李裕思:16S rRNA基因测序分析肝阳脑出血患者肠道菌群结构论文

李裕思:16S rRNA基因测序分析肝阳脑出血患者肠道菌群结构论文

本文主要研究内容

作者李裕思,许华冲,王俊月,郑凡超,邓力,黎敬波,陈龙娇,袁淮涛,陈孝银(2019)在《16S rRNA基因测序技术分析肝阳上亢型脑出血患者的肠道菌群结构》一文中研究指出:目的:探讨肝阳上亢型急性脑出血患者与健康人群的肠道菌群差异。方法:选取2018年于广州中医药大学第一附属医院颅脑科病房收治的9例肝阳上亢型急性脑出血患者的粪便样本为观察组,同时,选取体检的6例健康人粪便样本为对照组,提取两组样本中细菌总DNA,根据16S rRNA V4区设计引物进行扩增,通过Illumina MiSeq平台进行双端测序(paired-end),通过生物信息分析软件对测序结果进行分析,比较两组样本菌群组成和结构。结果:操作分类单元(OTU)的韦恩图分析(Venn分析)显示观察组与对照组之间OTU数目存在明显差异。偏最小二乘法-判别分析(PLS-DA)显示肝阳上亢型急性脑出血患者与健康人在肠道菌群组成上具有明显差异。物种及其丰度分析上,门分类水平上观察组厚壁菌门与拟杆菌门的相对丰度比值(F/B)较正常组明显增加,其中疣微菌门的相对丰度明显低于对照组(P <0. 05)。属分类水平上,两组的普雷沃氏菌属、拟杆菌属、阿克曼氏菌属、布劳特氏菌属、氨基酸球菌属相对丰度差异有统计学意义(P <0. 05,P <0. 01),其中观察组拟杆菌属和普雷沃氏菌属的相对丰度比值(B/P)显著高于对照组。种分类水平上两组在普氏菌、阿克曼粘细菌、卵形拟杆菌、脆弱拟杆菌、伶俐瘤胃球菌上具有明显差异(P <0. 05,P <0. 01)。主坐标分析显示两组样本被显著分开,说明两组样本菌群结构存在显著差异。结论:肝阳上亢型急性脑出血与肠道菌群结构紊乱有关,其中普氏菌和阿克曼粘细菌的相对丰度下降是其发生的主要原因。

Abstract

mu de :tan tao gan yang shang kang xing ji xing nao chu xie huan zhe yu jian kang ren qun de chang dao jun qun cha yi 。fang fa :shua qu 2018nian yu an zhou zhong yi yao da xue di yi fu shu yi yuan lu nao ke bing fang shou zhi de 9li gan yang shang kang xing ji xing nao chu xie huan zhe de fen bian yang ben wei guan cha zu ,tong shi ,shua qu ti jian de 6li jian kang ren fen bian yang ben wei dui zhao zu ,di qu liang zu yang ben zhong xi jun zong DNA,gen ju 16S rRNA V4ou she ji yin wu jin hang kuo zeng ,tong guo Illumina MiSeqping tai jin hang shuang duan ce xu (paired-end),tong guo sheng wu xin xi fen xi ruan jian dui ce xu jie guo jin hang fen xi ,bi jiao liang zu yang ben jun qun zu cheng he jie gou 。jie guo :cao zuo fen lei chan yuan (OTU)de wei en tu fen xi (Vennfen xi )xian shi guan cha zu yu dui zhao zu zhi jian OTUshu mu cun zai ming xian cha yi 。pian zui xiao er cheng fa -pan bie fen xi (PLS-DA)xian shi gan yang shang kang xing ji xing nao chu xie huan zhe yu jian kang ren zai chang dao jun qun zu cheng shang ju you ming xian cha yi 。wu chong ji ji feng du fen xi shang ,men fen lei shui ping shang guan cha zu hou bi jun men yu ni gan jun men de xiang dui feng du bi zhi (F/B)jiao zheng chang zu ming xian zeng jia ,ji zhong you wei jun men de xiang dui feng du ming xian di yu dui zhao zu (P <0. 05)。shu fen lei shui ping shang ,liang zu de pu lei wo shi jun shu 、ni gan jun shu 、a ke man shi jun shu 、bu lao te shi jun shu 、an ji suan qiu jun shu xiang dui feng du cha yi you tong ji xue yi yi (P <0. 05,P <0. 01),ji zhong guan cha zu ni gan jun shu he pu lei wo shi jun shu de xiang dui feng du bi zhi (B/P)xian zhe gao yu dui zhao zu 。chong fen lei shui ping shang liang zu zai pu shi jun 、a ke man nian xi jun 、luan xing ni gan jun 、cui ruo ni gan jun 、ling li liu wei qiu jun shang ju you ming xian cha yi (P <0. 05,P <0. 01)。zhu zuo biao fen xi xian shi liang zu yang ben bei xian zhe fen kai ,shui ming liang zu yang ben jun qun jie gou cun zai xian zhe cha yi 。jie lun :gan yang shang kang xing ji xing nao chu xie yu chang dao jun qun jie gou wen luan you guan ,ji zhong pu shi jun he a ke man nian xi jun de xiang dui feng du xia jiang shi ji fa sheng de zhu yao yuan yin 。

论文参考文献

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  • 论文详细介绍

    论文作者分别是来自中国实验方剂学杂志的李裕思,许华冲,王俊月,郑凡超,邓力,黎敬波,陈龙娇,袁淮涛,陈孝银,发表于刊物中国实验方剂学杂志2019年08期论文,是一篇关于基因测序技术论文,肝阳上亢论文,急性脑出血论文,菌群结构论文,肠道菌群论文,韦恩分析论文,物种水平论文,中国实验方剂学杂志2019年08期论文的文章。本文可供学术参考使用,各位学者可以免费参考阅读下载,文章观点不代表本站观点,资料来自中国实验方剂学杂志2019年08期论文网站,若本站收录的文献无意侵犯了您的著作版权,请联系我们删除。

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