导读:本文包含了石斛凝集素论文开题报告文献综述及选题提纲参考文献,主要关键词:NAC,分子建模,凝集素,基因组
石斛凝集素论文文献综述
朱梦丽[1](2015)在《铁皮石斛甘露糖结合凝集素的分子建模与对接研究,及NAC基因组序列的克隆》一文中研究指出单子叶植物甘露糖结合凝集素(monocot mannose-binding lectin, MBL)在植物抵御害虫,病原微生物和植食性动物中起重要作用。基于植物MBL的重要作用,本文在推导其编码的氨基酸基础之上对铁皮石斛甘露糖结合凝集素(Dendrobium officinale mannose-binding lectin, DOL)进行同源建模、分子对接和动力学模拟,进一步研究DOL的结构特征及其与甘露糖的具体作用机制,为研究铁皮石斛的药效及新品种的选育提供有用的信息。NAC是植物特有的一类转录因子家族,功能涉及植物多种生理过程。作为重要的观赏药用植物铁皮石斛因为全基因组测序数据缺乏,而为了弄清NAC对下游靶基因的调控作用机制,其中一个重要的方面就是要先对其进行分子结构及序列特征分析。本文还对目前常用的染色体步移技术进行了比较选择,对现有的方法进行了改进和完善,主要获得了21条NAC基因片段,长度在117-3859bp之间,G+C含量均在35~53%之间,推导的编码氨基酸残基数介于39~821个之间,大多数成员在5’端均有一段保守基序,根据系统发育分析可将其划分为A、B、C、D四个分支,其中NAC1、 NAC3、NAC4、NAC9、NAC16、NAC21、NAC43可能与器官边界和分生组织的形成相关,NAC29可能与胁迫相关,而NAC13可能与细胞分裂相关,NAC2、NAC11、NAC17、 NAC22、NAC45及NAC6、NAC12分别单独聚为B、C分支,所以,我们认为B、C这两个分支的出现可能预示着NAC家族还有未鉴定的新功能;并对系统发育树中同源性相近的4条序列,NAC3、NAC4、NAC16、NAC21进行了密码子偏好分析,通过该基因同某些功能的关联程度以及密码子使用偏好性作为切入点进行分析预测,对未知表达水平的基因进行判定;本文还对铁皮石斛NAC基因组和拟南芥、水稻、番茄做了密码子使用偏性比较,为NAC基因之后的克隆打下基础。(本文来源于《西南交通大学》期刊2015-05-01)
陈中海[2](2004)在《马蹄莲、石斛和姜凝集素基因的克隆及分析》一文中研究指出凝集素是一类含有至少一个非催化结构域并能可逆结合到特异单糖或寡糖上的蛋白质。单子叶植物甘露糖结合型凝集素(monocot mannose-binding agglutinins)是其中比较大的一个家族,其中以雪花莲凝集素为代表的一个亚类显示出良好的抗同翅目昆虫活性,以天麻抗真菌蛋白为代表的另一亚类则具有突出的抗真菌活性,它们在植物抗虫和抗病基因工程中均具有很大的应用潜力。 为了挖掘更多更有效的抗病、抗虫基因,本文对植物凝集素基因进行研究,以马蹄莲、石斛和姜为材料,利用RACE-PCR技术,成功地从中克隆出了凝集素基因,并对其功能进行了研究,得到如下结果: 1.首次从天南星科植物马蹄莲中克隆了马蹄莲凝集素基因zaa,zaa的全长cDNA为871bp,含有一个417bp的开放阅读框,编码一个由138个氨基酸组成的前体蛋白。对ZAA和其他单子叶甘露糖结合凝集素的序列同源性进行了比较,并发现zaa是由一个多基因家族编码的。半定量RT-PCR表明zaa在马蹄莲植物的各个部位都有表达,其中在叶柄中的表达量最高。 2.克隆了马蹄莲凝集素基因的包含启动子区、终止子区和全长基因组序列,并对其启动子区基本活性元件和抗病相关的元件以及其它的元件进行了预测。启动子区具有核心启动子,终止子富含A+T序列,形成发夹结构,具备终止子的特征。 3.构建了zaa基因的植物表达载体pCAMBIA1304—zaa并导入到根癌农杆菌EHA105中,对烟草进行了转化。 4.从兰科植物铁皮石斛中克隆了石斛凝集素基因doa1和doa2,doa1的全长cDNA为768bp,含有一个498bp的开放阅读框,编码165个氨基酸;doa2的全长cDNA为777bp,含有一个513bp的开放阅读框,编码170个氨基酸。 5.首次从姜科植物姜中克隆了姜凝集素基因zoa,姜凝集素基因的全长为768bp,含有一个510bp的开放阅读框,编码169个氨基酸。分析表明,姜凝集素属于单子叶甘露糖结合的凝集素,该研究不仅把这一家族凝集素(甘露糖结合凝集素)延伸到了姜科,而且有助于进一步研究凝集素的进化关系。 6.分别构建了含aha(天南星凝集素)、doa2和zoa基因的原核表达载体,并成功地实现了这叁个基因在E.coli中的表达,并对其重组的蛋白进行了纯化。从植物中提取了天然的AHA和ZOA,作为对照进行了凝血活性实验。结果表明重组AHA和ZOA具有和天然蛋白一样的凝血活性。抑菌实验表明,重组DOA2和ZOA能明显抑制小麦赤霉病菌的生长。 马蹄莲、石斛和姜凝集素基因的克隆为深入研究其抗病虫害功能打下了基础,该研究对获得更多具有自主知识产权的功能基因、为利用基因工程技术改良农作物抗病(本文来源于《复旦大学》期刊2004-11-15)
