鲁西牛、渤海黑牛及闽南牛亲缘关系与系统地位的研究

论文摘要

应用中心产区典型群内简单随机抽样方法和多种电泳技术检测90头鲁西牛、45头渤海黑牛、60头闽南牛和30头荷斯坦牛21个结构基因座上的变异,引用国内外14个牛群体7个基因座位的相同资料,探讨其遗传分化、亲缘关系和系统地位。研究表明:1.在所检测的21个血液蛋白基因座中,闽南牛有10个座位存在多型,鲁西牛有9个座位存在多型,渤海黑牛9个座位存在多型。鲁西牛、渤海黑牛和闽南牛结构基因座平均杂合度(He)分别为0.1416、0.1767和0.1539,平均多态信息含量(PIC)分别为0.1258、0.1601和0.1406,平均有效等位基因数(MNA)分别为1.3130、1.3977和1.2899。2.四个牛群体总群体近交系数(Fit)为0.601,群体内近交系数(Fis)为0.397,均达到极显著水平(p<0.01),群体间遗传分化较明显,36.3%的遗传变异来源于群体间,而63.7%的遗传变异是由于各群体内个体间的差异引起的。每世代群体间有效迁移个体数(Nem)从0.2002(鲁西牛与荷斯坦牛)到7.7118(鲁西牛与渤海黑牛)不等,这一结果与群体的地理分布事实基本符合。3.以荷斯坦牛为对照组,计算四个群体间标准遗传距离和DA遗传距离,进行NJ和UPGMA聚类。鲁西牛和渤海黑牛亲缘关系较近,首先聚为一类,其次于与闽南牛聚为一类,最后和荷斯坦牛。同时,以上四个牛群体10个多态座位的基因频率为基础,引用国内外14个牛群体7个基因座位的相同资料,构建、合成描述群体间遗传相似性的模糊等价关系矩阵,对18个群体进行亲缘关系聚类,结果表明:鲁西牛群体和渤海黑牛群体的亲缘关系较近。经典聚类和模糊聚类结果吻合。4.搜集国内外14个牛品种资料,运用模式判别揭示鲁西牛、渤海黑牛和闽南牛的血统类别和系统地位。鲁西牛、渤海黑牛和闽南牛群体对于“蒙古利亚”集团的遗传贴近度分别为0.7542、0.7446和0.6160;对于“中间”集团的遗传贴近度分别为0.8568、0.8346和0.7886;对于“南岛”集团的遗传贴近度分别为0.8409、0.8996和0.9305。由此,鲁西牛归属于“中间”集团,渤海黑牛和闽南牛群体归属于“南岛”集团。

论文目录

• 中文摘要
• 英文摘要
• 1. 文献综述
• 1.1 动物种内亲缘关系研究的意义
• 1.2 牛亚科家畜的分类
• 1.3 中国黄牛的起源与驯化
• 1.4 中国牛亚科家畜遗传资源现状
• 1.5 血液蛋白标记的研究进展
• 1.6 本研究涉及的主要分析方法的概述
• 1.6.1 聚类分析的定义
• 1.6.2 聚类分析的分类
• 1.6.3 聚类分析常用分析软件
• 1.6.4 模糊聚类分析
• 1.6.4.1 模糊聚类原理
• 1.6.4.2 一般分析步骤
• 1.6.5 聚类分析在家畜遗传育种中的应用
• 1.6.5.1 揭示多性状之间的关系，指导育种
• 1.6.5.2 揭示品种/群体之间遗传关系、进行系统分类
• 1.6.6 模糊判别的概念和简介
• 1.7 本研究的目的和意义
• 2、材料与方法
• 2.1 实验材料
• 2.1.1 采样
• 2.1.2 主要试剂及设备
• 2.1.2.1 主要药品及试剂
• 2.1.2.2 主要设备
• 2.2 实验方法
• 2.2.1 电泳
• 2.2.2 判型
• 2.3 统计分析
• 2.4 血统模糊性模式判别的理论验证
• 2.5 相关资料的引用
• 3 、结果与分析
• 3.1 鲁西牛﹑渤海黑牛及闽南牛结构基因座基因的频率分布
• 3.2 四个牛群体血液蛋白座位Hardy-Weinberg 平衡检验
• 3.3 群体内遗传变异程度
• 3.4 群体的遗传分化程度
• 3.4.1 F-统计（F-statistics）
• 3.4.2 群体内基因分化系数（Gst）
• 3.4.3 基因流分析结果
• 3.5 群体间标准遗传距离和聚类分析结果
• 3.6 亲缘血型的判别结果
• 3.7 模糊聚类结果
• 4 、讨论
• 4.1 群体内遗传变异
• 4.2 群体间系统关系
• 4.2.1 群体间遗传分化
• 4.2.2 牛亚科家畜的分化时间
• 4.2.3 聚类分析结果与中原黄牛的形成和分化
• 4.3 血液蛋白质多型与系统分类的关系
• 4.4 模糊聚类分析的特点
• 4.5 三个牛群体系统地位的模糊模式判别
• 5、结论
• 参考文献
• 致谢
• 攻读硕士学位期间发表的学术论文目录