(R)-羟基苯乙酮还原酶与甲酸脱氢酶基因在大肠杆菌中的共表达

(R)-羟基苯乙酮还原酶与甲酸脱氢酶基因在大肠杆菌中的共表达

论文摘要

生物催化的不对称还原反应中,辅酶不能循环使用是限制其工业化应用的“瓶颈”因素。全细胞可以通过自身代谢为反应提供一定量的辅酶,但按照化学当量平衡,当底物浓度提高,反应所需的辅酶量增加时,辅酶的供给就成为主要的限制因素。本文根据大肠杆菌对密码子的偏好性,对近平滑假丝酵母(Candida parapsilosis CCTCC M203011)的(R)-羟基苯乙酮还原酶基因rcr进行了密码子优化。用PCR的方法从博伊丁假丝酵母(Candida boidinii)基因组中扩增出甲酸脱氢酶基因fdh,将两个基因克隆构建到共表达载体pETDuetTM-1后,转化稀有密码子优化型菌株E. coli Rosetta,实现了(R)-羟基苯乙酮还原酶和甲酸脱氢酶基因的高效共表达。以高浓度(5 g/L)的2-羟基苯乙酮和适量的甲酸钠为底物,0.1 g重组菌细胞催化产生(R)-苯基乙二醇,进行了不对称还原反应条件的选择,为基因工程法生物合成(R)-苯基乙二醇的工业应用奠定了基础。主要研究结果包括:(1)以实验室保藏的C. parapsilosis基因组为模板,根据(R)-羟基苯乙酮还原酶基因序列和大肠杆菌密码子的偏好性,设计引物Rcr-F1和Rcr-R1,Rcr-F2和Rcr-R2,以及Rcr-F3和Rcr-R2,用PCR的方法扩增出目的基因rcr的前半段(约800 bp)和后半段(约200 bp),然后用重叠延伸PCR(splicing overlapping extension-PCR , SOE-PCR)的方法连接两段基因获得密码子优化后的全长基因rcr。将rcr克隆到pMD19-T载体中,获得重组质粒T-rcr,测序结果表明rcr序列全长为1011 bp,编码336个氨基酸。(2)以实验室保藏的C. boidinii基因组为模板,根据已报道的C. boidinii的fdh基因序列(Accession No. AJ011046),利用DNAMAN软件设计引物Fdh-F和Fdh-R,PCR法扩增出基因fdh后连接到pMD19-T载体中,获得重组质粒T-fdh,测序结果表明rcr基因全长为1095 bp,编码364个氨基酸。(3)将rcr与fdh基因同时构建到共表达质粒pETDuetTM-1中,获得重组质粒pETDuet-rcr-fdh。将重组表达质粒转化密码子优化型菌株E. coli Rosseta,获得(R)-羟基苯乙酮还原酶和甲酸脱氢酶基因的共表达阳性克隆。经30℃,1 mmol/L IPTG诱导8 h,SDS-PAGE结果表明(R)-羟基苯乙酮还原酶和甲酸脱氢酶均有明显表达,其相对分子质量分别为37 kDa和40 kDa。通过摇瓶条件的研究,确定了重组蛋白的最佳诱导条件为:250 mL的三角瓶中装液量20%,培养液的OD600值为0.8开始诱导,诱导温度为30℃,IPTG的浓度为0.8 mmol/L,诱导16 h结束培养。由于引物设计时插入了6×His标签,因而通过Ni2+离子柱亲和层析一步纯化,同时获得了较纯的两种酶蛋白。(4)对重组菌全细胞催化2-羟基苯乙酮不对称还原反应的条件进行了选择,结果表明当底物2-羟基苯乙酮浓度为5 g/L,细胞浓度为10%时,选择最适pH 7.0,最适反应温度35℃,反应时间36 h,产物(R)-苯基乙二醇的光学纯度达到100% e.e.,产率可达74.0%。通过优化反应体系中辅助底物甲酸钠的浓度,并添加适量的ZnSO4,可使产物(R)-苯基乙二醇的光学纯度和产率分别达到100% e.e.和85.9%。

论文目录

  • 摘要
  • Abstract
  • 第一章 绪论
  • 1.1 立题意义
  • 1.2 国内外研究进展
  • 1.2.1 生物法制备光学纯苯基乙二醇的研究现状
  • 1.2.2 利用重组菌合成手性化合物研究进展
  • 1.2.3 辅酶再生的策略
  • 1.2.4 基因的优化表达
  • 1.3 本课题研究思路和内容
  • 1.3.1 课题研究思路
  • 1.3.2 研究方法
  • 1.3.3 研究内容
  • 第二章 密码子优化的(R)-羟基苯乙酮还原酶与甲酸脱氢酶基因的克隆及共表达载体的构建
  • 2.1 前言
  • 2.2 材料
  • 2.2.1 菌株与质粒
  • 2.2.2 主要试剂
  • 2.2.3 培养基与溶液
  • 2.2.4 主要仪器
  • 2.3 实验方法
  • 2.4 结果与讨论
  • 2.4.1 近平滑假丝酵母和博伊丁假丝酵母基因组DNA 的获得
  • 2.4.2 PCR 扩增产物的电泳鉴定
  • 2.4.3 T-rcr、T-fdh 克隆测序质粒的构建与酶切鉴定
  • 2.4.4 rcr 和fdh 基因序列
  • 2.4.5 共表达载体pETDuet-rcr-fdh 的构建
  • 2.5 本章小结
  • 第三章 密码子优化的(R)-羟基苯乙酮还原酶与甲酸脱氢酶共表达的研究及初步纯化
  • 3.1 前言
  • 3.2 材料
  • 3.2.1 菌株与质粒
  • 3.2.2 主要试剂
  • 3.2.3 培养基与溶液
  • 3.2.4 主要仪器
  • 3.3 实验方法
  • 3.4 结果与讨论
  • 3.4.1 质粒pETDuet-rcr-fdh 转化表达菌株E. coli BL21 的结果分析
  • 3.4.2 质粒pETDuet-rcr-fdh 转化表达菌株E. coli Rosetta 的结果分析
  • 3.4.3 共表达条件的选择优化
  • 3.5 本章小结
  • 第四章 重组菌生物转化条件的优化研究
  • 4.1 前言
  • 4.2 材料
  • 4.2.1 菌株与质粒
  • 4.2.2 主要试剂
  • 4.2.3 主要仪器
  • 4.3 实验方法
  • 4.3.1 反应体系中底物2-羟基苯乙酮浓度的选择
  • 4.3.2 反应体系中细胞浓度的选择
  • 4.3.3 反应体系缓冲pH 值的选择
  • 4.3.4 反应温度的选择
  • 4.3.5 反应时间的选择
  • 4.3.6 反应体系中细胞状态的选择
  • 4.3.7 辅助底物甲酸钠的添加量优化
  • 2+对重组菌不对称还原反应的影响'>4.3.8 Zn2+对重组菌不对称还原反应的影响
  • 4.4 结果与讨论
  • 4.5 本章小结
  • 致谢
  • 参考文献
  • 附录:作者在攻读硕士学位期间发表的论文
  • 相关论文文献

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