本文主要研究内容
作者谢晨晓（2019）在《中国落叶松-杨栅锈菌SSR遗传多样性分析及特异性DNA标记开发》一文中研究指出：落叶松-杨栅锈菌(Melampsora larici-populina,简称MLP)是一种在世界范围内广泛传播并产生严重危害的转主寄生真菌,主要分布在我国西北、东北、华北等地区,危害青杨派、黑杨派及其杂交种等多种杨树。该菌繁殖速度快,群体数量大,致病性变异频率高,遗传现象复杂。为深入了解该菌群体分化现状,本研究利用微卫星(SSR)分子标记对63个落叶松-杨栅锈菌菌系进行遗传多样性分析,主要研究结果如下:(1)从27对引物中筛选出了10对多态性较好的引物,共检测到98个等位基因,其中MLP4、MLP12、MLP43引物分别检测到13个等位基因,MLP57检测到6个等位基因。平均观察等位基因数(Na)9.8000,平均有效等位基因(Ne)5.9878。菌系总体遗传多样性较高,基因型丰富,平均观测杂合度0.4109,平均期望杂合度0.8267,10个位点中有7个近交系数为正值,亲代群体的杂合体数目偏少,整体纯合体偏多。(2)11个MLP菌群间平均遗传分化系数(Fst)为0.3505,遗传分化的水平总体较高,群体间的基因型多样。菌系群体间平均基因流0.4634,有8个位点基因流Nm<1,表明基因流受到部分阻碍。不同地区菌群遗传多样性存在差异,Shannon’s多样性指数(I)最低的是江苏菌群(Pop11)为0.2971,最高是秦岭火地塘菌群(Pop3)为1.7332。(3)基于Nei’s遗传距离构建的UPGMA聚类树将11个地理群划分为6个类群,秦岭火地塘菌群为其他地理群的基部群。63个菌系的UPGMA聚类显示,落叶松-杨栅锈菌群体分化和菌系地理来源相关。关中菌群可能来源于秦岭天台山菌系,四川菌群来源于秦岭厚畛子,其他复合菌群可能源自杨树种苗调运,但都和秦岭菌系有关系。(4)筛选并克隆了陕西关中菌群所在类群(Group5)和秦岭火地塘菌群所在类群(Group6)的特异性DNA片段,将其开发为共显性标记,并对灵敏性进行测定,检测的DNA最低浓度为5 ng/μL,该研究为区别两地菌群、并监测该地区菌系的分布、变异、流行特征奠定了基础。
Abstract
la xie song -yang shan xiu jun (Melampsora larici-populina,jian chen MLP)shi yi chong zai shi jie fan wei nei an fan chuan bo bing chan sheng yan chong wei hai de zhuai zhu ji sheng zhen jun ,zhu yao fen bu zai wo guo xi bei 、dong bei 、hua bei deng de ou ,wei hai qing yang pa 、hei yang pa ji ji za jiao chong deng duo chong yang shu 。gai jun fan shi su du kuai ,qun ti shu liang da ,zhi bing xing bian yi pin lv gao ,wei chuan xian xiang fu za 。wei shen ru le jie gai jun qun ti fen hua xian zhuang ,ben yan jiu li yong wei wei xing (SSR)fen zi biao ji dui 63ge la xie song -yang shan xiu jun jun ji jin hang wei chuan duo yang xing fen xi ,zhu yao yan jiu jie guo ru xia :(1)cong 27dui yin wu zhong shai shua chu le 10dui duo tai xing jiao hao de yin wu ,gong jian ce dao 98ge deng wei ji yin ,ji zhong MLP4、MLP12、MLP43yin wu fen bie jian ce dao 13ge deng wei ji yin ,MLP57jian ce dao 6ge deng wei ji yin 。ping jun guan cha deng wei ji yin shu (Na)9.8000,ping jun you xiao deng wei ji yin (Ne)5.9878。jun ji zong ti wei chuan duo yang xing jiao gao ,ji yin xing feng fu ,ping jun guan ce za ge du 0.4109,ping jun ji wang za ge du 0.8267,10ge wei dian zhong you 7ge jin jiao ji shu wei zheng zhi ,qin dai qun ti de za ge ti shu mu pian shao ,zheng ti chun ge ti pian duo 。(2)11ge MLPjun qun jian ping jun wei chuan fen hua ji shu (Fst)wei 0.3505,wei chuan fen hua de shui ping zong ti jiao gao ,qun ti jian de ji yin xing duo yang 。jun ji qun ti jian ping jun ji yin liu 0.4634,you 8ge wei dian ji yin liu Nm<1,biao ming ji yin liu shou dao bu fen zu ai 。bu tong de ou jun qun wei chuan duo yang xing cun zai cha yi ,Shannon’sduo yang xing zhi shu (I)zui di de shi jiang su jun qun (Pop11)wei 0.2971,zui gao shi qin ling huo de tang jun qun (Pop3)wei 1.7332。(3)ji yu Nei’swei chuan ju li gou jian de UPGMAju lei shu jiang 11ge de li qun hua fen wei 6ge lei qun ,qin ling huo de tang jun qun wei ji ta de li qun de ji bu qun 。63ge jun ji de UPGMAju lei xian shi ,la xie song -yang shan xiu jun qun ti fen hua he jun ji de li lai yuan xiang guan 。guan zhong jun qun ke neng lai yuan yu qin ling tian tai shan jun ji ,si chuan jun qun lai yuan yu qin ling hou zhen zi ,ji ta fu ge jun qun ke neng yuan zi yang shu chong miao diao yun ,dan dou he qin ling jun ji you guan ji 。(4)shai shua bing ke long le shan xi guan zhong jun qun suo zai lei qun (Group5)he qin ling huo de tang jun qun suo zai lei qun (Group6)de te yi xing DNApian duan ,jiang ji kai fa wei gong xian xing biao ji ,bing dui ling min xing jin hang ce ding ,jian ce de DNAzui di nong du wei 5 ng/μL,gai yan jiu wei ou bie liang de jun qun 、bing jian ce gai de ou jun ji de fen bu 、bian yi 、liu hang te zheng dian ding le ji chu 。
论文参考文献
论文详细介绍
论文作者分别是来自西北农林科技大学的谢晨晓，发表于刊物西北农林科技大学2019-07-11论文，是一篇关于落叶松杨栅锈菌论文,标记论文,遗传多样性论文,特异性条带论文,西北农林科技大学2019-07-11论文的文章。本文可供学术参考使用，各位学者可以免费参考阅读下载，文章观点不代表本站观点，资料来自西北农林科技大学2019-07-11论文网站，若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权，请联系我们删除。
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