胡忠昌:延黄牛ALDH1A1基因CDS序列克隆及其在各组织中的表达差异研究论文

胡忠昌:延黄牛ALDH1A1基因CDS序列克隆及其在各组织中的表达差异研究论文

本文主要研究内容

作者胡忠昌,曹阳,吴健,秦立红,金海国,赵玉民(2019)在《延黄牛ALDH1A1基因CDS序列克隆及其在各组织中的表达差异研究》一文中研究指出:为探索乙醛脱氢酶1A1(acetaldehyde dehydrogenase 1A1,ALDH1A1)基因功能,本试验以16月龄延黄牛母牛为研究对象,屠宰后采集心脏、肝脏、肺脏、肾脏、胃、十二指肠、皮下脂肪和背最长肌,提取总RNA。根据GenBank上公布的牛ALDH1A1基因mRNA序列(登录号:NM174239.2),利用Oligo 7.0软件设计引物,应用RTPCR扩增ALDH1A1基因,将扩增产物连接pMD18-T载体进行克隆测序,获得延黄牛ALDH1A1基因完整CDS序列,应用生物信息学软件分析核苷酸序列及其蛋白结构。以延黄牛不同组织总RNA为模板,通过实时荧光定量PCR技术检测ALDH1A1基因在延黄牛各组织间的表达差异。结果显示,ALDH1A1基因CDS序列全长1 506bp,编码501个氨基酸;延黄牛ALDH1A1基因序列与野牛、牛的同源性最高(≥99.7%),与猫和豹的同源性分别为89.4%和89.6%,符合物种进化规律。ALDH1A1蛋白分子质量为54.805ku,理论等电点为7.16,亲水性较强,占86.4%,酸性氨基酸和碱性氨基酸分别占11.4%和12.2%,属于可溶性蛋白,但不是分泌性蛋白,无典型信号肽切割位点;存在31个氨基酸磷酸化位点(分值>0.5)。延黄牛ALDH1A1蛋白二级结构含有α-螺旋、延伸链、β-转角和无规则卷曲,分别占42.12%、16.17%、8.18%和33.53%,与该蛋白三级结构预测结果相同。实时荧光定量PCR结果表明,ALDH1A1基因在延黄牛肝脏、胃、皮下脂肪、十二指肠和肾脏组织中极显著表达(P<0.01);在背最长肌中显著表达(P<0.05)。本试验结果为进一步开展延黄牛ALDH1A1基因功能及肉质基因筛选研究提供了参考依据。

Abstract

wei tan suo yi quan tuo qing mei 1A1(acetaldehyde dehydrogenase 1A1,ALDH1A1)ji yin gong neng ,ben shi yan yi 16yue ling yan huang niu mu niu wei yan jiu dui xiang ,tu zai hou cai ji xin zang 、gan zang 、fei zang 、shen zang 、wei 、shi er zhi chang 、pi xia zhi fang he bei zui chang ji ,di qu zong RNA。gen ju GenBankshang gong bu de niu ALDH1A1ji yin mRNAxu lie (deng lu hao :NM174239.2),li yong Oligo 7.0ruan jian she ji yin wu ,ying yong RTPCRkuo zeng ALDH1A1ji yin ,jiang kuo zeng chan wu lian jie pMD18-Tzai ti jin hang ke long ce xu ,huo de yan huang niu ALDH1A1ji yin wan zheng CDSxu lie ,ying yong sheng wu xin xi xue ruan jian fen xi he gan suan xu lie ji ji dan bai jie gou 。yi yan huang niu bu tong zu zhi zong RNAwei mo ban ,tong guo shi shi ying guang ding liang PCRji shu jian ce ALDH1A1ji yin zai yan huang niu ge zu zhi jian de biao da cha yi 。jie guo xian shi ,ALDH1A1ji yin CDSxu lie quan chang 1 506bp,bian ma 501ge an ji suan ;yan huang niu ALDH1A1ji yin xu lie yu ye niu 、niu de tong yuan xing zui gao (≥99.7%),yu mao he bao de tong yuan xing fen bie wei 89.4%he 89.6%,fu ge wu chong jin hua gui lv 。ALDH1A1dan bai fen zi zhi liang wei 54.805ku,li lun deng dian dian wei 7.16,qin shui xing jiao jiang ,zhan 86.4%,suan xing an ji suan he jian xing an ji suan fen bie zhan 11.4%he 12.2%,shu yu ke rong xing dan bai ,dan bu shi fen bi xing dan bai ,mo dian xing xin hao tai qie ge wei dian ;cun zai 31ge an ji suan lin suan hua wei dian (fen zhi >0.5)。yan huang niu ALDH1A1dan bai er ji jie gou han you α-luo xuan 、yan shen lian 、β-zhuai jiao he mo gui ze juan qu ,fen bie zhan 42.12%、16.17%、8.18%he 33.53%,yu gai dan bai san ji jie gou yu ce jie guo xiang tong 。shi shi ying guang ding liang PCRjie guo biao ming ,ALDH1A1ji yin zai yan huang niu gan zang 、wei 、pi xia zhi fang 、shi er zhi chang he shen zang zu zhi zhong ji xian zhe biao da (P<0.01);zai bei zui chang ji zhong xian zhe biao da (P<0.05)。ben shi yan jie guo wei jin yi bu kai zhan yan huang niu ALDH1A1ji yin gong neng ji rou zhi ji yin shai shua yan jiu di gong le can kao yi ju 。

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自中国畜牧兽医的胡忠昌,曹阳,吴健,秦立红,金海国,赵玉民,发表于刊物中国畜牧兽医2019年01期论文,是一篇关于延黄牛论文,乙醛脱氢酶基因论文,克隆论文,表达差异论文,生物信息学论文,中国畜牧兽医2019年01期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自中国畜牧兽医2019年01期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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