家兔FGF5基因外显子Ⅰ和Ⅲ多态性研究及其与生产性能相关分析

论文摘要

本实验选取年龄相近的青年荥经长毛兔、天府黑兔和加利福尼亚兔为实验材料，通过PCR产物直接测序法分析FGF5基因外显子Ⅰ和Ⅲ的遗传效应，及其与毛兔的产毛量、肉兔的屠宰性能的相关性。结果表明：FGF5基因外显子Ⅰ和Ⅲ中共发现了3个多态性位点，在外显子Ⅰ的TCT位点，毛兔中A基因的频率为0.800，是优势基因，肉兔中B基因的频率为0.900～0.950，是优势基因；在外显子Ⅲ的位点1，毛兔中C基因的频率为0.750，是优势基因，肉兔中T基因的频率为0.775～0.825，是优势基因；在外显子Ⅲ的位点2，毛兔中T基因的频率为0.600，是优势基因，肉兔中T基因的频率为0.575～0.650，是优势基因。FGF5基因外显子Ⅰ的TCT位点，平均PIC值为0.174，属低度多态性；FGF5基因外显子Ⅲ位点1的PIC为0.280，FGF5基因外显子Ⅲ位点2的PIC为0.363，均属中度多态性。相关性分析结果表明：荥经长毛兔11月份体重与11月份剪毛量间达极显著正相关水平(P＜0.01)，11月份体重与1月份体重间达极显著正相关水平(P＜0.01)，11月份剪毛量与1月份体重间达极显著正相关水平(P＜0.01)，1月份体重与1月份剪毛量间达极显著正相关水平(P＜0.01)。最小二乘分析FGF5基因各位点与生产性状间的相关性结果显示：FGF5基因的外显子Ⅰ的TCT位点对荥经长毛兔剪毛体重、产毛量及饲料转化率的影响不显著。FGF5基因外显子Ⅲ中位点1的CC基因型个体11月份剪毛量极显著高于TT基因型个体11月份剪毛量(P＜0.01)，TC基因型个体的1月份剪毛体重显著高于TT基因型1月份剪毛体重(P＜0.05)，CC基因型个体的1月份剪毛量极显著高于TT基因型个体1月份剪毛量(P＜0.01)；FGF5基因外显子Ⅲ位点2两种基因型中TC基因型个体11月份及1月份剪毛量均显著高于TT基因型个体(P＜0.05)。FGF5基因外显子Ⅰ和Ⅲ对天府黑兔和加利福尼亚兔屠宰率、熟肉率、贮水损失及饲料转化率的影响差异均不显著(P＞0.05)。对FGF5基因外显子Ⅰ和Ⅲ的遗传效应及其与长毛兔的产毛量、肉兔的屠宰性能的相关性分析表明：FGF5基因主要影响产毛量，可以做为长毛兔产毛性状连锁分析的候选遗传标记，并且本研究为其他产毛动物在研究FGF5基因与产毛性状间的相关性上提供了理论依据。

论文目录

• 摘要
• ABSTRACT
• 1 文献综述
• 1.1 成纤维细胞生长因子
• 1.2 成纤维细胞生长因子5（FGF5）基因概述
• 1.3 安哥拉鼠的发现及特征
• 1.4 GO基因就是FGF5基因的突变等位基因的证明
• 1.5 FGF5基因在不同动物中的研究
• 1.5.1 FGF5基因在羊上的研究
• 1.5.2 FGF5基因在鼠上的研究
• 1.5.3 FGF5基因在兔上的研究
• 1.6 家兔分子遗传研究现状
• 1.7 兔毛的特殊结构及其发生
• 1.7.1 兔毛的特殊结构及优缺点
• 1.7.2 兔毛的发生
• 1.8 影响长毛兔产毛性状的研究进展
• 1.8.1 影响长毛兔产毛量的因素
• 1.8.2 分子遗传方面对产毛性状影响的研究进展
• 1.9 本项研究的目的意义
• 2 材料和方法
• 2.1 血样的采集
• 2.2 生产数据的采集及测定
• 2.3 主要仪器设备和试剂
• 2.3.1 主要仪器设备
• 2.3.2 主要实验试剂
• 2.3.3 实验溶液的配制
• 2.4 引物的设计与合成
• 2.5 技术路线
• 2.6 全基因组DNA的提取及浓度和纯度的测定
• 2.6.1 基因组DNA的提取
• 2.6.2 DNA浓度及纯度的测定
• 2.7 FGF5基因的PCR扩增
• 2.8 PCR产物测序
• 2.9 统计分析
• 2.10 数据统计及处理
• 2.10.1 基因频率和基因型频率的计算
• 2.10.2 多态信息含量
• 2.10.3 计算各种基因型个体在不同品种的分布
• 3 结果与分析
• 3.1 模板DNA的抽提结果
• 3.2 FGF5基因的PCR扩增结果
• 3.2.1 外显子I的PCR扩增结果
• 3.2.2 外显子III的PCR扩增结果
• 3.3 家兔FGF5基因外显子I和外显子III各基因型的确定
• 3.4 基因型和基因频率
• 3.4.1 外显子I TCT位点基因型和基因频率在不同品种间分布
• 3.4.2 外显子III各位点基因型和基因频率在不同品种间的分布
• 3.5 各位点多态信息含量（PIC）
• 3.6 荥经长毛兔各生产性状间的相关分析
• 3.7 各基因型与荥经长毛兔生产性状间的相关分析
• 3.7.1 外显子I TCT位点各基因型与生产性状间的相关分析
• 3.7.3 外显子III位点2各基因型与生产性状间的相关分析
• 3.8 各基因型与天府黑兔、加利福尼亚兔生产性状间的相关分析
• 3.8.1 外显子I TCT位点各基因型与生产性状间的相关分析
• 3.8.2 外显子III位点1各基因型与生产性状间的相关分析
• 3.8.3 外显子III位点2各基因型与生产性状间的相关分析
• 4 讨论
• 4.1 直接测序的优越性
• 4.2 突变位点的筛选及基因型的判别
• 4.3 兔FGF5基因各位点基因型的分布
• 4.4 基因型频率处于H-W非平衡状态的原因
• 4.5 各位点的多态信息含量（PIC）分析
• 4.6 荥经长毛兔生产性状间相关分析
• 4.7 各位点与生产性状间的相关分析
• 5 结论
• 6 参考文献
• 致谢
• 在校期间所发表的论文