导读:本文包含了泛素延伸基因论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献，主要关键词:牡丹,ubiquitin,基因克隆,表达分析
泛素延伸基因论文文献综述
刘传娇,王顺利,薛璟祺,朱富勇,任秀霞[1]（2015）在《牡丹泛素延伸蛋白基因ubiquitin的克隆及其作为内参基因的研究》一文中研究指出以牡丹品种‘洛阳红’(Paeonia suffruticosa‘Luoyanghong’)为试验材料,采用RT-PCR方法获得一个牡丹泛素延伸蛋白基因Psubiquitin(PsU BI),其c DNA开放阅读框(ORF)长度为447 bp,编码148个氨基酸,Gen Bank登录号为KP742952。序列比对发现,该基因与其他23种植物泛素延伸蛋白核苷酸序列的相似性均在81%以上,氨基酸序列的相似性达96%。进化分析表明,牡丹泛素延伸蛋白与棉花泛素延伸蛋白的亲缘关系最近。实时荧光定量PCR结果显示,在牡丹不同组织器官中,相对于其他5个常用看家基因(GAPDH、GAPDH1、tubulin、tubulin2、18S r RNA),ubiquitin的PCR扩增曲线的CT值最为恒定,尤其是在不同花器官中的CT值完全一致。进一步分析发现该基因在牡丹的根、茎、叶片、花、雄蕊和心皮组织中均恒定表达,特别是花器官中的表达量几乎完全一致。以ubiquitin作为内参基因探讨控制花器官发育的基因Ps AG的表达情况,结果显示PsA G的表达模式与其作用位点相吻合,ubiquitin更适宜作为牡丹花器官研究的内参基因。(本文来源于《园艺学报》期刊2015年10期）
王彦杰,张超,王晓庆,马越,刘爱青[2]（2013）在《牡丹泛素延伸蛋白基因片段克隆与表达分析》一文中研究指出采用RT-PCR技术从牡丹(Paeonia suffruticosa)花瓣中克隆得到泛素延伸蛋白基因的cDNA片段,该片段长423bp,编码140个氨基酸残基,命名为PsUBQ,GenBank登录号为JN699053。PsUBQ编码的蛋白是在泛素单体后融合了1个核糖体S27a多肽,经多重序列比对发现该蛋白与拟南芥(Arabidopsis thaliana)、甜樱桃(Prunus avium)、葡萄(Vitis vinifera)等高等植物泛素延伸蛋白的氨基酸序列具有很高的一致性。实时荧光定量PCR分析表明:PsUBQ在牡丹不同组织间表达较稳定,且在切花开放各级别花瓣中呈组成型表达。PsUBQ的克隆与表达为进一步探讨牡丹开放衰老进程中泛素对激素信号的作用机制打下基础,同时为研究牡丹目标基因的表达提供校正标准。(本文来源于《扬州大学学报(农业与生命科学版)》期刊2013年01期）
周晓慧,戴斌,王韡,陆小平[3]（2013）在《桑树泛素延伸蛋白基因的原核表达》一文中研究指出对前期克隆的桑树泛素延伸蛋白基因进行了生物信息学及原核表达分析,以pGEX-4T-1为载体,构建了桑树泛素延伸蛋白基因重组表达质粒,转入受体菌E.coli BL21。经IPTG诱导后,基因在大肠杆菌中得到有效表达。为提高表达效果,从不同诱导时间对目的蛋白表达条件进行优化,用SDS-PAGE电泳检测,结果表明在经37℃条件下,经1.0 mmol/L的IPTG诱导6 h后,原核表达效果明显提高。研究表明,桑树泛素延伸蛋白基因与其他植物具有较高的同源性,因此利用模式植物研究其功能及分子进化分析更加高效,为进一步探讨桑树的逆境生理机制提供了理论依据。(本文来源于《丝绸》期刊2013年01期）
沙伟,于冰,刘卓[4]（2012）在《毛尖紫萼藓泛素延伸蛋白基因克隆及序列分析》一文中研究指出目的:该文首次从毛尖紫萼藓中克隆到泛素延伸蛋白基因的全长,为深入研究其功能打下基础。方法:提取植物的总RNA,经反转录得到cDNA,根据实验室得到的毛尖紫萼藓泛素延伸蛋白基因的EST序列设计引物,基于3’RACE(Rapid Ampli-fication of cDNA End)技术克隆得到全长序列,使用分子生物学软件进行序列分析。结果:获得了cDNA全序列,GenBank登录号为JQ659260,序列全长为673bp,开放阅读框为471 bp,编码156个氨基酸残基。结论:通过Blast P对其编码的氨基酸序列进行比对结果显示:毛尖紫萼藓泛素延伸蛋白与小立碗藓、北美云杉、葡萄、蓖麻、毛果杨、紫茎泽兰的泛素延伸蛋白的同源性均在96%以上。(本文来源于《生物技术》期刊2012年03期）
