种的分离、筛选及鉴定
  • 2.1 前言
  • 2.2 材料与方法
  • 2.2.1 主要材料
  • 2.2.2 主要仪器
  • 2.2.3 菌株及保藏条件
  • 2.2.4 培养基
  • 2.2.5 菌种筛选及鉴定
  • 2.2.6 遗传稳定实验
  • 2.3 结果与讨论
  • 2.3.1 菌种的筛选
  • 2.3.2 菌种鉴定
  • 2.3.3 遗传稳定研究试验
  • 2.4 本章小结
  • 参考文献
  • 第三章 Bacillus sp. nov. SK006 发酵产酶过程分析及工艺研究
  • 3.1 前言
  • 3.2 材料与方法
  • 3.2.1 实验材料
  • 3.2.2 实验方法
  • 3.2.3 分析方法
  • 3.3 结果与讨论
  • 3.3.1 芽孢杆菌Bacillus sp. nov. SK006 的种子生长曲线
  • 3.3.2 发酵培养基进一步优化
  • 3.3.3 发酵条件的优化
  • 3.3.4 发酵罐(5 L)扩大培养条件优化
  • 3.4 本章小结
  • 参考文献
  • 第四章 发酵过程动力学模型研究
  • 4.1 前言
  • 4.2 材料与方法
  • 4.2.1 实验材料
  • 4.2.2 实验方法
  • 4.2.3 分析方法
  • 4.3 结果与讨论
  • 4.3.1 BP 网络模型的理论基础
  • 4.3.2 5 L 发酵罐的发酵实验
  • 4.3.3 发酵罐扩大培养生物量模型的建立
  • 4.4 本章小节
  • 参考文献
  • 第五章 两种纤维蛋白溶解酶的分离、纯化及鉴定
  • 5.1 前言
  • 5.2 材料与方法
  • 5.2.1 菌种及保藏方法
  • 5.2.2 主要实验材料
  • 5.2.3 主要实验仪器
  • 5.2.4 主要实验方法
  • 5.3 结果与讨论
  • 5.3.1 乙醇分级沉淀
  • 5.3.2 Native-PAGE 活性鉴定
  • 5.3.3 DEAE-Sepharose CL 6B Fast Folw 离子交换层析
  • 5.3.4 Superdex 75 (10/300 GL) 凝胶过滤层析
  • 5.3.5 纯化结果及SDS-PAGE 电泳鉴定
  • 5.3.6 SPFE-1 与SPFE-2 的活性鉴定
  • 5.4 本章小结
  • 参考文献
  • 第六章 两种纤维蛋白溶解酶的酶学性质研究
  • 6.1 前言
  • 6.2 材料与方法
  • 6.2.1 实验材料
  • 6.2.2 主要实验仪器
  • 6.2.3 主要实验方法
  • 6.3 结果与讨论
  • 6.3.1 温度对酶活及热稳定性的影响
  • 6.3.2 pH 对酶活及稳定性的影响
  • 6.3.3 金属离子及酶抑制剂对酶活的影响
  • 6.3.4 SPFE-1 和SPFE-2 水解酪蛋白活力测定
  • 6.3.5 SPFE-1 和SPFE-2 的底物专一性及反应动力学常数测定
  • 6.3.6 对纤维蛋白溶解酶原的激活作用研究
  • 6.3.7 对纤维蛋白原的作用方式
  • 6.3.8 N-端结构分析
  • 6.3.9 SPFE-1 和SPFE-2 的圆二色性(circular dichroism, CD)
  • 6.4 本章小结
  • 参考文献
  • 论文主要结论
  • 论文创新点
  • 附录:N-端结构分析图谱及标准氨基酸分析图谱
  • 致谢
  • 攻读博士学位期间发表的论文成果
  • 相关论文文献

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