石斛凝集素论文开题报告
(1)论文研究背景及目的
此处内容要求:
首先简单简介论文所研究问题的基本概念和背景,再而简单明了地指出论文所要研究解决的具体问题,并提出你的论文准备的观点或解决方法。
写法范例:
凝集素是一类含有至少一个非催化结构域并能可逆结合到特异单糖或寡糖上的蛋白质。单子叶植物甘露糖结合型凝集素(monocot mannose-binding agglutinins)是其中比较大的一个家族,其中以雪花莲凝集素为代表的一个亚类显示出良好的抗同翅目昆虫活性,以天麻抗真菌蛋白为代表的另一亚类则具有突出的抗真菌活性,它们在植物抗虫和抗病基因工程中均具有很大的应用潜力。 为了挖掘更多更有效的抗病、抗虫基因,本文对植物凝集素基因进行研究,以马蹄莲、石斛和姜为材料,利用RACE-PCR技术,成功地从中克隆出了凝集素基因,并对其功能进行了研究,得到如下结果: 1.首次从天南星科植物马蹄莲中克隆了马蹄莲凝集素基因zaa,zaa的全长cDNA为871bp,含有一个417bp的开放阅读框,编码一个由138个氨基酸组成的前体蛋白。对ZAA和其他单子叶甘露糖结合凝集素的序列同源性进行了比较,并发现zaa是由一个多基因家族编码的。半定量RT-PCR表明zaa在马蹄莲植物的各个部位都有表达,其中在叶柄中的表达量最高。 2.克隆了马蹄莲凝集素基因的包含启动子区、终止子区和全长基因组序列,并对其启动子区基本活性元件和抗病相关的元件以及其它的元件进行了预测。启动子区具有核心启动子,终止子富含A+T序列,形成发夹结构,具备终止子的特征。 3.构建了zaa基因的植物表达载体pCAMBIA1304—zaa并导入到根癌农杆菌EHA105中,对烟草进行了转化。 4.从兰科植物铁皮石斛中克隆了石斛凝集素基因doa1和doa2,doa1的全长cDNA为768bp,含有一个498bp的开放阅读框,编码165个氨基酸;doa2的全长cDNA为777bp,含有一个513bp的开放阅读框,编码170个氨基酸。 5.首次从姜科植物姜中克隆了姜凝集素基因zoa,姜凝集素基因的全长为768bp,含有一个510bp的开放阅读框,编码169个氨基酸。分析表明,姜凝集素属于单子叶甘露糖结合的凝集素,该研究不仅把这一家族凝集素(甘露糖结合凝集素)延伸到了姜科,而且有助于进一步研究凝集素的进化关系。 6.分别构建了含aha(天南星凝集素)、doa2和zoa基因的原核表达载体,并成功地实现了这叁个基因在E.coli中的表达,并对其重组的蛋白进行了纯化。从植物中提取了天然的AHA和ZOA,作为对照进行了凝血活性实验。结果表明重组AHA和ZOA具有和天然蛋白一样的凝血活性。抑菌实验表明,重组DOA2和ZOA能明显抑制小麦赤霉病菌的生长。 马蹄莲、石斛和姜凝集素基因的克隆为深入研究其抗病虫害功能打下了基础,该研究对获得更多具有自主知识产权的功能基因、为利用基因工程技术改良农作物抗病
(2)本文研究方法
调查法:该方法是有目的、有系统的搜集有关研究对象的具体信息。
观察法:用自己的感官和辅助工具直接观察研究对象从而得到有关信息。
实验法:通过主支变革、控制研究对象来发现与确认事物间的因果关系。
文献研究法:通过调查文献来获得资料,从而全面的、正确的了解掌握研究方法。
实证研究法:依据现有的科学理论和实践的需要提出设计。
定性分析法:对研究对象进行“质”的方面的研究,这个方法需要计算的数据较少。
定量分析法:通过具体的数字,使人们对研究对象的认识进一步精确化。
跨学科研究法:运用多学科的理论、方法和成果从整体上对某一课题进行研究。
功能分析法:这是社会科学用来分析社会现象的一种方法,从某一功能出发研究多个方面的影响。
模拟法:通过创设一个与原型相似的模型来间接研究原型某种特性的一种形容方法。
石斛凝集素论文参考文献
[1].朱梦丽.铁皮石斛甘露糖结合凝集素的分子建模与对接研究,及NAC基因组序列的克隆[D].西南交通大学.2015
[2].陈中海.马蹄莲、石斛和姜凝集素基因的克隆及分析[D].复旦大学.2004