强承魁,王胜永,凤舞剑,于玲雅,秦越华[5]（2011）在《不同昆虫泛素延伸蛋白基因的生物信息学分析》一文中研究指出采用生物信息学方法系统分析了甜菜夜蛾、菜粉蝶、烟夜蛾和黑腹果蝇泛素延伸蛋白(UBE)基因序列的遗传多样性、分子进化及其编码氨基酸序列的结构功能域和基序特点。结果显示,4种昆虫UBE基因序列的同源性较高(81.8%~99.7%),且遗传距离较近(0.003~0.199),均编码ubiquitin/L40 UBE。共检出81个多态位点,生成4个单倍型,单倍型多样性(Hd=1.000)、平均核苷酸差异数(K=45.883)、核苷酸多样性(Pi=0.112 97)、同义替换核苷酸多样性均值(Pi(s)=0.415 01)、非同义替换核苷酸多样性均值(Pi(a)=0.024 89)、密码子有效值(ENC=38.070~53.458<61)、偏爱指标(CBI=0.437~0.729>0)和χ2检验计算值(χ2=0.454~0.960)表明这4种昆虫UBE基因的遗传多样性较丰富且呈现较强的密码子偏爱性。4条氨基酸序列均含泛素同系物结构域和Ribosomal/L 40结构域各1个,未见信号肽和跨膜结构域;共含14条基序,其中Se-UBE和Dm-UBE基因编码的氨基酸序列各具1个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点和2个蛋白激酶C磷酸化位点,Pr-UBE和Ha-UBE基因编码的序列则各含2个酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位点和2个蛋白激酶C磷酸化位点。研究结果为进一步开展UBE基因分子进化机制、表达特性及昆虫病毒侵染关系等方面的研究提供基础信息。(本文来源于《河南农业科学》期刊2011年03期）
李晓梅,陈永,李珣,钟国华[6]（2011）在《小菜蛾泛素延伸蛋白基因的克隆与原核表达》一文中研究指出利用RT-PCR和RACE技术,以小菜蛾(Plutella xylostella)3龄幼虫的cDNA为模板,克隆获得泛素延伸蛋白基因Px-ubi(GenBank No.FJ527489),核苷酸序列全长537 bp,其中开放阅读框全长387 bp,编码129个氨基酸残基,预测分子质量为16.7 ku,等电点为9.1,与已知真核生物泛素延伸蛋白的同源性为92%～98%。RT-PCR结果显示Px-ubi在小菜蛾不同生长发育时期均有表达,其中卵期、3龄期和预蛹期含量较高,而成虫期含量较低。同源建模显示,Px-ubi的3D结构主要由1个α螺旋、4个β折叠以及β转角和不规则卷曲组成,4个β折叠两两反向平行排列在α螺旋的一侧。将该基因重组到表达载体pET-32a(+)中,获得重组载体pET32a-Px-ubi,并转入原核细胞中表达。SDS-PAGE和Western blot分析表明,经IPTG诱导后,Px-ubi能在大肠杆菌BL21中高效表达,电泳检测到1条约16.7 ku的外源蛋白,与预测的蛋白分子质量吻合。(本文来源于《华中农业大学学报》期刊2011年01期）
贾培义,董丽,王彦杰,张超[7]（2010）在《牡丹泛素延伸蛋白基因片段的克隆及序列分析》一文中研究指出目的:利用巢式PCR技术克隆牡丹泛素延伸蛋白基因,为泛素蛋白降解系统研究奠定基础,也为牡丹基因表达水平研究提供内参基因。方法:从牡丹(Paeonia suffruticosa)叶片、花瓣、花萼中提取总RNA,反转录得到cDNA,根据已报道的泛素延伸蛋白基因设计巢式引物进行PCR扩增。结果:得到一条389bp的牡丹泛素延伸蛋白基因片段,该片段编码129个氨基酸残基。结论:通过Blastn比对分析表明:牡丹泛素延伸蛋白基因与番茄、水稻、拟南芥等植物的泛素延伸蛋白基因一致性达到100%,编码的氨基酸序列同源性达94%以上。确认该片段即牡丹泛素延伸蛋白基因。(本文来源于《生物技术》期刊2010年04期）
