张月:小黑杨应答叶枯病胁迫基因差异表达论文

张月:小黑杨应答叶枯病胁迫基因差异表达论文

本文主要研究内容

作者张月,韩雅婷,胡号东,廖诗贤,周博如(2019)在《小黑杨应答叶枯病胁迫基因差异表达》一文中研究指出:为揭示小黑杨(Populus simonii×P. nigra)在叶枯病病原菌(Alternaria alternata)胁迫下基因差异表达情况,以叶枯病病原菌接种叶片处理组,以无菌PDA培养基处理为对照组,用Illumina Hi Seq测序平台对来自小黑杨叶片的RNA进行测序。结果表明:共得到551个差异表达基因,对差异表达基因进行功能注释并整理分类,获得112个编码酶类的基因,116个编码蛋白的基因。通过与GO数据库比对,其中38个差异表达基因属于生物过程,有333个差异表达基因属于分子功能,有11个差异表达基因属于细胞组分。通过与KEGG数据库进行比对,获得14条代谢通路。与TFDB数据库比对,发现27个转录因子,属于14个转录因子家族。

Abstract

wei jie shi xiao hei yang (Populus simonii×P. nigra)zai xie ku bing bing yuan jun (Alternaria alternata)xie pai xia ji yin cha yi biao da qing kuang ,yi xie ku bing bing yuan jun jie chong xie pian chu li zu ,yi mo jun PDApei yang ji chu li wei dui zhao zu ,yong Illumina Hi Seqce xu ping tai dui lai zi xiao hei yang xie pian de RNAjin hang ce xu 。jie guo biao ming :gong de dao 551ge cha yi biao da ji yin ,dui cha yi biao da ji yin jin hang gong neng zhu shi bing zheng li fen lei ,huo de 112ge bian ma mei lei de ji yin ,116ge bian ma dan bai de ji yin 。tong guo yu GOshu ju ku bi dui ,ji zhong 38ge cha yi biao da ji yin shu yu sheng wu guo cheng ,you 333ge cha yi biao da ji yin shu yu fen zi gong neng ,you 11ge cha yi biao da ji yin shu yu xi bao zu fen 。tong guo yu KEGGshu ju ku jin hang bi dui ,huo de 14tiao dai xie tong lu 。yu TFDBshu ju ku bi dui ,fa xian 27ge zhuai lu yin zi ,shu yu 14ge zhuai lu yin zi jia zu 。

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自东北林业大学学报的张月,韩雅婷,胡号东,廖诗贤,周博如,发表于刊物东北林业大学学报2019年07期论文,是一篇关于小黑杨论文,叶枯病论文,转录组论文,高通量测序论文,差异表达基因论文,东北林业大学学报2019年07期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自东北林业大学学报2019年07期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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