比较基因组杂交技术分析横纹肌肉瘤中染色体基因组的变化及意义

论文摘要

目的:探讨横纹肌肉瘤的基因组变化特征,比较不同融合基因表达类型、不同组织学分型、不同组织学分级以及不同临床病理分期横纹肌肉瘤的基因组变化差异。方法:选用石河子大学附属医院和新疆维吾尔自治区人民医院外科手术切除并经病理组织学证实的25例原发性横纹肌肉瘤（RMS）标本,其中腺泡状横纹肌肉瘤（ARMS）10例,胚胎性横纹肌肉瘤（ERMS）12例,多形性横纹肌肉瘤（PRMS）3例。在一步法RT-PCR检测所有标本中PAX3/7-FKHRmRNA融合基因表达情况的基础上,应用比较基因组杂交技术（CGH）分析RMS基因组的变化:根据融合基因表达情况、组织学分型、临床分期、组织学分级、性别和年龄分组,并比较不同分组的基因组变化差异。同时收集RMS细胞株A204（腺泡型）、RD（胚胎型）作为对照。所有数据资料运用SPSS13.0软件包分析。结果:25例RMS CGH分析结果显示:（1）所有RMS染色体基因组均发生不同程度的变化,其中扩增最常见的是12q（48%）,2p（44%）,8q（40%）,10q（40%）,1p（36%）,6p（36%）,9q（36%）和2q（32%）,6q（32%）,15q（32%）,18q（32%）,其中最常累及的染色体区段为2p24（36%）,12q13（32%）,9q21-22（28%）和6p23-ter（20%）;而缺失最常见的是3p（48%）,6p（36%）和;11p（36%）（2）10例ARMS中,扩增最常见的是12q（70%）,2p（50%）,6（50%）,2q（40%）,4q（40%）,10q（40%）和15q（40%）;缺失最常见的是3p（50%）,6p（50%）,1q（40%）,5q（40%）;12例ERMS中,扩增最常见的是7p（50%）,9q（50%）,18q（50%）,2p（42%）和1p（33%）,8q（33%）;缺失最常见的是11p（42%）。12q13扩增在这两组间的差异有统计学意义（P＜0.05）,并多见于ARMS;（3）8例融合基因表达阳性的RMS中,扩增最常见的是12q（87.5%）,2p（50%）,6（50%）,2q（50%）,10q（50%）,4q（37.5%）和15q（37.5%）,缺失最常见的是3p（50%）,6p（50%）,5q（50%）,1q（37.5%）:而其余融合基因表达阴性的RMS中,扩增最常见的是2p（41%）,9q（41%）,18q（41%）,7p（35%）和8q（35%）。基因组缺失最常见的是11p（35%）和14q（35%）。其中12q13扩增在两组间的差异有统计学意义（P＜0.05）,并多见于伴有融合基因的RMS。（4）在不同临床分期中,9q扩增在Ⅱ期和Ⅲ～Ⅳ期间差异有统计学意义（P＜0.05）,且多见于Ⅱ期患者。（5）6p扩增在组织学3级和临床3-4期发生频率较高。（6）细胞株染色体基因组最常见的变化与RMS组织相似,包括2p22-24,12q12-14,9q21-22扩增与6p22-23,11p12-14缺失。结论:（1）染色体2p,12q,6p,9q,10q,1p,2q,6q,8q,15q,18q扩增及3p,11p,6p缺失可能与RMS发病相关;（2）12q扩增可能与RMS融合基因表达相关;（3）9q扩增可能是RMS的早期分子遗传事件,6p扩增可能是RMS的晚期分子遗传事件。

论文目录

• 中文摘要
• 英文摘要
• 英文缩略语表
• 前言
• 材料与方法
• 1 材料
• 2 方法
• 2.1 临床病理学研究内容和方法
• 2.2 细胞培养
• 2.3 一步法逆转录聚合酶链反应检测PAX3/7-FKHR mRNA融合基因
• 2.4 比较基因组杂交（CGH）
• 2.5 统计学分析
• 结果
• 1 临床病理资料
• 2 PAX3/7-FKHR融合基因的表达
• 3 横纹肌肉瘤/细胞株CGH分析结果
• 3.1 原发性横纹肌肉瘤CGH分析结果
• 3.2 横纹肌肉瘤细胞株A204、RD染色体变化分析结果
• 3.3 染色体变化与组织学类型之间的关系
• 3.4 染色体变化与融合基因表达状态之间的关系
• 3.5 染色体变化与年龄、性别、组织学分级及临床分期之间的关系
• 讨论
• 结论
• 参考文献
• 文献综述
• 致谢
• 作者简介
• 导师评阅表