陆月赏,刘颖慧,张登峰,石云素,宋燕春[8]（2010）在《玉米泛素延伸蛋白基因ZmERD16的克隆、序列特征和表达分析》一文中研究指出在前期研究中发现一个玉米苗期早期应答干旱的EST序列与拟南芥泛素延伸蛋白ERD16序列同源性很高。本研究根据拟南芥AtERD16序列,应用同源克隆技术分离出玉米泛素延伸蛋白基因,命名为ZmERD16。ZmERD16的开放阅读框为390bp,编码129个氨基酸,等电点pI为9.94,分子量为14.7582kD。ZmERD16蛋白包含1个泛素单体蛋白,其后融合了53个氨基酸的核糖体多肽,属于泛素延伸蛋白亚族。ZmERD16具有4个外显子3个内含子的基因组结构,其启动子区域具有多个干旱、病害、水杨酸、乙烯、真菌等胁迫响应应答元件。蛋白结构预测显示ZmERD16无跨膜结构,定位于细胞质和细胞核中。利用实时荧光定量PCR对ZmERD16的组织表达特异性和在不同胁迫条件下的表达谱分析表明,ZmERD16在各组织中均表达,其表达量受盐、脱水、PEG、低温、高温、茉莉酸甲酯和水杨酸等多种胁迫信号诱导。推测ZmERD16可能参与玉米的多种胁迫信号传导和逆境应答进程。(本文来源于《作物学报》期刊2010年07期）
陆月赏[9]（2010）在《玉米泛素延伸蛋白ZmERD16的基因克隆与功能分析》一文中研究指出玉米是重要的粮、经、饲兼用作物。在世界粮食作物中其种植面积和总产量已超过水稻和小麦,处于所有作物之首。低温、干旱、盐碱等逆境条件严重影响玉米的质量和产量,其中水分胁迫是影响玉米产量最主要非生物胁迫因素之一。近年来研究发现,许多受水分胁迫影响的植物基因在响应多种胁迫中发挥着重要作用。发掘抗旱相关基因及研究抗旱基因在植物逆境信号转导中的调控作用,对于提高水分利用率,节省水资源,减少干旱危害,实现可持续发展,具有重要的现实意义。ERD(early responsive to dehydration)基因是一类对水分胁迫做出快速应答的基因。Kiyosue等最先在拟南芥水分胁迫1小时后分离到16个ERD基因全长cDNA序列,其中包括一个泛素延伸蛋白AtERD16。泛素延伸蛋白可通过降解异常的蛋白而对植物细胞起保护作用。本研究以抗旱玉米自交系CN165为试材,克隆玉米中与拟南芥AtERD16基因序列同源的泛素延伸蛋白基因,命名为ZmERD16。通过生物信息学手段预测该基因结构和序列特点;采用实时荧光定量PCR方法对ZmERD16进行表达谱分析;通过农杆菌转化拟南芥对其进行功能的初步研究。主要研究结果如下:1. ZmERD16基因的克隆应用同源克隆技术从抗旱玉米自交系CN165中得到1个泛素延伸蛋白序列,与AtERD16基因序列高度相似,命名为ZmERD16。同时利用PCR方法得到了ZmERD16的基因组DNA序列3252 bp和其上游启动子序列2190 bp。2. ZmERD16的序列分析在线分析表明ZmERD16的开放阅读框为390 bp,编码129个氨基酸,等电点pI为9.94,分子量为14.7582KD。ZmERD16蛋白包含1个泛素单体蛋白,其后融合了一个53个氨基酸的核糖体多肽,属于ubiquitin/L40泛素延伸蛋白亚族。ZmERD16具有由4个外显子3个内含子构成的基因组结构。3.同源性比对和进化树分析ZmERD16蛋白与其他真核生物中的ubiquitin/L40泛素延伸蛋白序列具有高度同源性。聚类分析将所聚类的植物分为单子叶植物、双子叶植物和绿藻3类,此结果与生物进化有高度的相关性。4.亚细胞定位利用绿色荧光蛋白(GFP)融合蛋白技术来进行洋葱表皮实验,将ZmERD16定位于细胞质和细胞核中。5.顺式作用元件分析该基因的启动子区域具有多个光应答、发育、激素、干旱、病害防御、真菌等胁迫应答元件。