山羊肉用性能候选基因遗传分析及生长发育性状QTL定位

山羊肉用性能候选基因遗传分析及生长发育性状QTL定位

论文题目: 山羊肉用性能候选基因遗传分析及生长发育性状QTL定位

论文类型: 博士论文

论文专业: 动物遗传育种与繁殖

作者: 闵令江

导师: 陈宏,潘庆杰

关键词: 山羊,肉用性能,遗传分析,微卫星,定位

文献来源: 西北农林科技大学

发表年度: 2005

论文摘要: 本研究以波尔山羊及其杂交后代、鲁北白山羊、文登奶山羊、崂山奶山羊共501 个个体为实验材料,利用PCR-RFLP、PCR-SSCP、微卫星、DNA序列分析等技术,对山羊群体遗传结构、遗传多态性及其与体重、体尺和屠体性状的关系及前期生长发育性状在1 号染色体的QTL 定位情况做了分析和探讨,旨在获得相应的分子遗传学信息,找到经济性状的分子标记或QTL 信息,为山羊遗传资源的保护与利用、分子标记辅助育种的开展和山羊生产性能的大幅提高提供科学依据。1 山羊GH (生长激素) 基因F1/R1 位点多态性及其与肉用性能的关系(1)波尔山羊及其杂交后代在该位点上处于非Hardy-Weinberg平衡状态,其等位基因A 频率比B 的高,而三个地方品种处于Hardy-Weinberg 平衡状态,且等位基因B的频率比A 高。同时,基因型分布与群体有关(P<0.01)。(2)该位点对初生重、断奶重有极显著遗传效应(P<0.01):AA 基因型均极显著地大于BB 型;基因型对3、10 和12 月龄体高和3 月龄体长有显著或极显著影响,基因型之间有显著差异,并且在以上6 个指标上总体表现为AA>AB>BB。基因型与胴体重、后躯肉重有关(P<0.05):均表现为AB 型显著高于AA 型(P<0.05)。2 山羊IGFBP-3 (胰岛素样生长因子-Ⅰ结合蛋白3) 基因多态性及其与肉用性能的相关分析(1)经分析,山羊IGFBP-3 基因F4/R4 位点包括部分exon2、完整intron2 和exon3及部分intron3。该位点上肉用山羊与奶山羊、绵羊、奶牛、猪、小鼠和人类的同源性依次为99.1%、98.1%、94.1%、79.0%、34.4%和54.1%,4 种反刍动物之间非常保守。(2)Intron2 内的A? G转换导致7 个群体均产生XspⅠ多态,表现3 种基因型,均以AG型个体数最多,以GG为最少,但均处于Hardy-Weinberg平衡状态,且基因型分布与品种或群体无关(P>0.05)。等位基因A频率均高于G,且A和G在每个群体中基本稳定。(3)该位点与3 月、10 月龄体长和胸围、12 月龄体长、断奶重和眼肌面积有关:在体尺上,均表现为AG 极显著地大于GG (P<0.01),在数值上均遵循AG>AA>GG。在断奶重和眼肌面积上,则有AG 型显著大于GG 型(P<0.05),且也有AG>AA>GG规律。3 山羊GH 基因F2/R2 位点多态性及其与肉用性能的关系

论文目录:

中文摘要

英文摘要

文献综述

第一章 畜禽主要肉用性状候选基因的研究进展

1.1 生长激素(GH)基因的研究进展

1.1.1 生长激素的主要生物学功能

1.1.2 生长激素基因的结构特征

1.1.3 GH 基因与畜禽生产性能的关系

1.1.4 结语

1.2 IGFs 及 IGFBP-3 基因的研究进展

1.2.1 IGFs 及 IGFBP-3 的生物学功能

1.2.2 IGFs 及 IGFBP-3 基因多态性及其与畜禽生产性状的关系

1.2.3 小结

1.3 肌肉生长抑制素(Myostatin,MSTN,GDF-8)的研究进展

1.3.1 肌肉生长抑制素的生物学功能

1.3.2 MSTN 基因的组织表达

1.3.3 MSTN 基因抑制生长的作用机制

1.3.4 MSTN 基因的保守性

1.3.5 MSTN 基因及其与畜禽肉用性能的关系

1.3.6 小结

1.4 TGF-βs 及其对生长性状影响的研究进展

1.5 结束语

第二章 畜禽数量性状的QTL 定位研究进展

2.1 QTL定位的概念

2.2 QTL定位的基本原理

2.3 QTL定位的常用方法

2.3.1 单标记分析法

2.3.2 区间定位法(IM)

