杨雪:基于转录组测序筛选维生素D调节肉鸡十二指肠钙和磷吸收的差异表达基因论文

杨雪:基于转录组测序筛选维生素D调节肉鸡十二指肠钙和磷吸收的差异表达基因论文

本文主要研究内容

作者杨雪,汪晓娜,张宁,瞿红侠,施传信,张进良,闫永峰,郑永祥,王志祥,韩进诚(2019)在《基于转录组测序筛选维生素D调节肉鸡十二指肠钙和磷吸收的差异表达基因》一文中研究指出:本试验利用转录组测序技术(RNA-seq)筛选维生素D调节肉鸡十二指肠钙和磷吸收的功能基因和信号通路。以1~16日龄罗斯308肉鸡为试验动物,设计3种饲粮,分别在基础饲粮(不含维生素D)中添加0(对照)、5、10μg/kg 1,25-二羟基维生素D3[1,25-(OH)2-D3]。16日龄时屠宰肉鸡,刮取十二指肠黏膜,利用转录组测序技术,对差异表达基因进行GO(gene ontology)功能注释和KEGG (kyoto encyclopedia of genes and genomes)信号通路富集。结果表明:1)与对照组相比,添加5和10μg/kg 1,25-(OH)2-D3显著改善肉鸡生长性能(P<0.05),增强股骨和胫骨矿化;但10μg/kg 1,25-(OH)2-D3组肉鸡胫骨与股骨的重量、长度和灰分重量显著低于5μg/kg 1,25-(OH)2-D3组(P <0.05)。2)分别进行0 vs. 5μg/kg、0 vs. 10μg/kg、5 vs.10μg/kg 1,25-(OH)2-D3组间的比较,在各组间筛选出1 029、939和642个差异表达基因。3)经GO功能注释,筛选出细胞膜维生素D受体(PDIA3)、细胞核维生素D受体(VDR)、Ⅱb型钠磷转运载体蛋白(SLC34A2)、无机磷转运载体蛋白2(SLC20A2)、钙结合蛋白D28k(CALB1)、钙离子转运ATP酶B1(ATP2B1)、钙离子转运ATP酶B2(ATP2B2)、钠钙交换蛋白(SLC8A1)、成纤维细胞生长因子1(FGF1)和成纤维细胞生长因子19(FGF19)等差异表达基因,这些基因富集到十二指肠中调节钙和磷吸收代谢的过程。4) KEGG通路富集结果显示,差异表达基因富集到丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)信号通路、环磷酸腺苷(cAMP)信号通路或环磷酸腺苷-蛋白激酶A(cAMP-PKA)信号传导通路和环磷酸鸟苷-蛋白激酶G(cGMP-PKG)信号通路。5)选出4个差异表达基因进行实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测,结果显示qRT-PCR与转录组测序结果基本一致。综上,本试验筛选出维生素D调节肉鸡十二指肠钙和磷吸收的关键基因和信号通路,为改善肉鸡钙和磷利用率奠定理论基础。

Abstract

ben shi yan li yong zhuai lu zu ce xu ji shu (RNA-seq)shai shua wei sheng su Ddiao jie rou ji shi er zhi chang gai he lin xi shou de gong neng ji yin he xin hao tong lu 。yi 1~16ri ling luo si 308rou ji wei shi yan dong wu ,she ji 3chong si liang ,fen bie zai ji chu si liang (bu han wei sheng su D)zhong tian jia 0(dui zhao )、5、10μg/kg 1,25-er qiang ji wei sheng su D3[1,25-(OH)2-D3]。16ri ling shi tu zai rou ji ,gua qu shi er zhi chang nian mo ,li yong zhuai lu zu ce xu ji shu ,dui cha yi biao da ji yin jin hang GO(gene ontology)gong neng zhu shi he KEGG (kyoto encyclopedia of genes and genomes)xin hao tong lu fu ji 。jie guo biao ming :1)yu dui zhao zu xiang bi ,tian jia 5he 10μg/kg 1,25-(OH)2-D3xian zhe gai shan rou ji sheng chang xing neng (P<0.05),zeng jiang gu gu he jing gu kuang hua ;dan 10μg/kg 1,25-(OH)2-D3zu rou ji jing gu yu gu gu de chong liang 、chang du he hui fen chong liang xian zhe di yu 5μg/kg 1,25-(OH)2-D3zu (P <0.05)。2)fen bie jin hang 0 vs. 5μg/kg、0 vs. 10μg/kg、5 vs.10μg/kg 1,25-(OH)2-D3zu jian de bi jiao ,zai ge zu jian shai shua chu 1 029、939he 642ge cha yi biao da ji yin 。3)jing GOgong neng zhu shi ,shai shua chu xi bao mo wei sheng su Dshou ti (PDIA3)、xi bao he wei sheng su Dshou ti (VDR)、Ⅱbxing na lin zhuai yun zai ti dan bai (SLC34A2)、mo ji lin zhuai yun zai ti dan bai 2(SLC20A2)、gai jie ge dan bai D28k(CALB1)、gai li zi zhuai yun ATPmei B1(ATP2B1)、gai li zi zhuai yun ATPmei B2(ATP2B2)、na gai jiao huan dan bai (SLC8A1)、cheng qian wei xi bao sheng chang yin zi 1(FGF1)he cheng qian wei xi bao sheng chang yin zi 19(FGF19)deng cha yi biao da ji yin ,zhe xie ji yin fu ji dao shi er zhi chang zhong diao jie gai he lin xi shou dai xie de guo cheng 。4) KEGGtong lu fu ji jie guo xian shi ,cha yi biao da ji yin fu ji dao si lie yuan huo hua dan bai ji mei (MAPK)xin hao tong lu 、huan lin suan xian gan (cAMP)xin hao tong lu huo huan lin suan xian gan -dan bai ji mei A(cAMP-PKA)xin hao chuan dao tong lu he huan lin suan diao gan -dan bai ji mei G(cGMP-PKG)xin hao tong lu 。5)shua chu 4ge cha yi biao da ji yin jin hang shi shi ying guang ding liang PCR(qRT-PCR)jian ce ,jie guo xian shi qRT-PCRyu zhuai lu zu ce xu jie guo ji ben yi zhi 。zeng shang ,ben shi yan shai shua chu wei sheng su Ddiao jie rou ji shi er zhi chang gai he lin xi shou de guan jian ji yin he xin hao tong lu ,wei gai shan rou ji gai he lin li yong lv dian ding li lun ji chu 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自动物营养学报的杨雪,汪晓娜,张宁,瞿红侠,施传信,张进良,闫永峰,郑永祥,王志祥,韩进诚,发表于刊物动物营养学报2019年11期论文,是一篇关于肉鸡论文,十二指肠论文,钙磷代谢论文,差异表达基因论文,信号通路论文,动物营养学报2019年11期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自动物营养学报2019年11期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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