6. ZmERD16的表达谱分析利用实时荧光定量PCR对ZmERD16的组织特异性和在不同胁迫条件下的表达谱进行分析,结果显示ZmERD16在正常生长条件下玉米的雌穗、雄穗、幼胚、花丝、穗位叶、幼叶和根中均具有一定量的积累;ZmERD16受盐、脱水、PEG、低温、高温、茉莉酸甲酯和水杨酸等多种胁迫的诱导表达,而不受ABA和类生长素处理诱导表达。7. ZmERD16基因转化野生型拟南芥ZmERD16过表达影响了拟南芥的生长发育,转基因株系的幼苗比野生型的幼苗明显要小,且转基因株系的抽薹期延迟;ZmERD16过表达提高了拟南芥在盐处理条件下的萌芽率和拟南芥在盐和干旱处理下的存活率。(本文来源于《东北农业大学》期刊2010-04-07）
唐晓凤[10]（2009）在《菊花泛素延伸蛋白基因启动子DgUEP的克隆和功能初探》一文中研究指出启动子是基因表达调控的重要元件。在转基因植物中,启动子是影响转基因表达效率的重要因素之一,选择高效率的启动子是高效率表达外源基因的关键。泛素启动子以其启动效率高、甲基化程度相对较低、遗传性状稳定等特点而成为目前研究较多的启动子之一。在植物基因工程中,通过构建由该类启动子驱动的外源基因高效表达载体,可获得高水平的表达系统,为作物转基因工程提供新的手段和思路。因而,克隆和开发利用新的泛素类新启动子在转基因植物中有重要的理论意义和重大的应用前景。鉴于此,本研究以克隆新的泛素类基因启动子为目的,通过从Genbank中筛选部分不同物种中的泛素延伸蛋白类基因序列,如花生(Arachis hypogaea)、烟草(Nicotiana tabacum)、蕃茄(Solanum lycopersicum)、甜椒(Capsicum annuum)、致倦库蚊(Culex quinquefasciatus)、水稻(Oryza sativa)等。根据这些序列同源性区域设计嵌套引物,利用锚定PCR法扩增得到菊花(Dendranthema grandiflora)泛素延伸蛋白基因起始密码子上游1472 bp启动子序列,命名为DgUEP(Genbank登录号为EU862325)。利用生物信息学预测获得的菊花泛素延伸蛋白基因启动子的基础启动子和转录起始位点。结果显示在-1286 bp～-1236 bp、-318 bp～-268 bp和-98 bp～-48 bp的位置存在基础启动子序列,其可能性分别为0.93、0.93和0.95。其中,后两个基础肩动子区相邻较近。DgUEP肩动子除了具备肩动子的基本元件和一些光应答顺式作用元件外(如TATA-box、CAAT-box、G-Box、GAG-motif、GATA-motif等),还含有一些花特异性表达的顺式作用元件,如anther box like、TACPyAT-box、POLLENlLELAT52、P-box等。将DgUEP启动子目的序列定向替换植物双元表达载体pBI121中的35S启动子,并将其与GUS报告基因融合;通过农杆菌转化法在烟草叶片和菊花花瓣中进行瞬时表达。结果表明,该启动子能驱动GUS基因在烟草叶片和菊花花瓣中表达,证明其具有启动子活性。结合生物信息学分析结果,根据DgUEP启动子中可能的转录起始位点和花特异性表达的顺式作用元件等特征,利用PCR介导技术分别对启动子进行了3'和5'端缺失突变,并将各突变体在烟草叶片和菊花花瓣中进行瞬时表达分析。GUS活性分析发现3'端最小片段(-404bp～+4bp)和5'端最小片段(-1457bp～-1027bp)都具有转录活性,表明该启动子可能含有多个转录起始位点。GUS定量分析结果显示:该启动子主要转录起始位点可能位于翻译起始密码子ATG上游较远处(-1457bp～-1027bp);-1027bp～-604bp处可能存在着负调控元件,-1457bp～-1027bp片段间可能还存在增强元件;DgUEP启动子在花瓣中的活性明显高于叶片中的活性。结合生物信息学分析结果,本实验推测该启动子可能主要在花中表达。同时,还利用农杆菌介导法将含有DgUEP启动子不同缺失片段和GUS融合基因的表达载体转化烟草进行稳定表达,已得到转基因烟草阳性苗。(本文来源于《四川农业大学》期刊2009-05-01）
泛素延伸基因论文开题报告
（1）论文研究背景及目的