2.3.3 复合区间定位法(CIM)

2.4 QTL定位的常用软件

2.5 小家畜QTLs 定位的研究进展

2.5.1 绵、山羊连锁图谱

2.5.2 猪的连锁图谱

2.5.3 绵、山羊生产性状QTLs 定位

2.5.4 猪肉用性状QTLs 定位

2.6 结语

试验研究

第三章 山羊主要肉用性状候选基因RFLP 标记的遗传分析

3.1 材料与方法

3.1.1 实验材料

3.1.2 实验方法

3.1.3 统计分析方法

3.2 结果与分析

3.2.1 山羊基因组DNA 检测

3.2.2 山羊GH 基因F1/R1 位点结果与分析

3.2.3 山羊IGFBP-3 基因F4/R4 位点结果与分析

3.2.4 山羊myostatin 基因5'调控区F5/R5 位点结果与分析

3.3 讨论

3.3.1 PCR-RFLP 技术

3.3.2 序列分析技术

3.3.3 有关试验设计、采样和数据处理的说明

3.3.4 有关山羊GH 基因F1/R1 位点的讨论

3.3.5 有关山羊IGFBP-3 基因F4/R4 位点的讨论

3.3.6 关于山羊myostatin基因的问题

第四章 山羊主要肉用性状候选基因的SSCP分析

4.1 材料与方法

4.1.1 实验材料

4.1.2 实验方法

4.1.3 统计分析方法

4.2 结果与分析

4.2.1 山羊GH 基因5'侧翼区F2/R2 位点的结果与分析

4.2.2 山羊GH 基因F3/R3 位点结果与分析

4.2.3 山羊myostatin 基因F6/R6 位点(ex0113)结果与分析

4.2.4 山羊TGF-β3 基因F7/R7 位点结果与分析

4.3 讨论

4.3.1 关于PCR-SSCP 技术

4.3.2 有关gGH 基因F2/R2 位点的讨论

4.3.3 关于gGH 基因F3/R3 位点结果的探讨

4.3.4 关于山羊myostatin基因5'调控区和外显子3 的讨论

第五章 山羊1号染色体生长发育性状QTL 定位研究

5.1 材料与方法

5.1.1 实验材料

5.1.2 实验方法

5.2 结果与分析

5.2.1 山羊Chr.1遗传连锁图谱

5.2.2 山羊前期体重性状QTL 的CIM 定位

5.2.3 山羊体尺性状QTL 的CIM 定位

5.2.4 山羊前期生长发育形状QTL 的MIM 定位

5.3 讨论

5.3.1 影响QTL 定位的主要因素

5.3.2 关于山羊1 号染色体上的QTLs

5.3.3 关于多因一效、一因多效、调控或表达时序及基因连锁等问题的探讨

5.3.4 QTL 定位存在的问题

5.3.5 QTL育种展望

结论及本文创新点

致谢

参考文献

附录一

附录二

发布时间: 2005-12-22

参考文献

  • [1].山羊胚胎体外培养体系的优化以及胚胎干细胞分离培养技术的研究[D]. 吕丽华.山西农业大学2004
  • [2].山羊肌肉生长抑制素基因多态性及其与生产性能相关性研究[D]. 刘铮铸.内蒙古农业大学2006

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  • [5].中国中西部9个地方绵羊品种mtDNA遗传多样性与系统进化研究[D]. 王昕.西北农林科技大学2005
  • [6].山羊肌肉生长抑制素基因多态性及其与生产性能相关性研究[D]. 刘铮铸.内蒙古农业大学2006
  • [7].凉山半细毛羊QTL定位初步研究[D]. 李辉.四川农业大学2006
  • [8].黄牛生长性能候选基因多态及其与生长发育相关性研究[D]. 杨东英.西北农林科技大学2006

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