此处内容要求：
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景，再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题，并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例：
采用RT-PCR技术从牡丹(Paeonia suffruticosa)花瓣中克隆得到泛素延伸蛋白基因的cDNA片段,该片段长423bp,编码140个氨基酸残基,命名为PsUBQ,GenBank登录号为JN699053。PsUBQ编码的蛋白是在泛素单体后融合了1个核糖体S27a多肽,经多重序列比对发现该蛋白与拟南芥(Arabidopsis thaliana)、甜樱桃(Prunus avium)、葡萄(Vitis vinifera)等高等植物泛素延伸蛋白的氨基酸序列具有很高的一致性。实时荧光定量PCR分析表明:PsUBQ在牡丹不同组织间表达较稳定,且在切花开放各级别花瓣中呈组成型表达。PsUBQ的克隆与表达为进一步探讨牡丹开放衰老进程中泛素对激素信号的作用机制打下基础,同时为研究牡丹目标基因的表达提供校正标准。
（2）本文研究方法
调查法：该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法：用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法：通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法：通过调查文献来获得资料，从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法：依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法：对研究对象进行“质”的方面的研究，这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法：通过具体的数字，使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法：运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法：这是社会科学用来分析社会现象的一种方法，从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法：通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
泛素延伸基因论文参考文献
[1].刘传娇,王顺利,薛璟祺,朱富勇,任秀霞.牡丹泛素延伸蛋白基因ubiquitin的克隆及其作为内参基因的研究[J].园艺学报.2015
[2].王彦杰,张超,王晓庆,马越,刘爱青.牡丹泛素延伸蛋白基因片段克隆与表达分析[J].扬州大学学报(农业与生命科学版).2013
[3].周晓慧,戴斌,王韡,陆小平.桑树泛素延伸蛋白基因的原核表达[J].丝绸.2013
[4].沙伟,于冰,刘卓.毛尖紫萼藓泛素延伸蛋白基因克隆及序列分析[J].生物技术.2012
[5].强承魁,王胜永,凤舞剑,于玲雅,秦越华.不同昆虫泛素延伸蛋白基因的生物信息学分析[J].河南农业科学.2011
[6].李晓梅,陈永,李珣,钟国华.小菜蛾泛素延伸蛋白基因的克隆与原核表达[J].华中农业大学学报.2011
[7].贾培义,董丽,王彦杰,张超.牡丹泛素延伸蛋白基因片段的克隆及序列分析[J].生物技术.2010
[8].陆月赏,刘颖慧,张登峰,石云素,宋燕春.玉米泛素延伸蛋白基因ZmERD16的克隆、序列特征和表达分析[J].作物学报.2010
[9].陆月赏.玉米泛素延伸蛋白ZmERD16的基因克隆与功能分析[D].东北农业大学.2010
[10].唐晓凤.菊花泛素延伸蛋白基因启动子DgUEP的克隆和功能初探[D].四川农业大学.2009